PubChem分子库

PubChem

PubChem，即有机小分子生物活性数据，是一种化学模组的数据库，由美国国家健康研究院（ US National Institutes of Health，NIH）支持，美国国家生物技术信息中心负责维护。

PubChem数据库包括 3个子数据库： PubChem BioAssay 库用于存储生化实验数据，实验数据主要来自高通量筛选实验和科技文献； PubChem Compound 库用于存储整理后的化合物化学结构信息； PubChem Substance 用于存储机构和个人上传的化合物原始数据。

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浏览化合物库，找到3D-Compound

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Centos7下wget命令批量自动下载分子库文件

下载前确保足够硬盘空间。

命令端运行wget -m -np空格+URL

 

wget -m -np ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pubchem/Compound_3D/01_conf_per_cmpd/SDF/

 

 

 

下载目录里面会看到不断下载下来的文件，等待下载完成！

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