生信 | GeneMark

（参考）

基因预测原理：宏基因组分析——基因预测篇

      宏基因组基因预测一般包括同源预测和从头预测。同源预测是通过与基因的同源序列比对，从而获得与已知基因序列最大匹配，其预测依赖于已知的基因信息，且不能注释出在数据库中缺少功能相似性序列的基因和新基因，计算资源消耗过大，时间花费过长。而从头预测是根据给定的序列特征来预测，主要依赖于在编码区和非编码区拥有不同特征的信息，并在统计学上进行描述，构建概率模型，用以区别编码与非编码区。

GeneMark使用教程： GeneMark使用教程 

GeneMark软件包是专为原核基因组和病毒基因组以及元基因组分析而设计的，可以预测基因，以及蛋白质编码区阅读框的位移。

makemat或GeneMarkS程序生成相应的GeneMark模型，GeneMark和GeneMark.hmm 进行基因预测。

下载

GeneMark：http://topaz.gatech.edu/GeneMark/

简要使用

gmhmmp $SampleOutputDirASS/$sample.contigs.fa -f G -A $sample.contigs.prot.fa -D $sample.contigs.nucl.fa -m MetaGeneMark_v1.mod -o $sample.gff

              说明:

                            软件： gmhnmmp

                            参数：    基本默认

                                          -f ：指定输出的为gff格式

                                          -A ：输出核酸序列

                                          -D ：输出蛋白序列

                                          -m ：宏基因组的模型（下载）

                            输出结果：   预测到的核酸（nucl.fa）、蛋白质序列（prot.fa）、基因位置信息（gff）

问题：MetaGeneMark_v1.mod 更多模型下载？