DCM4CHE解压缩的DICOM文件

概要

上一篇博客
DCM4CHE图像显示
是针对未压缩的dicom文件的显示处理，那对于压缩的dicom文件该怎样处理呢？
本文就介绍带压缩协议的dicom文件处理。

一.查看dicom的压缩协议 (也可以通过第三方dicom查看软件查看，tag:0020,0010)

		DicomInputStream dis = new DicomInputStream(new File("D:/dicomFile/test/11.dcm"));	
    	System.out.println(dis.getTransferSyntax());

结果：

这里的1.2.840.10008.1.2.4.70(JPEG Lossless)，是就是当前dicom的压缩协议，当然这只是其中一种压缩协议，详细压缩协议见DICOM之Transfer Syntax，这里就不再赘述了。

二.解压缩dicom文件

1. 添加对应的dcm4che的jar包
   在pom.xml里:

		<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-imageio</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
		</dependency>
		<dependency>
			<groupId>org.dcm4che</groupId>
			<artifactId>dcm4che-imageio-opencv</artifactId>
			<version>5.21.0</version>
			<scope>runtime</scope>
		</dependency>

在eclipse里加入opencv的动态链接库(如果你是通过源码编译的dcm4che，在你编译的dcm4che-assembly\target\dcm4che-5.21.0-bin\dcm4che-5.21.0\lib路径下，要是直接从网上下的编译好的直接就在lib目录下)，直接在下面的界面

2. 开始解压

import java.io.File;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.io.OutputStream;
import java.nio.file.Files;
import org.dcm4che3.data.Attributes;
import org.dcm4che3.data.UID;
import org.dcm4che3.imageio.codec.Transcoder;

public class Dcm4cheTranscode {
	public static void main(String[] args) {
		File src = new File("D:/dicomFile/test/11.dcm"); //带有压缩协议的dicom原始文件
		File dest = new File("D:/dicomFile/test/33.dcm"); //解压成未压缩的dicom目标文件
		
		try {
			transcodeWithTranscoder(src, dest);
		} catch (IOException e) {
			e.printStackTrace();
		}
	}
	
	public static void transcodeWithTranscoder(File src, final File dest) throws IOException {
		try (Transcoder transcoder = new Transcoder(src)) {
            transcoder.setDestinationTransferSyntax(UID.ExplicitVRLittleEndian);
            transcoder.transcode(new Transcoder.Handler(){
                @Override
                public OutputStream newOutputStream(Transcoder transcoder, Attributes dataset) throws IOException {
                    return new FileOutputStream(dest);
                }
            });
        } catch (Exception e) {
            Files.deleteIfExists(dest.toPath());
            throw e;
        }
	}
}

结果：

你会发现解压后的文件比解压前的大很多，我们用第三方dicom文件查看器RadiAnt打开dicom文件发现，两者的图像数据存储格式发生变化了。
11.dcm:

33.dcm:

3. 显示

就可以把33.dcm参考我的博客 DCM4CHE图像显示,显示到图片里了。