- R语言零基础基因/数据差异分析（一）
Frms
R语言零基础基因/数据差异分析r语言数据分析数据可视化
文章目录介绍环境搭建软件下载结果展示基因数据下载流程基因数据处理利用GEO分析绘制拟火山图注意，本系列有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！介绍本系列文主要依据真实论文制图流程，详细说明制图过程，其中包括：1.基因数据下载2.制图所需数据格式3.火山图制作流程4.聚类热图制作流程环境搭建软件下载移步至此学习结果展示基因数据处理注意删除末行注释基因数据下载流程以GSE137578基
- PyVCF 变异基因数据处理
loong_XL
生信生信
PyVCF是一个用于处理VCF(VariantCallFormat)文件的python库。它提供了许多功能来读取，过滤和修改VCF文件中的变异PyVCF是一个用于读取和写入VCF格式文件的Python库。主要功能包括:1、读取VCF文件：PyVCF提供了一个vcf.Reader()函数，可以用来打开并读取VCF文件。读取后的文件可以进行遍历，每个元素是一个vcf.model._Record的实例2
- 云上弹性高性能计算，支持生命科学产业高速发展、降本增效
阿里云开发者
人工智能运维数据可视化安全BI数据处理调度云计算数据中心容器阿里云开发者
简介：生命科学的研究早已离不开高性能计算（HighPerformanceComputing，HPC）的辅助。从计算机辅助药物设计、疫苗研发，到基因数据处理与分析，再到提供精准医疗服务于肿瘤治疗、产前筛查等医疗技术，高性能计算HPC在生命科学研究中扮演着十分重要的角色。而云，又能如何助力产业发展，帮助产业降本增效呢？随着云计算技术服务及实践的日趋成熟，越来越多的行业通过上云实现了整个产业的转型升级，
- 云上弹性高性能计算，支持生命科学产业高速发展、降本增效
程序员
简介：生命科学的研究早已离不开高性能计算（HighPerformanceComputing，HPC）的辅助。从计算机辅助药物设计、疫苗研发，到基因数据处理与分析，再到提供精准医疗服务于肿瘤治疗、产前筛查等医疗技术，高性能计算HPC在生命科学研究中扮演着十分重要的角色。而云，又能如何助力产业发展，帮助产业降本增效呢？image.png随着云计算技术服务及实践的日趋成熟，越来越多的行业通过上云实现了整
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人工智能运维数据可视化安全bi
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- 相似度融合网络：用于聚合不同的基因数据类型：Similarity network fusion for aggregating data types on a genomic scale
Ice-iron
论文笔记机器学习神经网络深度学习
论文标题：Similaritynetworkfusionforaggregatingdatatypesonagenomicscale.论文下载地址论文总结论文以计算机视觉多视图方式为启发，设计了一种图融合网络用于解决基因数据不能综合处理的困难。现有的基因数据非常丰富，有各种类型的基因数据可以利用。但现有的基因数据处理方式大多数是只利用一种基因数据，例如只使用DNA或者是只使用mRNA，不能综合所有
- 基因数据处理80之disease的DataProcessing
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.代码：/***@authorxubo*morecode:https://github.com/xubo245/SparkLearning*moreblog:http://blog.csdn.net/xubo245*/packageorg.gcdss.cli.diseaseimportjava.text.SimpleDateFormatimportjava.util.Dateimportorg.
- 基因数据处理85之adam-0.18.2无法读取0.14.0使用adamSave存储的数据
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.介绍：cs-bwamem依赖的是adam-0.14.0里面的adamSave存储之后无法用adam-0.18.2的结果读取：2.adam-0.18.2adamsave可以用loadParquetAlignments读取。但无法用loadParquetAlignments读取adam-0.14.23.代码：packageorg.gcdss.cli.testimportjava.nio.file.
