Gephi简介

转自：http://blog.csdn.net/cleverlzc/article/details/50930658

第一章.Gephi简介 
1.1 最简单的8个图形： 

简单的节点连线图： 

1.2 Gephi图形界面 
主界面中的Data Laboratory界面，这里主要用来查看数据，注意：节点和边的数据是分开的。 
就像GML文件中的节点和边是有各自的标签的。 

图形预览界面，可以调整不同的参数，达到想要的效果 

第二章.数据输入或者导入 
2.1 数据进入Gephi的8种方式：鼠标点、键盘输、CSV文件、其他格式文件、程序生成、数据库、浏览网站、邮件账户 
2.1.1 鼠标画点和连线（在Overview界面）： 

2.1.2 键盘输入节点和边的信息（在Data Laboratory界面）： 

2.1.3 导入CSV文件 
注意：这里使用Data Laboratory视图中“输入电子表格”功能进行导入。因为需要进一步选择导入的是节点数据还是边数据。 
2.1.4 导入gml或者gexf文件，则可以使用File->打开 
2.1.5 程序生成 
File->生成，有动态图、Multi-Graph、随机图可以自动生成。 
其中，动态图的最下方有个时间线的变化，拖动时间线，可以看到图有相应的动态的变化。 
随机图可以自己定义节点的数量，和连线的比值。 
2.1.6 从数据库中导入，可以把互联网中的数据或其他数据存入DB，然后从DB读取 
File->Import Database->Edge List，弹出DB连接配置界面。 
 
2.1.7 从浏览网站中导入数据 
1）.首先配置浏览器的代理，局域网(LAN)设置->高级，将端口改为8088： 

2）.File->生成->HTTP Graph 
3）.在刚才的浏览器中，随便输入一个关键词进行搜索，可以在Gephi中看到链接随着变化 

2.1.8 从邮箱中导入数据，可以将邮件往来展示出来 
前提是需要将邮箱对应的服务商的POP3（一种邮件协议）打开， 
File->导入 Spigots->Email->输入Email账号

2.3（讲座6） CSV文件从哪里来？ 

Gephi如何使用CSV文件？可以把CSV视为Gephi与众多应用的桥梁！ 

注意：Gephi中CSV文件分为两种：节点及其属性，边及其属性。在导入与导出时尤其要注意这两者之间的区别。

Gephi在只导入边数据时，会自动创建节点信息，反之不然，即使不会报错，显示出来的结果也不可解释。

2.5（讲座8）自动生成数据以及动态数据的介绍 
动态数据中，可以拉出来一个时间框，拖动时间框可以看到图会动态变化

转自：http://blog.csdn.net/cleverlzc/article/details/50931433

Gephi的可扩展性是值得称赞的。 
所需插件可以从这里下载：https://marketplace.gephi.org/

下载的文件是一个以nbm为后缀的gephi插件文件，在gephi的主界面的工具—插件中，选择下载的插件，然后按照提示安装就可以了，在这里还可以更新很多插件。

直接搜索即可，比如需要HTTP浏览网站的分析，需要下载HTTPGraph插件； 
例子：使用Gephi做网页监控及PageRank排名计算

比如不想使用Gephi默认实现的FastUnfolding算法，需要使用著名的GN算法实现节点划分，可以下载Girvan Newman Clustering插件。

