【MySQL】MySQL与IO

    数据库作为存储系统,所有业务访问数据的操作都会转化为底层数据库系统的IO行为(缓存系统也可以当做是key-value的数据库),本文主要介绍访问mysql数据库的IO流程以及IO相关的参数。

一 MySQL 的文件

首先简单介绍一下MySQL的数据文件,MySQL 数据库包含如下几种文件类型:
数据文件 (datafile) 存放表中的具体数据的文件。
数据字典 记录数据库中所有innodb表的信息。
重做日志 (redolog) 记录数据库变更记录的文件,用于系统异常crash(掉电)后的恢复操作,可以配置多个比如 ib_logfile0、 ib_logfile1,
回滚日志 (undolog) 也存在于mysql 的ibdata文件,用户记录事务的回滚操作。
归档日志 (binlog) 事务提交之后,记录到归档日志中。
中继日志 (relaylog) 从master 获取到slave 的中转日志文件,sql_thread 则会应用relay log 
其他日志 slowlolg, errorlog, querylog

    对于以上文件的IO访问顺序可以分为顺序访问 比如binlog ,redolog ,relay log是顺序读写,datafile,ibdata file是随机读写,这些IO访问的特点决定了在os 配置磁盘信息时候,如何考虑分区 ,比如顺序写可以的log 可以放到SAS 盘 ,随机读写的数据文件可以放到ssd 或者fio 高性能的存储。

二 数据访问流程

数据库访问分为两种类型, 一种是读操作,另外一种是写操作。
1 读操作 
    create table t (
      id int not null primary key ,
      k1 int not null,
      data varchar(50),
      key ind_k1(k1)
     ) engine=innodb default charset=utf8;
   
以 select * from tab where k1=1 ;为例
    【MySQL】MySQL与IO_第1张图片
                                              图-1 读操作的 IO 流程
  1 查看缓存中是否存在id,
  2 如果有 则从内存中访问,否则要访问磁盘,
  3 并将索引数据存入内存,利用索引来访问数据,
  4 对于数据也会检查数据是否存在于内存,
  5 如果没有则访问磁盘获取数据,读入内存。
  6 返回结果给用户。

2 写操作
    为了保证数据写入操作的安全性,数据库系统设置了 undo,redo  保护机制,避免因为os或者数据库系统异常导致的数据丢失或者不一致的异常情况发生。
    以 insert into t values(1,1,'shuiyi');为例
  【MySQL】MySQL与IO_第2张图片
                               图-2 写操作的 IO 流程

我们假定数据在内存中,不考虑从磁盘中获取数据的情形。大致的写操作步骤:
   1 先写undo log 
   2 在内存更新数据
   3 记录变更到redo log,prepare 
   4 写入binlog
   5 redo log 第二阶段,commit  
   6 返回给client
 
如果有slave
   第4步之后 经过slave 服务线程 io_thread 写到从库的relay log ,再由sql thread 应用relay log 到从库中。

关于性能
     写undo redo log ,binlog的过程中都是顺序写,都会很快的完成,随机写操作,inset_buffer 功能
    对于非聚集类索引的插入和更新操作(5.5 版本及以上支持Update/Delete/Purge等操作的buffer功能),不是每一次都直接插入到索引页中,而是先插入到内存中。具体做法是:如果该索引页在缓冲池中,直接插入;否则,先将其放入插入缓冲区中,再以一定的频率和索引页合并,就可以将同一个索引页中的多个插入合并到一个IO操作中,改随机写为顺序写,大大提高写性能。
  关于数据安全,这是数据库写入的重点
    
     1,2,3  过程失败 就是事务失败,因为此时还未写入磁盘,对磁盘中的数据无影响,返回事务失败给client,从库也不会受到影响。
     4,5 过程失败的时候或者已经将写成功返回给客户,可以根据redo log 的记录来进行恢复,如果出现部分写失效 请参考《double write》
     mysql的写redo log的第一个阶段会把所有需要做的操作做完,记录数据变更,第二阶段的工作比较简单 ,只做事务提交确认。如果写入binlog 成功,而第二阶段失败,mysql 启动时也会将事务进行重做,最终更新到磁盘中。
     5.5 +的 smei sync  可以更好的保障主从的事务一致性。  