- 基因数据处理73之从HDFS读取fasta文件存为Adam的parquet文件
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.GRCH38chr14：hadoop@Master:~/xubo/project/load$./load.shstart:1SLF4J:Failedtoloadclass"org.slf4j.impl.StaticLoggerBinder".SLF4J:Defaultingtono-operation(NOP)loggerimplementationSLF4J:Seehttp://www.sl
- 基因数据处理94之使用kmer分析SRR003161数据的kmer分布
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.分两组(1)kmer长度为：5to21(2)kmer长度为：5to55by102.代码：packageorg.gcdss.cliimportjava.text.SimpleDateFormatimportjava.util._importorg.apache.spark._importorg.bdgenomics.adam.projections.{AlignmentRecordField,P
- 基因数据处理57之BWA-MEM运行single-end(1千万条100bp的reads)
KeepLearningBigData
基因数据处理
```hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$bwamemGRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522.fastag38L100c10000000Nhs20.fq>g38L100c10000000Nhs20.bwamem.sam[M::bwa_idx_load_from_disk]read0ALTcon
- 基因数据处理75之从HDFS读取vcf文件存为Adam的parquet文件（成功）
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.参考：packageorg.bdgenomics.adam.cliclassFlattenSuiteextendsADAMFunSuite{valloader=Thread.currentThread().getContextClassLoadervalinputPath=loader.getResource("small.vcf").getPathvaloutputFile=File.cre
- 基因数据处理74之从HDFS读取vcf文件存为Adam的parquet文件（有问题）
KeepLearningBigData
基因数据处理spark基因数据处理adam
1.small.vcf:没记录2.读取：5loadtime:3287ms{"variant":{"variantErrorProbability":139,"contig":{"contigName":"1","contigLength":null,"contigMD5":null,"referenceURL":null,"assembly":null,"species":null,"refere
- 基因数据处理2之ftp数据快速查找
KeepLearningBigData
基因数据处理
基因数据处理2之ftp数据快速查找linux下可以用grep:curl-s"ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/current.tree"|grepNA12878运行结果：hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/testAdam34/TestBaiBas$curl-s"ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.
- 基因数据处理83之移动GRCH38Index到每个节点
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.从cloud/adam移出到xubo/ref:hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$mkdir-p~/xubo/ref/GRCH38Index/hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310$mvGCA_000001405.15_GRCh38/*~/xubo/ref/GRCH38I
- 基因数据处理54之bwa-mem运行paird-end（1千万条100bp的reads）
KeepLearningBigData
基因数据处理Spark问题
指令：```hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Sub/cs-bwamem$bwamemGRCH38BWAindex/GRCH38chr1L3556522.fastag38L100c10000000Nhs20Paired1.fqg38L100c10000000Nhs20Paired2.fq>g38L100c10000000Nhs20Paired12
- 基因数据处理1之mapping_to_cram
KeepLearningBigData
基因数据处理
