评价聚类结果之entropy(熵值)和purity(纯度)

使用k-means算法对数据进行聚类之后,通常需要验证一下聚类的效果。常用的验证方法包括entropy、purity、precious、F-measure、Recall,本文只介绍entropy和purity算法。


Entropy:

对于一个聚类i,首先计算指的是聚类 i 中的成员(member)属于类(class)j 的概率,。其中是在聚类 i 中所有成员的个数,是聚类 i 中的成员属于类 j 的个数。每个聚类的entropy可以表示为,其中L是类(class)的个数。整个聚类划分的entropy为,其中K是聚类(cluster)的数目,m是整个聚类划分所涉及到的成员个数。




Purity:

使用上述Entropy中的定义,我们将聚类 i 的purity定义为。整个聚类划分的purity为其中K是聚类(cluster)的数目,m是整个聚类划分所涉及到的成员个数。


下表是对取自洛杉矶时报的3204篇文章进行的k-means划分的结果,共分为6个cluster。这些文章取自娱乐、金融等六个类别。理想情况下每个cluster只含有某一特定类别的文章。其中,cluster 3 与体育类别吻合的比较好,所以其entropy很低,purity很高。

评价聚类结果之entropy(熵值)和purity(纯度)_第1张图片


entropy和purity的核心代码(Python version)如下:

e_i = [0 for x in range(0,6)]
p_i = [0 for x in range(0,6)]
for i in range(0,cluster_num):
	wr_line_part = ","
	for j in range(0,6):
		wr_line_part += str(M_aggregate[i][j]) + ','
		p_i_j = M_aggregate[i][j]*1.0/m_i[i]  + 0.00000001
		print (p_i_j)
		e_i[i] += 0 - p_i_j*math.log2(p_i_j)
		if (p_i[i] < p_i_j):
			p_i[i] = p_i_j
	print (e_i[i])
	print (p_i[i])
	
e = 0
p = 0			
for i in range(0,6):
	e += m_i[i]/m*e_i[i]
	p += m_i[i]/m*p_i[i]


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