古今的《心经》注解关于“色不异空，空不异色，色即是空，空即是色”这四句有很多解释。
“色不异空”，有的注解认为这是破凡夫的有见，凡夫执着色法是实在的、我是实在的，所以以空破执着。“空不异色”，是破二乘的偏空之见，因为二乘片面地强调空，有时候会对一切诸法的假名安立产生消极作用，所以执着偏空也是不对的。还有外道的顽空，更加有害。所谓顽空，就是懵懵懂懂，空无所有，不起任何作用。这是这四句话另外的一种解释。“色即是空，空即是色”这两句是由空观进入中观，达到色空不二，空有不二。
《宗镜录》对“色即是空，空即是色”还有另外的发挥。认为“色即是空”显示了文殊菩萨的大智慧，“空即是色”显示了普贤菩萨的大行愿。也就是说，“色即是空”是大智慧，“空即是色”是大慈悲。这就把这两句话提升到一个更高的层次，融入到菩萨的悲智双运境界。所以说《心经》妙义无穷，善于体会、运用，就能把《心经》圆融无碍的精义发挥出来。
这是对“色不异空，空不异色，色即是空，空即是色”这四句话作的一点补充。接着讲下面的经文。
“是故空中无色，无受、想、行、识”，这是讲在真空实相的状态中，没有五蕴的名目。“无眼、耳、鼻、舌、身、意，无色、声、香、味、触、法”，这是讲在真空实相的状态中，没有十二处的名目。“无眼界，乃至无意识界”，这是讲在真空实相的状态中，十八界的名目也不存在。为什么这么说呢？因为前面讲到，“是诸法空相，不生、不灭、不垢、不净、不增、不减”，既然真空实相无生灭，无垢净，无增减，那么一切对立的东西也就都不存在。五蕴是对待法，十二处是对待法，十八界也是对待法，在真空实相中，都无安立处。如果说在真空实相中海油这些名目，那么真空实相就是对待法，就不是究竟法，就不是平等法。“是故”二字是承上启下而言，正因为“诸法空相，不生、不灭、不垢、不净、不增、不减”，所以“空中无色，无受、想、行、识”，乃至无十八界。
五蕴、十二处、十八界，在佛学上叫做三科法门。佛陀说法，处处都是根据三科法门来开示演说、教化众生的。所谓三科者，就是三类。
者三科有什么区别呢？
首先，一切万法总不出色、心二法，凡夫之所以成为凡夫，就是在色、心二法上产生了迷惑、烦恼，造种种业，受种种报。因为迷悟的根源就在色、心二法上，一切佛法都是依色、心二法而展开。从五蕴来说，它是对迷色少、迷心多的众生而开示的法门。五蕴在佛学上叫做“合色开心”。眼、耳、鼻、舌、声、色、声、香、味、触、法，共十一法，有一类众生，在这些问题上迷惑比较轻，而在心法上迷惑比较重，所以叫“合色开心”，把十一个色法合成一个。而将心法开为四个：受、想、行、识。这四法，前面的三种是心所，识是心王。心所者，从属心王，是心王的活动，心理的活动，思想的活动。五蕴，就是针对迷色少、迷心多者而说的法。所谓“照见五蕴皆空，度一切苦厄”，就是要把五蕴突破了，超越了，或者是转化了，提升了，就能度一切苦厄。
“无眼、耳、鼻、舌、声、意、色、声、香、味、触、法”，叫做十二处，也就是六根、六尘，是心识所生之处，心识依根尘而起，所以叫做十二处。我们的心识不会凭空而有，必须要有一个依托，内依六根，外依六尘，这十二个处所就是心识升起之处。十二处只有一处讲到心法，就是“意”。十二处这一法门叫做“合心开色”。把色法展开成为十一法，而把心法合并为一法，这是“意”。这个法门是为迷色多、迷心少者而说。有的众生就只是在色法上迷惑，所以佛陀为迷心少、迷色多的人说十二处的法门。