基因数据处理1之mapping_to_cram参考资料：AWorkedExampleObtainsomepublicdataWewillusethefirst100,000read-pairsfromayeastdataset.curlftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR507/SRR507778/SRR507778_1.fastq.gz|gzip-d|he
- 基因数据处理72之GATK安装成功
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.下载：gitclonehttps://github.com/broadgsa/gatk-protected.git2.安装：gitcheckout3.5mvncleanpackage-DskipTests3.安装成功：[INFO]ReactorSummary:[INFO][INFO]GATKRoot..........................................SUCCES
- 基因数据处理77之从vcf文件中提取某条染色体的数据
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.代码：/***@authorxubo*/packageorg.gcdss.cli.vcfimportorg.apache.spark.{SparkConf,SparkContext}/***Createdbyxuboon2016/5/23.*/objectextractGRCH38chr20vcf{defmain(args:Array[String]){valconf=newSparkConf
- 基因数据处理34之使用samtools和bcftools进行变异分析
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.指令：（1）samtoolsmpileup-vfHomo_sapiens_assembly19chr20.fastaNA12878_snp_A2G_chr20_225058.sorted.bam>NA12878_snp_A2G_chr20_225058.variants或者：samtoolsmpileup-vfHomo_sapiens_assembly19chr20.fastaNA12878_
- 基因数据处理116之重新运行SparkBWA Yarn集群模式
KeepLearningBigData
基因数据处理
更多代码请见：https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释很久没运行SparkBWA了，系统文件有点多，重新运行。2.代码：endhadoop@Master:~/disk2/xubo/project/alignment/sparkBWA$vig38L100c100000Nhs20Paired12SparkBWAYarnPartition0.shecho"start"
- 基因数据处理117之重新多次运行SparkBWA Yarn集群
KeepLearningBigData
基因数据处理
更多代码请见：https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释重新运行，跟换了文件地址后来终端，需要运行其他的2.代码：hadoop@Master:~/disk2/xubo/project/alignment/sparkBWA$visparkBWA.shforjin10000100000100000010000000doforiin50100doecho$iecho$j
- 基因数据处理112之运行gcdss的avocado编译识别报错getRecordGroupSample空指针异常解决办法
KeepLearningBigData
基因数据处理
前面一片已经讲了遇到的问题，之前也遇到过：基因数据处理31之avocado运行avocado-cli中的avocado问题3-变异识别找不到RecordGroupSample（null）http://blog.csdn.net/xubo245/article/details/51525241解决办法：在读入的sam/bam/adam数据进行判定，如果RecordGroup等数据为空，则加上默认值在
- 基因数据处理110之批量测试SparkBWA和CS-bwamem算法
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.总的脚本hadoop@Master:~/xubo/project/alignment$catrunSparkBWAAndCsbwamem.shecho"startsparkBWA"./sparkBWA/sparkBWA.shecho"startCsbwamemalgin"./cs-bwamem/csbwamemAlign.shecho"startCsbwamemmerge"./cs-bwame
- 基因数据处理106之bwa-mem运行paird-end（1千万条100bp的reads g38L100c10000000Nhs20Paired12）
KeepLearningBigData
基因数据处理
脚本：hadoop@Master:~/xubo/project/alignment/sparkBWA$catg38L100c10000000Nhs20Paired12Bwamem.shecho"start"startTime4=`date+"%s.%N"`time4=`date+"%Y%m%d%H%M%S"`#spark-submit--classorg.apache.spark.examples
- 基因数据处理113之对avocado识别的SparkBWA变异数据进行疾病分析_
KeepLearningBigData
基因数据处理
