R语言入门学习路径+资源集(生信篇)

学习始终是自己的事情，好的资源可以大大缩短路程，如果你还没有入门R语言，又或者你已经入门了R但不知道如何进阶，不妨收藏这篇。

强烈推荐：

这是DataCamp 的联合创始人 Martijn Theuwissen写的7步从零开始学习R，里面汇集了从0到高手需要的大部分资料，全部都是英文，并且给出了每个资源的链接。假如你的时间有限，这一篇一定要看，对整个学习的路径有个大致的了解，入门的教程我们下面再说 R Learning Path: From beginner to expert in R in 7 steps 英文读不下去，可以先看一下这一篇中文介绍 

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 当你入门了R语言后，看看这篇文章，里面总结了大部分数据处理时会用到的Ｒ包：

RStartHere 不想看英文，这是中文版本： 学习R语言，一篇文章让你从懵圈到入门 下面这个R语言进阶路径是R-bloggers网站和DataCamp合作推出的指南，里面涵盖了从入门到进阶的各种在线资源 Tutorials for learning R 而R-bloggers本身就是学习R语言特别好的网站。 对数据科学感兴趣的可以看看这个 R for Data Science,Hadley Wickham重新规范了数据处理的流程,这本书相当于是给神包tidyverse的实战版，有书籍，也有网络免费版本，写得很好，强烈推荐。 当你掌握了R的基本操作，能独立做分析，想提高可以看一下Hadley Wickham的这本书， 我看到很多高手推荐： Advanced R第二版

以下的资源中除了中文资料，大部分内容都已经在第一个链接中推荐过

交互教程（强烈推荐用来入门）

下面的课程我自己用过，这种循序渐进，一路保护的感觉，可以让你迅速入门 你不需要下载R，安装包，就跟着他们走，就OK了。极其友好的的入门教程，全程走下来大概两个多小时，配合中文教程，急速入门 Try R，注意要一口气学完，因为他没办法记录进度。

我更推荐的是这个来自Datacamp的入门教程，专业的入门教程，不需要任何背景，跟着教程走即可：Introduction to R 是的，这部分是免费的，如果需要，Datacamp有完整的R语言英文教程，都能听得懂，名字叫Data Scientist with R，需要花费95小时。课程设置很有技巧，循序渐进。

网页：

中文R语言网页教程，作为储备，防止看不懂英文：https://www.w3cschool.cn/r/r_overview.html 英文R语言极简教程：http://www.r-tutor.com/r-introduction 生信技能树骨干赵飞同学写的R必备基础知识 R语言各个包里面的数据集 在R语言里除了使用help还可以查阅rdocumentation

书籍：

《R in Action》中文名称R语言实战，目前已经到了第二版 《The Art of_R Programming》 帮助Y叔入门R的电子书 http://www.burns-stat.com/documents/books/the-r-inferno/ http://www.cookbook-r.com/ 这本小书是介绍R语言在生物信息学里面应用的 a Little Book of R for Bioinformatics! JIMMY推荐的R语言大神回顾踩过的坑 R语言忍者秘笈 他的作者是谢益辉，Rmarkdown的作者，现在为Rstudio工作，我看过他的采访，说自己写作业排版太麻烦，特别愤怒的开发了Rmarkdown。 此外还可以看看CRAN总结的很多电子书

R语言绘图：

《ggplot2：数据分析与图形艺术》 

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 Be Awesome in ggplot2: A Practical Guide to be Highly Effective - R software and data visualization 严涛的翻译版本如下：ggplot2高效实用指南 ggplot2高效实用指南（续） 这是他的博客，严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生

Bioconductor

对于生信工作者bioconductor十分重要，生信工作者离不开这些R包，进入他的官网 比如在网页的search部分输入TCGA，就会得到 https://www.bioconductor.org/help/search/index.html?q=TCGA/ 立马感觉学习有了方向，是么？可是，如果还没有入门R语言，暂时不要进去看，会伤害自尊心的。 此外要尝试参加一些线下的培训，比如生信技能树的培训，你去参加这样的互动，就是去开天眼的，学习是自己的事情，但是耶和华说，知道自己不知道才是智慧的开端。 好吧，下面是外国的课程，说实话，我之前不知道R语言可以干这些事情。 约翰•霍普金斯大学的Bioconductor学习课程 

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 如果觉得练的差不多了，就来我们论坛试试这些题目吧，完成了这些作业的同学都已经是论坛的大神了 生信编程实战5个月传送门

高人指点：

苦口婆心无比真诚的大神Jimmy--

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 独树一帜的大神Y叔--

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 银河统计：http://www.cnblogs.com/cloudtj/articles/5148848.html 可爱的jimmy借鉴了这篇文章的第一段话 解构R语言中的“黑魔法”

博客：

Y叔的博客（博客排版有待提高）http://guangchuangyu.github.io/ 粉丝日志(强烈推荐)博主是张丹 http://blog.fens.me/ 他写了一系列关于R的文章 http://blog.fens.me/series-r/ 目前他主要从事量化交易软件的开发 银河统计：这里汇总了关于R的56篇文章 http://www.cnblogs.com/cloudtj/category/780800.html 任坤的博客，他是rlsit,pipeR的作者，他还写了一本书 Learning R Programming http://renkun.me/ 生物日志-鸣一道 [糗世界](http://qiubio.blogspot.hk/

微信公众号：

• Ｒ语言中文社区

• 每天进步一点点2015，主要集中在R语言和Python的学习上，从数据分析到机器学习

• R语言

PS : 本文大部分是链接，微信公众号不方便跳转，请点击下面的阅读原文收藏，方便后续学习提高。

当然， 如果你在我们生信技能树公众号后台回复  cheatsheet 还能节省自己的时间拿到一些收集整理好的可供打印的学习资料哈。