Ubuntu 18.04 科研装机Tips

Jabref

jabref

Jabref是一款开源文献管理软件，Latex论文伴侣

1. 下载Jabref源文件
   这里可以找到Jabref的历史版本，因为是开源软件，新版本总会出现各种各样让人抓狂的Bug

2. 安装Java环境
   百度搜索“ubuntu Jabref”第一名的采用的是JAVA VM打开Jabref.jar，但这样操作不稳定，Jabref容易崩。
   官网的installation推荐采用Oracle Java 8作为Jabref的运行环境，但是因为系统版本太新，ubuntu18.04不能安装。采用OpenJDK 和 OpenJFX环境，安装命令如下：

sudo apt-get install openjdk-8-jre
sudo apt-get install openjfx

计算机之前可能已经安装了各种版本的Java，如下命令可以选择默认的Java版本：

sudo update-alternatives --config java

这里选择含有java-8-openjdk-amd64的版本
强迫症可参考ubuntu如何完全卸载Java卸载不必要的Java版本

3. 运行脚本
   在$HOME下添加如下Jabref脚本

#!/bin/sh
echo "run jabref"
java -jar /home/XXX/JabRef-4.3.1.jar
echo "jabref quit success"

再将其转换为可运行脚本

chmod +x Jabref

打开终端

./Jabref

即可运行Jabref

taxlive&texstudio

texstudio

latex将研究僧从调格式的苦海中彻底解放出来，而且可以让人在写论文的过程中体会到debug的feel :-P

sudo apt-get install texlive-full
sudo apt-get install texstudio

NUDT 的latex学位论文模板：https://github.com/liubenyuan/nudtpaper
所需字体：链接: https://pan.baidu.com/s/1lw-EvFKaNZaTxz4rtI52lw 提取码: 2t6j

Tweak

Ubuntu tweak 是一款用来配置系统的工具，可以方便的设置系统主题

1. 设置软件源

sudo add-apt-repository ppa:noobslab/themes
sudo add-apt-repository ppa:noobslab/apps
sudo add-apt-repository ppa:docky-core/ppa
sudo apt-get update

2. 安装Ubuntu tweak

sudo apt-get install unity-tweak-tool

Lantern

lantern

上网工具，每个月500M免费流量。安装包在这里

坚果云

nutstore

国内少数支持Ubuntu的云同步软件，安装包及说明在 这里，建议采用编译的方式安装。
由于Ubuntu18.04改用Gnome桌面，移除了旧式的系统托盘，导致坚果云托盘图标无法正常显示，所以会出现运行程序没反应的情况。
安装TopIcons Plus扩展可以使旧式托盘图标回归， 下载地址
Go into the TopIcons Plus project directory and execute the installation script.

cd TopIcons-plus
make install

Anaconda

anaconda

国内下载地址： 清华镜像
进入下载路径

bash Anaconda3-5.3.1-Linux-x86_64.sh

其中会指定安装路径，建议安装在home下
配置环境Anaconda3变量，在~/.bashrc中加入

export PATH=~/anaconda3/bin:$PATH

安装sklearn:

conda install scikit-learn

okular

okular

PDF阅读器，支持标注和背景色更改

sudo apt-get install okular

Settings -> Configure Okular -> Accessibility(辅助功能) -> Change colors -> Color mode: Change Paper Color -> Paper color -> HTML: #d6e7cb（护眼豆沙绿颜色编号）