（一）问题问题1：avocado数据读取：avocado存到磁盘是：RDD[Genotype]valprocessedGenotypes:RDD[Genotype]=postProcessVariants(calledVariants,stats).flatMap(variantContext=>variantContext.genotypes)//savevariantstooutputfile
- 基因数据处理109之SparkBWA运行成功的部分log
KeepLearningBigData
基因数据处理
数据来自：http://219.219.220.149:18080/history/application_1466866953605_0001/executors/http://219.219.220.248:8042/node/containerlogs/container_1466866953605_0001_01_000003/hadoop/stderr/?start=0SLF4J:Cla
- Spark问题14之Spark stage retry问题
KeepLearningBigData
Spark问题
更多代码请见：https://github.com/xubo245基因数据处理系列之SparkBWA1.解释1.1简述当partitions超过节点数量的时候Lostexecutor的问题，已经提交到SparkBWA中，https://github.com/citiususc/SparkBWA/issues/35另外发现，tmp里面有临时文件没有删除，而且stageretry未解决2.记录完整报错
- 基因数据处理102之SparkBWA本地运行100万条paired-reads实例
KeepLearningBigData
基因数据处理
脚本：spark-submit--classSparkBWA\--masterlocal\--archivesbwa.zip\SparkBWA.jar\-algorithmmem-readspaired\-index/home/hadoop/xubo/ref/GRCH38L1Index/GRCH38chr1L3556522.fasta\-partitions3\/xubo/alignment/sp
- 基因数据处理101之SparkBWA本地运行配置和实例
KeepLearningBigData
基因数据处理
1.修改Makefile.common：将LIBBWA_LIBS=-lrt改为LIBBWA_LIBS=-lrt-lz不然会报错误【5】2.make之后修改java.library.path步骤：vi/etc/profile加入exportLD_LIBRARY_PATH=/home/hadoop/xubo/tools/SparkBWA/build:$LD_LIBRARY_PATH使生效：source
- Java开发中，spring mvc 的线程怎么调用？
小麦麦子
springmvc
今天逛知乎，看到最近很多人都在问spring mvc 的线程http://www.maiziedu.com/course/java/ 的启动问题，觉得挺有意思的，那哥们儿问的也听仔细，下面的回答也很详尽，分享出来，希望遇对遇到类似问题的Java开发程序猿有所帮助。
问题：
在用spring mvc架构的网站上，设一线程在虚拟机启动时运行，线程里有一全局
- maven依赖范围
bitcarter
maven
1.test 测试的时候才会依赖，编译和打包不依赖，如junit不被打包
2.compile 只有编译和打包时才会依赖
3.provided 编译和测试的时候依赖，打包不依赖，如：tomcat的一些公用jar包
4.runtime 运行时依赖，编译不依赖
5.默认compile
依赖范围compile是支持传递的，test不支持传递
1.传递的意思是项目A，引用
- Jaxb org.xml.sax.saxparseexception : premature end of file
darrenzhu
xmlprematureJAXB
如果在使用JAXB把xml文件unmarshal成vo(XSD自动生成的vo)时碰到如下错误：
org.xml.sax.saxparseexception : premature end of file
很有可能时你直接读取文件为inputstream，然后将inputstream作为构建unmarshal需要的source参数。InputSource inputSource = new In
- CSS Specificity
周凡杨
html权重Specificitycss
有时候对于页面元素设置了样式，可为什么页面的显示没有匹配上呢？ because specificity
CSS 的选择符是有权重的，当不同的选择符的样式设置有冲突时，浏览器会采用权重高的选择符设置的样式。
规则：
HTML标签的权重是1
Class 的权重是10
Id 的权重是100
- java与servlet
g21121
servlet
servlet 搞java web开发的人一定不会陌生，而且大家还会时常用到它。
下面是java官方网站上对servlet的介绍： java官网对于servlet的解释 写道
Java Servlet Technology Overview Servlets are the Java platform technology of choice for extending and enha
- eclipse中安装maven插件
510888780
eclipsemaven
1.首先去官网下载 Maven：
http://www.apache.org/dyn/closer.cgi/maven/binaries/apache-maven-3.2.3-bin.tar.gz
