- 高通量测序的数据处理与分析指北(二)--宏基因组篇
lantary
博客原文宏基因组篇前言之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理,这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前,我们先来认识一下什么是宏基因组。以我的理解,宏基因组就是某环境中所有生物的基因组的合集,这个环境可以是下水道,河流等自然环境,也可以是人体内肠道,口腔等体环境。而宏基因组中的生物往往指的是微生物,如真菌,细菌,病毒,古细菌。我们这里主要以肠道微生物
- 【Python系列】异步任务的终止
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s2Pythonpython开发语言
欢迎来到我的博客,很高兴能够在这里和您见面!希望您在这里可以感受到一份轻松愉快的氛围,不仅可以获得有趣的内容和知识,也可以畅所欲言、分享您的想法和见解。推荐:kwan的首页,持续学习,不断总结,共同进步,活到老学到老导航檀越剑指大厂系列:全面总结java核心技术,jvm,并发编程redis,kafka,Spring,微服务等常用开发工具系列:常用的开发工具,IDEA,Mac,Alfred,Git,
- 【Python系列】使用切片移动元素位置
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- Java Kafka生产者实现
stormsha
Javawebjavakafkalinq
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- python系列:[Python]在VSCode中搭建Python开发环境
坦笑&&life
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[Python]在VSCode中搭建Python开发环境[Python]在VSCode中搭建Python开发环境前言安装1.安装VSCode的Python插件2.选择python解释器3.运行代码配置python检查项安装对应的库修改vscode的配置文件[Python]在VSCode中搭建Python开发环境前言之前用过Anaconda下的Spyder、Pycharm和Jupyter等写过pyt
- linux基础命令-管道符“|”
gaozhanghappy001
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管道符与命令结合应用:实现文本数据处理与分析在Linux操作系统中,管道符|是一个强大的工具,它允许将一个命令的输出直接传递给另一个命令的输入,实现不同命令之间的协同工作。结合管道符和各种命令,您可以在文本数据处理和分析方面做出令人惊叹的事情。本文将深入探讨使用管道符与一些常用命令结合的应用案例、原理以及实际操作。管道符的基本原理管道符|在Linux中的工作原理很简单。当您运行一个命令并在其后添加
- 【Python系列】中位数计算
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s2Pythonpython开发语言
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- webGIS后端程序员学习路线
听忆.
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webGIS后端程序员学习路线1.GIS基础知识学习要点:学习资源:2.后端编程基础学习要点:学习资源:3.地理数据库(SpatialDatabase)学习要点:学习资源:4.空间数据处理与分析学习要点:学习资源:5.WebGIS服务器与Web服务学习要点:学习资源:6.缓存与优化学习要点:学习资源:7.前后端交互学习要点:学习资源:8.项目实战总结学习路线边走、边悟迟早会好WebGIS(WebG
- python系列:FASTAPI 11-请求BODY的嵌套模型创建
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FASTAPI11-请求BODY的嵌套模型创建FASTAPI11-请求BODY的嵌套模型创建前言一、声明属性子类型二、嵌套模型1.定义子模型2.深度嵌套模型总结FASTAPI11-请求BODY的嵌套模型创建前言使用FastAPI,你可以定义、校验、记录文档并使用任意深度嵌套的模型,使用Pydantic创建模型一、声明属性子类型将一个属性定义为拥有子元素的类型,首先,从Python的标准库typin
- 【Spark高级应用】使用Spark进行高级数据处理与分析
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大数据sparkajax大数据
Spark高级应用使用Spark进行高级数据处理与分析引言在大数据时代,快速处理和分析海量数据是每个企业面临的重大挑战。ApacheSpark作为一种高效的分布式计算框架,凭借其高速、易用、通用和灵活的特点,已经成为大数据处理和分析的首选工具。本文将深入探讨如何使用Spark进行高级数据处理与分析,通过实际案例和代码示例,帮助你掌握Spark的高级应用技巧。提出问题如何进行高效的大规模数据处理?如
- python系列:已解决error: subprocess-exited-with-error
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已解决error:subprocess-exited-with-error已解决error:subprocess-exited-with-error报错问题报错翻译报错信息翻译如下:报错原因报错原因:解决方法1(1)安装setuptools:(2)安装微软的VSInstall,把你的操作系统包和改装的库装上:(3)然后再次安装lxml模块试试:解决方法2(适用于所有模块安装)已解决error:su
- python系列之:读取yaml文件
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日常分享专栏python系列读取yaml文件
python系列之:读取yaml文件一、yaml文件二、读取yaml文件一、yaml文件data.ymlname:刘备power:80000foods:-apple-orangehobby:sport:footballgame:fight二、读取yaml文件importyamlwithopen("/data/firstProject/data.yml")asf:print(yaml.load(f,
- 13 Python面向对象编程:装饰器
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本篇是Python系列教程第13篇,更多内容敬请访问我的Python合集Python装饰器是一种强大的工具,用于修改或增强函数或方法的行为,而无需更改其源代码。装饰器本质上是一个接收函数作为参数的函数,并返回一个新的函数。装饰器的用途包括日志记录、性能测试、事务处理、缓存、权限校验等1基本语法装饰器的基本语法是在函数定义之前使用@符号,紧跟着装饰器的名字。例如:#定义一个装饰器,参数为被装饰的方法
- 高校为什么需要AIGC大数据实验室?