还有很多插件，如有相应的需要，到marketplace上去查找。 
Gephi是基于Java实现的，可以自己开发实现一些特殊功能的插件。

转自：http://blog.csdn.net/cleverlzc/article/details/50949914

理 
3.1（讲座9） 图窗体内编辑工具介绍 
（1）节点的移动 
单个节点、全部节点，“小手”工具 
（2）节点的放大与缩小 
单个、多个、全部，“钻石”工具，鼠标按住网上拖放大、往下拖缩小； 
多个节点时，需要多个小工具配合使用，首先使用“矩形”工具选中要操作的节点，然后选择“钻石”工具，鼠标往上拖放大、往下拖缩小 
（3）节点颜色调整 
单个、多个、全部，“笔”工具，上部会出现颜色选择器，在一个点上不断地点击，颜色就会越来越深； 
多个，同上一步，需要“矩形”工具的配合； 
但此步有第二种方法：“颜色桶”工具，点击一个点，与其相连接的所有点都会跟着变； 
全部点（第三种方法）：在左下角有个“重设颜色”工具 
（4）边粗细调整 
下方的拖动条，还有个”边显示开关”工具 
（5）标签编辑 
“T”工具，即“标签显示开关”工具，并且可以对标签中的字体进行编辑：字体、大小等； 
（6）节点属性编辑 
选择“箭头问号”工具，然后选择要编辑的点，在编辑窗口可以对该点进行各种属性的改变，比如大小、xy坐标、颜色、标签等，如图： 

3.2（讲座10） 五个高级编辑工具 
（1）在Gephi中的位置 
就是左右两边的小窗口，提供了：外观、排序、布局、上下文、过滤和统计等很多功能。 
注意：下面的顺序是使用的顺序。 
（1.1）“排序”，功能如下： 

（1.2）“布局”：自动美化工具； 
（1.3）“统计”：根据内置的算法对节点和边的属性做运算，并把运算结果存入节点或者边的属性中，供分割和排名使用； 
（1.4）“分割”：把不同小簇的节点加以区分，并以不同的颜色标记；重要。 
注意：分割功能在0.9版本中已经集成到外观中了。 
（1.5）“过滤”：按照设定的方式筛选合适的节点和边； 
（2）功能 
（3）使用中的关系 
（4）介绍的顺序 
3.3 排序（讲座11） 
（1）节点可以参与排序的项目：节点的颜色、节点的大小、节点的标签颜色、节点的标签大小。分别由4个图标工具完成这4项操作。 
（1.1）节点颜色排序：连线多的颜色重、连线少的颜色浅； 
（1.2）节点的大小排序：连线多的节点大，连线少的节点小； 
（1.3）节点的标签颜色排序：首先需要打开下面的“标签开关”，再选择排序窗口中相应的图标工具； 
（1.4）节点的标签大小排序：首先需要打开下面的“标签开关”，再选择排序窗口中相应的图标工具； 
（2）边可以参与排序的项目：边的颜色、边标签的颜色、边标签大小。分别由3个图标工具完成这3项操作。操作同上。 
到此，一个节点大小颜色不同的漂亮图就生成了。

3.4 布局（讲座12） 
（1）布局的操作界面 
（2）Gephi中自带的12个布局介绍 
（3）实际演示 
这一小节比较简单，不做过多介绍。

3.5 统计（讲座13） 
（1）认识统计的操作界面 
（2）了解统计的工作原理 
前方高能：在“统计”窗口点击模块度计算后，在外观中找到“数值设定”（不计算，没有此选项），选择Modularity Class进行渲染，就可以的到绚丽多彩的网络图了，哈哈。一睹为快： 

与此同时，在“数据资料”窗口中“节点”的数据多了一列，即“Modularity Class”的值，这列数值来自“统计”计算后的变化，边的数据没有变化。 
具体工作原理如图： 

3.6 分割（讲座14） 
（1）关于分割的介绍 
（2）分割数据的来源 
（2.1）可以是统计生成的 
（2.2）可以是手动输入的 
（2.3）可以是数据本身携带的 
（3）分割的操作方法 
（3.1）用统计生成一些值 
（3.2）用这些值去改变节点的颜色 
（3.2）用这些值把节点组合起来 
（4）练习：给一堆豆子分组 
在节点的数据表格中，添加一列，比如“fenlei”，然后在该列中手动输入各种豆子，比如：红豆、绿豆、毛豆、大豆、小豆、扁豆、花生豆、豌豆。 
输入完成后在外观的“数值设定”下拉条中将出现“fenlei”，选择它，就会出现每种豆子对应的颜色，点击“应用”会将该颜色叠加到网络图中。 
3.7 过滤（即减少边，减少不合适的边，讲座15） 
（1）过滤的作用 
（2）过滤的操作界面 
（3）过滤的使用方式