下载完成之后将其解压，
我将解压后的文件夹：apache-maven-3.2.3，
并将它放在 D:\tools目录下，
即 maven 最终的路径是：D:\tools\apache-mave
- jpa@OneToOne关联关系
布衣凌宇
jpa
Nruser里的pruserid关联到Pruser的主键id，实现对一个表的增删改，另一个表的数据随之增删改。
Nruser实体类
//*****************************************************************
@Entity
@Table(name="nruser")
@DynamicInsert @Dynam
- 我的spring学习笔记11-Spring中关于声明式事务的配置
aijuans
spring事务配置
这两天学到事务管理这一块，结合到之前的terasoluna框架，觉得书本上讲的还是简单阿。我就把我从书本上学到的再结合实际的项目以及网上看到的一些内容，对声明式事务管理做个整理吧。我看得Spring in Action第二版中只提到了用TransactionProxyFactoryBean和<tx:advice/>,定义注释驱动这三种，我承认后两种的内容很好，很强大。但是实际的项目当中
- java 动态代理简单实现
antlove
javahandlerproxydynamicservice
dynamicproxy.service.HelloService
package dynamicproxy.service;
public interface HelloService {
public void sayHello();
}
dynamicproxy.service.impl.HelloServiceImpl
package dynamicp
- JDBC连接数据库
百合不是茶
JDBC编程JAVA操作oracle数据库
如果我们要想连接oracle公司的数据库，就要首先下载oralce公司的驱动程序，将这个驱动程序的jar包导入到我们工程中;
JDBC链接数据库的代码和固定写法;
1,加载oracle数据库的驱动;
&nb
- 单例模式中的多线程分析
bijian1013
javathread多线程java多线程
谈到单例模式，我们立马会想到饿汉式和懒汉式加载，所谓饿汉式就是在创建类时就创建好了实例，懒汉式在获取实例时才去创建实例，即延迟加载。
饿汉式：
package com.bijian.study;
public class Singleton {
private Singleton() {
}
// 注意这是private 只供内部调用
private static
- javascript读取和修改原型特别需要注意原型的读写不具有对等性
bijian1013
JavaScriptprototype
对于从原型对象继承而来的成员，其读和写具有内在的不对等性。比如有一个对象A，假设它的原型对象是B，B的原型对象是null。如果我们需要读取A对象的name属性值，那么JS会优先在A中查找，如果找到了name属性那么就返回；如果A中没有name属性，那么就到原型B中查找name，如果找到了就返回；如果原型B中也没有
- 【持久化框架MyBatis3六】MyBatis3集成第三方DataSource
bit1129
dataSource
MyBatis内置了数据源的支持，如：
<environments default="development">
<environment id="development">
<transactionManager type="JDBC" />
<data
- 我程序中用到的urldecode和base64decode,MD5
bitcarter
cMD5base64decodeurldecode
这里是base64decode和urldecode，Md5在附件中。因为我是在后台所以需要解码：
string Base64Decode(const char* Data,int DataByte,int& OutByte)
{
//解码表
const char DecodeTable[] =
{
0, 0, 0, 0, 0, 0
- 腾讯资深运维专家周小军：QQ与微信架构的惊天秘密
ronin47
社交领域一直是互联网创业的大热门，从PC到移动端，从OICQ、MSN到QQ。到了移动互联网时代，社交领域应用开始彻底爆发，直奔黄金期。腾讯在过去几年里，社交平台更是火到爆，QQ和微信坐拥几亿的粉丝，QQ空间和朋友圈各种刷屏，写心得，晒照片，秀视频，那么谁来为企鹅保驾护航呢？支撑QQ和微信海量数据背后的架构又有哪些惊天内幕呢？本期大讲堂的内容来自今年2月份ChinaUnix对腾讯社交网络运营服务中心
- java-69-旋转数组的最小元素。把一个数组最开始的若干个元素搬到数组的末尾，我们称之为数组的旋转。输入一个排好序的数组的一个旋转，输出旋转数组的最小元素
bylijinnan
java
public class MinOfShiftedArray {
/**
* Q69 旋转数组的最小元素
* 把一个数组最开始的若干个元素搬到数组的末尾，我们称之为数组的旋转。输入一个排好序的数组的一个旋转，输出旋转数组的最小元素。
* 例如数组{3, 4, 5, 1, 2}为{1, 2, 3, 4, 5}的一个旋转，该数组的最小值为1。
*/
publ
- 看博客，应该是有方向的
Cb123456
反省看博客
看博客，应该是有方向的:
我现在就复习以前的，在补补以前不会的，现在还不会的，同时完善完善项目，也看看别人的博客.
我刚突然想到的:
1.应该看计算机组成原理，数据结构，一些算法，还有关于android,java的。
2.对于我，也快大四了，看一些职业规划的，以及一些学习的经验，看看别人的工作总结的.
