update maven project后web-resource文件夹消失

前几天，遇到一个十分头疼的问题。当我在两个不同的电脑不同的开发环境，一个是eclipse（Mars 4.5），一个是myeclipse（内核是eclipse 4.6）,协同开发同一个基于注解（没有web.xml和其他配置的xml）的SSM框架项目，使用git管理，使用同一个github账号，在同一个分支工作。
当我在电脑A eclipse上push了master分支，在电脑B myeclipse上克隆了项目，刚开始是可以协同开发的，tomcat服务器正常扫描classpath路径并初始化WebApplicationContext,可是当我update maven project之后发现项目的目录改变了，tomcat只是正常的启动，并没有初始化web上下文

正常的话是这样的：

这应该是IDE的问题导致的，经过我几次对比，终于发现了一些倪端，因为有一个文件总是在两台电脑自动修改了。
解决方案：
在git视图下

进入org.eclipse.wst.common.component.xml，

将webapp修改成web-resource就可以了

总结：应该是两个IDE的web资源生成目录不一样，在eclipse是在web-source,在myeclipse就变成了webapp