三 文件访问方式

    IO 访问的方式分为两种顺序读写和随机读写, 在mysql 的io过程中可以以此来将数据库文件分类
     顺序读写:
     重做日志  ib_logfile*,binlog file
     随机读写 
     innodb 表数据文件,ibdata文件。
  根据系统的访问类型,对硬件做如下分类
  读多 SSD+RAID
  写多 FIO(flashcache)
  容量密集 fio + flashcache
  由于随机io会严重降低系统的性能,在当前的硬件水平下,可以考虑选择奖数据库服务器配置ssd/fusionio。
  
四 影响IO的参数和策略

    影响mysql io 的参数有很多个,这里罗列几个重要的参数。 
    innodb_buffer_pool_size
    该参数控制innodb 缓存大小,用于缓存应用访问的数据,推荐配置为系统可用内存的80%。
    binlog_cache_size
    该参数控制二进制日志缓冲大小,当事务还没有提交时,事务日志存放于cache,当遇到大事务cache不够用的时,mysql会把uncommitted的部分写入临时文件,等到committed的时候才会写入正式的持久化日志文件。
    innodb_max_dirty_pages_pct
    该参数可以直接控制Dirty Page在BP中所占的比率,当dirty page 达到了该参数的阈值,就会触发MySQL 系统刷新数据到磁盘
  
    innodb_flush_log_at_trx_commit
    该参数确定日志文件何时write、flush。
为0,log buffer将每秒一次地写入log file中,并且log file的flush(刷到磁盘)操作同时进行.该模式下,在事务提交的时候,不会主动触发写入磁盘的操作。
为1,每次事务提交时MySQL都会把log buffer的数据写入log file,并且flush(刷到磁盘)中去.
为2,每次事务提交时MySQL都会把log buffer的数据写入log file.但是flush(刷到磁盘)操作并不会同时进行。该模式下,MySQL会每秒执行一次 flush(刷到磁盘)操作。
注意:
  由于进程调度策略问题,这个“每秒执行一次 flush(刷到磁盘)操作”并不是保证100%的“每秒”。
    sync_binlog
    sync_binlog 的默认值是0,像操作系统刷其他文件的机制一样,MySQL不会同步到磁盘中去而是依赖操作系统来刷新binary log。
当sync_binlog =N (N>0) ,MySQL 在每写 N次 二进制日志binary log时,会使用fdatasync()函数将它的写二进制日志binary log同步到磁盘中去。
   innodb_flush_method
   该参数控制日志或数据文件如何write、flush。可选的值为 fsync, o_dsync ,o_direct,littlesync,nosync
  fdatasync 模式:写数据时,write这一步并不需要真正写到磁盘才算完成(可能写入到操作系统buffer中就会返回完成),真正完成是flush操作,buffer交给操作系统去flush,并且文件的元数据信息也都需要更新到磁盘。
  O_DSYNC 模式:写日志操作是在write这步完成,而数据文件的写入是在flush这步通过fsync完成
  O_DIRECT模式:数据文件的写入操作是直接从mysql innodb buffer到磁盘的,并不用通过操作系统的缓冲,而真正的完成也是在flush这步,日志还是要经过OS缓冲
  注意:关于mysql 和io相关的参数,并不是一成不变的,需要根据自身业务系统和硬件系统做相应调整,系统上线之前,测试出一个最佳值。


五 小结
    数据库的io是一个很复杂和细致的知识层面,涉及数据库层和OS层面的IO写入策略,也和硬件的配置有关,本文主要针对MySQL 层面做分析,可能分析的不够全面,请各位朋友指点。

六 参考文档
http://www.percona.com/doc/percona-server/5.6/scalability/innodb_io.html
http://www.orczhou.com/index.php/2009/08/innodb_flush_method-file-io/




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