[NAR|2019] CHOPCHOP CRISPR位点查询

CRISPR-Cas系统是一种强大的基因编辑工具。CHOPCHOP是一个可以查询基因编辑位点的工具。

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使用

CHOPCHOP数据库支持200多个基因组的查询。同时对于基因编辑的目的来说，这次的版本支持了包括knock-out; knock-in; activation; repression; nanopore enrichment。四个选择。我们可以根据自己的需要来查找。同时在Options我们还可以自己定义很多东西。

我们这次查找RNF180的knock-out。

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结果

结果也很简单。首先是包括了一个关于个基因位置的信息图和一个。可能的靶标序列。同时。这个网站还提供了不同类型的下载文件。

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另外点击UCSC genome brower还可以在UCSC浏览器的上查看结果

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代码行处理

网页形式的只能一个一个基因的搜索。如果我们有多个基因想要查找的话，同样也提供了代码行的工具。具体的查看地址在：代码行运行

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