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AIGC大数据实验室是一个专注于人工智能生成内容(AIGC)和大数据相关技术研究、开发与应用的创新实验平台。AIGC主要研究方向包括:AIGC技术创新、大数据处理与分析、AIGC与大数据融合应用。AIGC技术创新:探索如何利用人工智能算法,如深度学习中的生成对抗网络(GAN)、变分自编码器(VAE)、基于Transformer架构的语言模型(如GPT系列)等,来高效地生成高质量的文本、图像、音频、
- python基础(17面试题附答案二)
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- 个性化推荐系统-离线召回模型验证
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- 【Python系列】signal信号处理
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- STM32智能医疗监控系统教程
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目录引言环境准备智能医疗监控系统基础代码实现:实现智能医疗监控系统4.1数据采集模块4.2数据处理与分析模块4.3通信与网络系统实现4.4用户界面与数据可视化应用场景:医疗监控与优化问题解决方案与优化收尾与总结1.引言智能医疗监控系统通过STM32嵌入式系统结合各种传感器、执行器和通信模块,实现对医疗数据的实时监控、自动处理和数据传输。本文将详细介绍如何在STM32系统中实现一个智能医疗监控系统,
- 6 Python运算符和表达式
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本篇是Python系列教程第6篇,更多内容敬请访问我的Python专栏Python运算符和Java类似,但也有个别不同。Python表达式和Java的区别是Python表达式不用跟“;”结尾。1算术运算符算术运算符用于执行基本的数学运算,如加减乘除等。加法(+):将两个数相加。result=5+3#结果为8减法(-):从第一个数减去第二个数。result=10-3#结果为7乘法(*):两个数相乘。
- python基础(09闭包&装饰器)
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- python基础(06控制语句)
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- python基础(08类和对象)
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- Python系列:pip安装地址--清华源(国内常用镜像源)
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#pythonpythonpip开发语言
pip安装地址--清华源(国内常用镜像源)pip安装地址--清华源(国内常用镜像源)国内常用镜像源————————————————1、临时使用2、永久使用pip安装地址–清华源(国内常用镜像源)国内常用镜像源清华大学:https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/阿里云:http://mirrors.aliyun.com/pypi/simple/中国科学技术大学
- Python系列:Python中比较大小的几种方法
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#pythonpython开发语言
Python中比较大小的几种方法Python中比较大小的几种方法一、if语句实现比较大小二、使用max()和min()函数实现大小比较三、使用sorted()函数实现大小比较四、使用cmp()函数实现大小比较五、使用operator模块实现大小比较六、小结Python中比较大小的几种方法更新:2023-06-0113:28Python中比较大小是编程中常用的操作之一,在实际开发中,我们经常需要比较
- 高通量测序的数据处理与分析(二)-宏基因组2
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博客原文宏基因组数据处理方法数据下载wget下载宏基因组的数据主要分布在两个数据库:1.NCBI的SRA数据库,2.ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库:NGDC你可以直接通过网页下载数据,或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到sra-exporter这个网站上输入项目号获得样本的下载链接。用wget或者其他下载工具进行下载,示例的命令如下:wget-cftp://
- Python系列(17)—— 位运算符
隐私无忧
