生物信息学-张红-第二章-计算机基础

第二章 计算机基础

数据库、数据库的查询指令、计算机网络基础

数据库

数据管理

手工管理
文件系统：
    文件系统的缺陷：
        1.数据间缺乏联系
        2.数据冗余
        3.数据不一致
    索引文件：索引表+链接文件
        索引项由关键字+指针构成
数据库
    控制功能：
        1.数据完整性
        2.数据安全性
        3.数据库的并发控制
        4.数据库恢复
手工管理-->文件系统的计算机管理-->数据库系统管理，朝着集成化、网络化、智能化        

数据库基本概念

数据库DB：统一管理的相关数据的集合

数据库管理系统DBMS：对db管理的软件

数据库技术：研究数据库的结构、存储、设计、管理和应用的一门软件学科。

数据模型：数据库结构和语义的一种抽象描述

数据模型由 数据库结构、数据操作、完整性约束组成

数据库系统的组成：硬件软件应用程序

数据库 <--> 数据库管理系统 <--> 用户程序

关系数据库

关系数据库基于关系数据模型，其典型作用是用非嵌套的表格结构表达实体集和联系集。

结构化查询语言（SQL）的使用

SQL是集 数据定义元DDL、数据操纵语言DML、数据控制功能 于一体的数据库语言
SQL的最主要、最核心是**查询功能**。
可在命令行中交互式使用，也可以在应程序中使用。

查询命令：SELECT

SELECT [<属性名>] ：说明查找什么数据
FROM <表明列表> ：说明数据从那些表中找
[WHERE <条件表达式>] ：查找条件
通配符

查询命令：
显示次序： SELECT A,B
重命名; aliasname=name
删除重复行：SELECT DISTINCT（ALL表示所有行）
返回行数： SELECT TOP # （返回#行），SELECT # PERCENT（返回百分比行数）

WHERE 设定查询条件，逻辑判断，比较判断

ORDER BY {column_name [ASC|DESC]} [,...n]
    ASC：升序，DESC：降序

数据库的保护：

数据库的安全性
数据库的完整性

计算机网络

定义：利用通信线路和通信设备，把地理上分散、具有独立功能的多个计算机系统相互连接，按照网络协议进行数据通信，实现资源共享的计算机系统的集合。

计算机+通信+软件=网络

网络的功能：信息交换、资源共享、分布式处理

计算机网络由通信子网和资源子网构成

按照距离分为局域网LAN和广域网WLAN。

局域网由一台或多台服务器和若干工作站组成。

客户机/服务器体系结构：Client/Server:cs架构

关键在于功能的分布化。
一些功能从传统的主机放到了客户机上，剩下的由服务器完成。
服务器负责整个系统的资源存储和管理
客户机发挥其他的作用，共同实现完整功能。

tcp/ip的cs架构：底层都是 物理层--链路层--网络层--传输层--应用层，底层实现客户端与服务端的通信
应用层实现client端和server端

网络中的常用组件

服务器：分为文件服务器、应用程序服务器、数据库服务器等
客户机(工作站)：靠服务器进行管理和提供服务的、连入网络的任何计算机都是工作站
网络适配器(网卡)
网络通信电缆(常用的双绞线，同轴电缆)
网络操作系统：NetWare、windou NT
协议：通过协议进行数据传输，是网络层间和设备间相互通信的语言和规范，90%以上的网络通信用TCP/IP协议
客户软件/服务软件

INTERNET 是一个由不同规模和类型的计算机网络组成的全球性计算机网络，核心是TCP/IP协议和相关技术。

TCP/IP协议

tcp/ip是个协议族！
TCP：传输控制协议、udp：用户数据协议、IP：Internet协议、FTP：文件传输协议、SMTP：简单邮件传输协议、ARP：地址解析协议

TCP/IP分为4层有时也是5层：应用层、传输层、网络层、接口层（链路层、物理层）

IP：网络地址+主机地址，分为ABCDEE类地址，
    a类子网掩码8位，0-126
    b类子网掩码16位，128-191
    c类24位。192-223

ip地址不好记，全是数，然后就有了域名，就是网址，域名还分层，由dns服务器将域名转换做ip。

几种数据通信服务

ADSL：非对称数字用户线路，拨号上网
ISDN：综合业务数据网，
ATM：异步传输模式
    技术特点：定长信元，高速传输，异步传输，多路复用，支持各种数据传输服务

Internet提供服务

Telnet：主机远程登录
FTP：远程文件传送，downnload，upload，还有匿名FTP服务
USENET
WWW服务，http服务（tc连接，80端口）
浏览器：源IP，目标IP，协议，源主机端口，目标主机端口
资源定位符URL
超文本标记语言HTML
超级链接：网页间的指向
XML

看一下HTML网页是怎么写的

数据仓库和数据挖掘

知识发现KDD和数据挖掘可以发现：

1.广义知识
2.关联知识
3.分类知识
4.预测性知识