为什么要写
- [开源与商业]做开源项目的人生活上一定要朴素,尽量减少对官方和商业体系的依赖
comsci
开源项目
为什么这样说呢？ 因为科学和技术的发展有时候需要一个平缓和长期的积累过程，但是行政和商业体系本身充满各种不稳定性和不确定性，如果你希望长期从事某个科研项目，但是却又必须依赖于某种行政和商业体系，那其中的过程必定充满各种风险。。。
所以，为避免这种不确定性风险，我
- 一个 sql优化 （[精华] 一个查询优化的分析调整全过程！很值得一看 ）
cwqcwqmax9
sql
见 http://www.itpub.net/forum.php?mod=viewthread&tid=239011
Web翻页优化实例
提交时间: 2004-6-18 15:37:49 回复 发消息
环境：
Linux ve
- Hibernat and Ibatis
dashuaifu
Hibernateibatis
Hibernate VS iBATIS 简介 Hibernate 是当前最流行的O/R mapping框架，当前版本是3.05。它出身于sf.net，现在已经成为Jboss的一部分了 iBATIS 是另外一种优秀的O/R mapping框架，当前版本是2.0。目前属于apache的一个子项目了。 相对Hibernate“O/R”而言，iBATIS 是一种“Sql Mappi
- 备份MYSQL脚本
dcj3sjt126com
mysql
#!/bin/sh
# this shell to backup mysql
#
[email protected] (QQ:1413161683 DuChengJiu)
_dbDir=/var/lib/mysql/
_today=`date +%w`
_bakDir=/usr/backup/$_today
[ ! -d $_bakDir ] && mkdir -p
- iOS第三方开源库的吐槽和备忘
dcj3sjt126com
ios
转自
ibireme的博客 做iOS开发总会接触到一些第三方库，这里整理一下，做一些吐槽。 目前比较活跃的社区仍旧是Github，除此以外也有一些不错的库散落在Google Code、SourceForge等地方。由于Github社区太过主流，这里主要介绍一下Github里面流行的iOS库。 首先整理了一份
Github上排名靠
- html wlwmanifest.xml
eoems
htmlxml
所谓优化wp_head()就是把从wp_head中移除不需要元素，同时也可以加快速度。
步骤：
加入到function.php
remove_action('wp_head', 'wp_generator');
//wp-generator移除wordpress的版本号，本身blog的版本号没什么意义，但是如果让恶意玩家看到，可能会用官网公布的漏洞攻击blog
remov
- 浅谈Java定时器发展
hacksin
java并发timer定时器
java在jdk1.3中推出了定时器类Timer,而后在jdk1.5后由Dou Lea从新开发出了支持多线程的ScheduleThreadPoolExecutor，从后者的表现来看，可以考虑完全替代Timer了。
Timer与ScheduleThreadPoolExecutor对比：
1.
Timer始于jdk1.3,其原理是利用一个TimerTask数组当作队列
- 移动端页面侧边导航滑入效果
ini
jqueryWebhtml5cssjavascirpt
效果体验：http://hovertree.com/texiao/mobile/2.htm可以使用移动设备浏览器查看效果。效果使用到jquery-2.1.4.min.js，该版本的jQuery库是用于支持HTML5的浏览器上，不再兼容IE8以前的浏览器，现在移动端浏览器一般都支持HTML5，所以使用该jQuery没问题。HTML文件代码：
<!DOCTYPE html>
<h
- AspectJ+Javasist记录日志
kane_xie
aspectjjavasist
在项目中碰到这样一个需求，对一个服务类的每一个方法，在方法开始和结束的时候分别记录一条日志，内容包括方法名，参数名+参数值以及方法执行的时间。
@Override
public String get(String key) {
// long start = System.currentTimeMillis();
// System.out.println("Be
- redis学习笔记
MJC410621
redisNoSQL
1)nosql数据库主要由以下特点：非关系型的、分布式的、开源的、水平可扩展的。
1，处理超大量的数据
2，运行在便宜的PC服务器集群上，
3，击碎了性能瓶颈。
1)对数据高并发读写。
2)对海量数据的高效率存储和访问。
3)对数据的高扩展性和高可用性。
redis支持的类型：
Sring 类型
set name lijie
get name lijie
set na
- 使用redis实现分布式锁
qifeifei
在多节点的系统中，如何实现分布式锁机制，其中用redis来实现是很好的方法之一，我们先来看一下jedis包中，有个类名BinaryJedis,它有个方法如下：
public Long setnx(final byte[] key, final byte[] value) {
checkIsInMulti();
client.setnx(key, value);
ret
- BI并非万能，中层业务管理报表要另辟蹊径
张老师的菜
大数据BI商业智能信息化
BI是商业智能的缩写，是可以帮助企业做出明智的业务经营决策的工具，其数据来源于各个业务系统，如ERP、CRM、SCM、进销存、HER、OA等。
BI系统不同于传统的管理信息系统，他号称是一个整体应用的解决方案，是融入管理思想的强大系统：有着系统整体的设计思想，支持对所有
- 安装rvm后出现rvm not a function 或者ruby -v后提示没安装ruby的问题
wudixiaotie
function
1.在~/.bashrc最后加入
[[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] && source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
2.重新启动terminal输入：
rvm use ruby-2.2.1 --default
把当前安装的ruby版本设为默