万花筒#Pythonpython
Python中的位运算符(BitwiseOperator)一、引言位运算符是直接对整数的二进制位进行操作的运算符。在Python中,位运算符可以对整数进行位级别的运算,如按位与(AND)、按位或(OR)、按位异或(XOR)、按位取反(NOT)等。这些运算符在底层系统编程、算法优化、网络通信等领域有广泛的应用。二、位运算符介绍按位与(&):对应位都为1时,结果位才为1,否则为0。按位或(|):对应位
- Python系列(10)—— 逻辑运算符
隐私无忧
万花筒#Pythonpython
在Python中,逻辑运算符被用于连接布尔表达式,从而根据这些表达式的真假值来执行相应的操作。Python提供了三种基本的逻辑运算符:and(与)、or(或)和not(非)。1.and运算符and运算符用于连接两个布尔表达式。当两个表达式都为True时,整个表达式的结果才为True。#示例:检查两个条件是否同时满足a=5b=10ifa>3andb3orb10:print("a不大于10")else
- 「Python系列」Python运算符
雪梅零落
Python系列专栏python开发语言
文章目录一、Python运算符二、Python简介三、相关链接一、Python运算符Python支持多种运算符,包括算术运算符、比较运算符、逻辑运算符、位运算符等等。以下是这些运算符的简要概述和相应的案例代码:算术运算符:用于基本的数学运算。加法(+):python`a=5+3#a的值为8减法(-):python`b=5-3#b的值为2乘法(*):python`c=5*3#c的值为15除法(/):
- Python系列(13)—— 三元运算符
隐私无忧
#Oracle#Pythonpython开发语言
在Python中,三元运算符(TernaryOperator)是一种简洁的条件表达式,它允许我们在一行代码中执行简单的条件判断。三元运算符的格式如下:value_if_trueifconditionelsevalue_if_false如果condition为True,则整个表达式的值为value_if_true;如果condition为False,则整个表达式的值为value_if_false。示
- java类加载顺序
3213213333332132
java
package com.demo;
/**
* @Description 类加载顺序
* @author FuJianyong
* 2015-2-6上午11:21:37
*/
public class ClassLoaderSequence {
String s1 = "成员属性";
static String s2 = "
- Hibernate与mybitas的比较
BlueSkator
sqlHibernate框架ibatisorm
第一章 Hibernate与MyBatis
Hibernate 是当前最流行的O/R mapping框架,它出身于sf.net,现在已经成为Jboss的一部分。 Mybatis 是另外一种优秀的O/R mapping框架。目前属于apache的一个子项目。
MyBatis 参考资料官网:http:
- php多维数组排序以及实际工作中的应用
dcj3sjt126com
PHPusortuasort
自定义排序函数返回false或负数意味着第一个参数应该排在第二个参数的前面, 正数或true反之, 0相等usort不保存键名uasort 键名会保存下来uksort 排序是对键名进行的
<!doctype html>
<html lang="en">
<head>
<meta charset="utf-8&q
- DOM改变字体大小
周华华
前端
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml&q
- c3p0的配置
g21121
c3p0
c3p0是一个开源的JDBC连接池,它实现了数据源和JNDI绑定,支持JDBC3规范和JDBC2的标准扩展。c3p0的下载地址是:http://sourceforge.net/projects/c3p0/这里可以下载到c3p0最新版本。
以在spring中配置dataSource为例:
<!-- spring加载资源文件 -->
<bean name="prope
- Java获取工程路径的几种方法
510888780
java
第一种:
File f = new File(this.getClass().getResource("/").getPath());
System.out.println(f);
结果:
C:\Documents%20and%20Settings\Administrator\workspace\projectName\bin
获取当前类的所在工程路径;
如果不加“
- 在类Unix系统下实现SSH免密码登录服务器
Harry642
免密ssh
1.客户机
(1)执行ssh-keygen -t rsa -C "
[email protected]"生成公钥,xxx为自定义大email地址
(2)执行scp ~/.ssh/id_rsa.pub root@xxxxxxxxx:/tmp将公钥拷贝到服务器上,xxx为服务器地址
