分子图形系统介绍 - 不断更新中

背景

中学时迷上了化学，所以高考时化学考得最好。等上了大学，又迷上了计算机，但对于化学始终没有忘怀。在计算机技术中又对图形学一直比较有兴趣。因此，一接触到分子图形学（Molecular Graphics，可见http://en.wikipedia.org/wiki/Molecular_graphics），就特别着迷。可由于工作的原因，尽管接触早，但并未深入研究。直到今年，在工作之余总想做些什么，看了李开复的自传后，明白了，我想追寻自己的内心：把化学和计算机结合起来。于是花了很多时间在互联网上研究，也就有了这篇文章。也许是以前在大学工作过的原因，写东西习惯了要引用和参考，而且有些“八股”，勿怪。

分子图形学简介

分子图形学用计算机图形技术来显示或操作分子结构和性质的一门学科。它和计算机辅助分子建模是介于化学、分子生物学、计算机图形学与CAD技术之间两门新兴的交叉学科，并成为配位化学、结晶化学、结构化学、分子反应动力学、有机化学、生物化学和医药化学等基础性研究及技术开发中常用的方法和研究手段。从应用领域看，它们不仅为化学家的工作提供了便利，也为进一步深入认识三维空间中化学分子的结构和行为，尤其是复杂的生物大分子，带来了可能[1]。

分子图形学的资料，中文的较少，由于我主要利用互联网来搜索，所以常常只能看到很多文献的摘要。目前能找到的国内的最早介绍分子图形学的资料是《自然杂志》1987年第1期中对它的介绍（我无法看到全文）。

常用的开源分子图形系统

BALLView
g0penMol
Jmol
Molden
NOCH
PyMOL
RasMol
UCSF Chimera

参考文献

1.蔡文生等，分子图形与计算机辅助分子模型的发展，生命科学，第11卷，1999年6月。

 

转载于:https://www.cnblogs.com/tangpepper/archive/2009/11/03/1595259.html