”无眼界，乃至无意识界“，这句话中的”乃至“，是一种省略的方法，就好像我们现在的省略号一样。“无眼界”，乃至到”无意识界“，把六根、六尘、六识加到一起，叫做十八界。佛陀为新色俱迷者说十八界的法门。为什么叫十八界呢？六根、六尘、六识，各有其界限，各有其位置，各司其职，不会错乱。眼见色，耳闻声，鼻嗅香，舌尝味，身接触，意缘法。耳听声起”了别“作用的就是识。我们的每一个活动从根、尘、识三者来说，都是同时作用。眼见色，如果没有识的了别，青黄赤白长短方圆高低大小无从分别。只有识起了作用，才能够把显色、形色辨别清楚。有颜色的色法就叫做圆，大、小、高、低，各有其形状，就叫形色。
十八界、十二处、五蕴是凡夫法，是凡夫的生命境界和生活境界。凡夫每时每刻都有许多的事，许多的妄念，许多的烦恼，把它归结起来，不外乎是五蕴、十二处、十八界在起作用。”照见五蕴皆空，度一切苦厄“，同事也要照见十二处皆空，度一切苦厄；照见十八界皆空，度一切苦厄。凡夫的修行在色、心二法上下功夫，在五蕴、十二处、十八界上下功夫。一切法总起来不外色法、心法，所以禅修的法门有三门，心门、色门、息门，禅修从三门入手。所谓心法，就是观心；所谓息法，就是数息；所谓色法，就是修不净观。禅以此三法为门，是针对凡夫的迷惑而来。
如果我们在甚深般若的指导下，能够照见五蕴皆空，证得了空相，把握了空性，那是一个什么样的状态呢？那就是”空中无色，无受、想、行、识，无眼、耳、鼻、舌、身、意，无色、声、香、味、触、法，无眼界，乃至无意识界“。一个地方突破了，所有的问题都解决了。只要我们在五蕴上破除了执着和障碍，把以五蕴为”我“的观念破除了，那就不会以十二处为”我“，也不会以十八界为”我“。所以说”空中无色“。因为空相、空性是绝对待、离能所的，只要证得了，把握了，就能度一切苦厄。
上面讲的是”空”中无凡夫法。接下来“无无明，亦无无明尽，乃至无老死，亦无老死尽”，这是讲的十二因缘。十二因缘是缘觉、辟支佛所修的法门。在真空实相中，十二因缘的流转与还灭之相也是不存在的。十二因缘是众生生命流转与还灭之相也是不存在的。十二因缘是众生生命流转的全过程。人的生命，人的前世、今生与来世就是由就是由十二因缘来加以说明的。
十二因缘共有十二件事，都是有因有缘，不是无故生起，不是无中生有。十二因缘的第一个因缘就是“无明”。所谓“无明”，就是我们人生的起点，就是贪、嗔、痴等烦恼。凡夫对烦恼不了解，糊里糊涂，就如同处在一个黑暗的屋子当中，所以说是“无明”。以“无明”为缘，就生起了“行”，所谓“无明缘行，行缘识，识缘名色，名色缘六入，六入缘触，触缘受，受缘爱，爱缘取，取缘有，有缘生，生缘老死”。这十二件事组成一个生命流转的链条。我们处在迷惑中，就生生世世都顾着十二因缘的链条流转不息。一旦觉醒了，“照见五蕴皆空”了，十二因缘就不是顺着走，而是逆着走了。顺着走是十二因缘的流转门，逆着走是十二因缘的还灭门。
五蕴皆空了，十二因缘处于怎样的状态呢？所谓“无明灭则行灭，行灭则识灭，识灭则名色灭，名色灭则六入灭，六入灭则触灭，触灭则受灭，受灭则爱灭，爱灭则取灭，取灭则有灭，有灭则生灭，生灭则老死灭。” 这就是十二因缘的还灭门。流转门就是生死，还灭门就是涅槃。缘觉乘的人，处在无佛之世，见到四季交替，见到花开花落，就想到人世无常，因缘幻灭，因而悟道，所以叫缘觉，观因缘而觉悟。从生命的流转，因缘展开为十二项内容。十二项内容有过去所作之因，现在所受之果；有现在所作之因，未来所感之果，就形成了三世因果轮回不息的生命流转。