(3)执行cat
- Java新手入门的30个基本概念一
aijuans
javajava 入门新手
在我们学习Java的过程中,掌握其中的基本概念对我们的学习无论是J2SE,J2EE,J2ME都是很重要的,J2SE是Java的基础,所以有必要对其中的基本概念做以归纳,以便大家在以后的学习过程中更好的理解java的精髓,在此我总结了30条基本的概念。 Java概述: 目前Java主要应用于中间件的开发(middleware)---处理客户机于服务器之间的通信技术,早期的实践证明,Java不适合
- Memcached for windows 简单介绍
antlove
javaWebwindowscachememcached
1. 安装memcached server
a. 下载memcached-1.2.6-win32-bin.zip
b. 解压缩,dos 窗口切换到 memcached.exe所在目录,运行memcached.exe -d install
c.启动memcached Server,直接在dos窗口键入 net start "memcached Server&quo
- 数据库对象的视图和索引
百合不是茶
索引oeacle数据库视图
视图
视图是从一个表或视图导出的表,也可以是从多个表或视图导出的表。视图是一个虚表,数据库不对视图所对应的数据进行实际存储,只存储视图的定义,对视图的数据进行操作时,只能将字段定义为视图,不能将具体的数据定义为视图
为什么oracle需要视图;
&
- Mockito(一) --入门篇
bijian1013
持续集成mockito单元测试
Mockito是一个针对Java的mocking框架,它与EasyMock和jMock很相似,但是通过在执行后校验什么已经被调用,它消除了对期望 行为(expectations)的需要。其它的mocking库需要你在执行前记录期望行为(expectations),而这导致了丑陋的初始化代码。
&nb
- 精通Oracle10编程SQL(5)SQL函数
bijian1013
oracle数据库plsql
/*
* SQL函数
*/
--数字函数
--ABS(n):返回数字n的绝对值
declare
v_abs number(6,2);
begin
v_abs:=abs(&no);
dbms_output.put_line('绝对值:'||v_abs);
end;
--ACOS(n):返回数字n的反余弦值,输入值的范围是-1~1,输出值的单位为弧度
- 【Log4j一】Log4j总体介绍
bit1129
log4j
Log4j组件:Logger、Appender、Layout
Log4j核心包含三个组件:logger、appender和layout。这三个组件协作提供日志功能:
日志的输出目标
日志的输出格式
日志的输出级别(是否抑制日志的输出)
logger继承特性
A logger is said to be an ancestor of anothe
- Java IO笔记
白糖_
java
public static void main(String[] args) throws IOException {
//输入流
InputStream in = Test.class.getResourceAsStream("/test");
InputStreamReader isr = new InputStreamReader(in);
Bu
- Docker 监控
ronin47
docker监控
目前项目内部署了docker,于是涉及到关于监控的事情,参考一些经典实例以及一些自己的想法,总结一下思路。 1、关于监控的内容 监控宿主机本身
监控宿主机本身还是比较简单的,同其他服务器监控类似,对cpu、network、io、disk等做通用的检查,这里不再细说。
额外的,因为是docker的
- java-顺时针打印图形
bylijinnan
java
一个画图程序 要求打印出:
1.int i=5;
2.1 2 3 4 5
3.16 17 18 19 6
4.15 24 25 20 7
5.14 23 22 21 8
6.13 12 11 10 9
7.
8.int i=6
9.1 2 3 4 5 6
10.20 21 22 23 24 7
11.19
- 关于iReport汉化版强制使用英文的配置方法
Kai_Ge
iReport汉化英文版
对于那些具有强迫症的工程师来说,软件汉化固然好用,但是汉化不完整却极为头疼,本方法针对iReport汉化不完整的情况,强制使用英文版,方法如下:
在 iReport 安装路径下的 etc/ireport.conf 里增加红色部分启动参数,即可变为英文版。
# ${HOME} will be replaced by user home directory accordin
- [并行计算]论宇宙的可计算性
comsci
并行计算
现在我们知道,一个涡旋系统具有并行计算能力.按照自然运动理论,这个系统也同时具有存储能力,同时具备计算和存储能力的系统,在某种条件下一般都会产生意识......
