Gephi作网络图

效果

下面是我根据博客园的粉丝关系数据做出的图。博客园的博客用户有20W左右，我只爬到了17万用户以及其间的80W个粉丝关系，其余3W多用户应该是孤岛用户。但是我爬到的这些数据量对Gephi而言计算量太大了，我用实验室的服务器仍然慢得不行，好久都刷不出图。为了学习使用Gephi我只用了5000左右的用户及其间7000左右的粉丝关系花了这张图。点表示博客用户，用博客用户名标注；线表示粉丝关系，可以很清晰的看到几个博客大牛和其众多粉丝形成的社区。

我的输入数据是.csv格式，开头几行如下：

445574,Gavin_Liu
Dillonn,Gavin_Liu
wait,Gavin_Liu
710309,Gavin_Liu
bo5509,Gavin_Liu

其中逗号前是src，逗号后是dest。

安装

Gephi主页 http://gephi.github.io/ 有下载链接。
JRE1.8环境下Gephi不能启动，需要在JRE1.7。
Gephi的配置文件（路径 C:\Program Files\Gephi-0.8.2\etc\getphi.conf ）有 这样一行

default_options="--branding gephi -J-Xms64m -J-Xmx400m -J-Xverify:none -J-Dsun.java2d.noddraw=true -J-Dsun.awt.noerasebackground=true -J-Dnetbeans.indexing.noFileRefresh=true -J-Dplugin.manager.check.interval=EVERY_DAY -J-Duser.language=en"

如果输入数据量大，需要的内存多，就要将-J-Xmx400m 调大，如-J-Xmx1024m 。实际上，该项调得大了超过了Java虚拟机的设置，会出错；调得小了不够用，也会出错。在Linux下或者64位系统下Java虚拟机的默认设置的内存比32位下大，所以如果数据量大建议在64位系统下安装运行。

学习资料：

Gephi主页有学习资料的链接 http://gephi.github.io/users/，下面介绍几个：

• 《gephi-tutorial-quick_start.pdf》
  这个资料上有一个完整的例子，跟着走下来，就可以制作基本的图了。
• gephi-tutorial-layouts.pdf
  介绍了软件中几个算法选项，有效果展示。
• gephi-tutorial-visualization.pdf
  介绍了一些选项设置的用法。

还有几个晚上照的资源

• Gephi中文教程
  http://download.csdn.net/detail/x1z2w3/7628743
• Gephi快速入门指南
  http://wenku.baidu.com/view/34d43bcefab069dc502201eb.html
• gephi 简要教程
  http://zhiyuan.sjtu.edu.cn/Course/gephi.pdf
• 利用python、Gephi绘制人人的社交网络图
  http://blog.csdn.net/zdw12242/article/details/8687644

Java内存上的问题的帖子：

• http://gephi.github.io/users/install/
• Java虚拟机支持的最大内存限制
  http://my.oschina.net/aiguozhe/blog/59062