3Dslicer学(在slicer中编程)

1.Slicer的模块:

CLI(命令行交互)

Python脚本模块:这个是特色,我们可以用python控制台去访问数据,对象,GUI,处理库(numpy,VTK,ITK,CTK等)

可加载的模块:用于优化计算,是C++插件。

本学习部分的目标是实现拉普拉斯滤波。

2.python在slicer的版本是2.7:打开python交互器:
3Dslicer学(在slicer中编程)_第1张图片
**3.**加载一个MRI数据,名字是name,格式是nrrd。

4.在控制台输入a=slicer.util.array(‘name’)来获取3D图像每个位置的值,这个值不是灰度值,是MRI成像原理里得到的值。因此我的数据里,a.max()是279,比255大。

而且a的类型此时就是numpy的ndarray,从而很方便进行处理。

5.创建一个GUI来执行特定的函数功能:

首先定义好函数,假设函数名为test(),然后

b=qt.QPushButton(‘123’)#参数是按钮名字

b.connect(‘clicked’,test)#表示按钮的触发方式和触发的功能即执行的函数

b.show()

**6.**把自己写的脚本集成为3Dslicer的模块:首先创建一个扩展:

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