那么,这种概念让我们推论出一个结论
&nb
- 用OpenGL实现无限循环的coverflow
dai_lm
androidcoverflow
网上找了很久,都是用Gallery实现的,效果不是很满意,结果发现这个用OpenGL实现的,稍微修改了一下源码,实现了无限循环功能
源码地址:
https://github.com/jackfengji/glcoverflow
public class CoverFlowOpenGL extends GLSurfaceView implements
GLSurfaceV
- JAVA数据计算的几个解决方案1
datamachine
javaHibernate计算
老大丢过来的软件跑了10天,摸到点门道,正好跟以前攒的私房有关联,整理存档。
-----------------------------华丽的分割线-------------------------------------
数据计算层是指介于数据存储和应用程序之间,负责计算数据存储层的数据,并将计算结果返回应用程序的层次。J
&nbs
- 简单的用户授权系统,利用给user表添加一个字段标识管理员的方式
dcj3sjt126com
yii
怎么创建一个简单的(非 RBAC)用户授权系统
通过查看论坛,我发现这是一个常见的问题,所以我决定写这篇文章。
本文只包括授权系统.假设你已经知道怎么创建身份验证系统(登录)。 数据库
首先在 user 表创建一个新的字段(integer 类型),字段名 'accessLevel',它定义了用户的访问权限 扩展 CWebUser 类
在配置文件(一般为 protecte
- 未选之路
dcj3sjt126com
诗
作者:罗伯特*费罗斯特
黄色的树林里分出两条路,
可惜我不能同时去涉足,
我在那路口久久伫立,
我向着一条路极目望去,
直到它消失在丛林深处.
但我却选了另外一条路,
它荒草萋萋,十分幽寂;
显得更诱人,更美丽,
虽然在这两条小路上,
都很少留下旅人的足迹.
那天清晨落叶满地,
两条路都未见脚印痕迹.
呵,留下一条路等改日再
- Java处理15位身份证变18位
蕃薯耀
18位身份证变15位15位身份证变18位身份证转换
15位身份证变18位,18位身份证变15位
>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>
蕃薯耀 201
- SpringMVC4零配置--应用上下文配置【AppConfig】
hanqunfeng
springmvc4
从spring3.0开始,Spring将JavaConfig整合到核心模块,普通的POJO只需要标注@Configuration注解,就可以成为spring配置类,并通过在方法上标注@Bean注解的方式注入bean。
Xml配置和Java类配置对比如下:
applicationContext-AppConfig.xml
<!-- 激活自动代理功能 参看:
- Android中webview跟JAVASCRIPT中的交互
jackyrong
JavaScripthtmlandroid脚本
在android的应用程序中,可以直接调用webview中的javascript代码,而webview中的javascript代码,也可以去调用ANDROID应用程序(也就是JAVA部分的代码).下面举例说明之:
1 JAVASCRIPT脚本调用android程序
要在webview中,调用addJavascriptInterface(OBJ,int
- 8个最佳Web开发资源推荐
lampcy
编程Web程序员
Web开发对程序员来说是一项较为复杂的工作,程序员需要快速地满足用户需求。如今很多的在线资源可以给程序员提供帮助,比如指导手册、在线课程和一些参考资料,而且这些资源基本都是免费和适合初学者的。无论你是需要选择一门新的编程语言,或是了解最新的标准,还是需要从其他地方找到一些灵感,我们这里为你整理了一些很好的Web开发资源,帮助你更成功地进行Web开发。
这里列出10个最佳Web开发资源,它们都是受
- 架构师之面试------jdk的hashMap实现
nannan408
HashMap
1.前言。
如题。
2.详述。
(1)hashMap算法就是数组链表。数组存放的元素是键值对。jdk通过移位算法(其实也就是简单的加乘算法),如下代码来生成数组下标(生成后indexFor一下就成下标了)。
static int hash(int h)
{
h ^= (h >>> 20) ^ (h >>>
- html禁止清除input文本输入缓存
Rainbow702
html缓存input输入框change
多数浏览器默认会缓存input的值,只有使用ctl+F5强制刷新的才可以清除缓存记录。
如果不想让浏览器缓存input的值,有2种方法:
方法一: 在不想使用缓存的input中添加 autocomplete="off";
<input type="text" autocomplete="off" n
- POJO和JavaBean的区别和联系
tjmljw
POJOjava beans
POJO 和JavaBean是我们常见的两个关键字,一般容易混淆,POJO全称是Plain Ordinary Java Object / Pure Old Java Object,中文可以翻译成:普通Java类,具有一部分getter/setter方法的那种类就可以称作POJO,但是JavaBean则比 POJO复杂很多, Java Bean 是可复用的组件,对 Java Bean 并没有严格的规
- java中单例的五种写法
liuxiaoling
java单例
/**
* 单例模式的五种写法:
* 1、懒汉
* 2、恶汉
* 3、静态内部类
* 4、枚举
* 5、双重校验锁
*/
/**
* 五、 双重校验锁,在当前的内存模型中无效
*/
class LockSingleton
{
private volatile static LockSingleton singleton;
pri