分子图形软件MOL4D(6)Ribbons




MOL4D分子图形系列软件

RIBBONs

蛋白质高级造型


图1 先要利用MOL4D(P增强型)提取各种蛋白质分子主链(黄色),以供RIBBONS 造型使用, RIBBONS 本身不接触复杂的蛋白质分子文件。


分子图形软件MOL4D(6)Ribbons_第1张图片
图2  进入RIBBONS软件先
利用 Load命令选择一个主链文件并作大小、角度的调整,再用Model产生下面所有图形。



图3 利用RIBBONs,根据主链可画出扁平折叠式带状模型


图4 用RIBBON画出双面填充颜色的折叠式带状模型


图5 用RIBBON画出双面填充颜色的折叠式带状模型


6 用RIBBON画出光滑扁带状模型


图7RIBBON画出光滑的圆模型



8 用RIBBON画出光滑丝带状模型



图9 用RIBBON画出光滑带状模型,此带应加厚度会更好。



图10 用RIBBON画出卡通模型,将alpha螺旋用一圆柱体表示,即所谓的carton图



图11 用RIBBONs 画出carton图,再把相互间的折线形连线
光滑成曲线


图12 用RIBBON画出彩色卡通模型



图13 体视对(适宜于打印输出)



图14 原有封面


注:上述图形都是在下的程序匆促完成并记录成图片,现在看来还可做的更精细些,例如抗锯齿,为各种扁平带子加点厚度,卡通图端点连接...,这些问题在移植到windows后需要加以考虑。下面这个图是Win7下利用DOSBOX直接运行DOS软件RIBBONS得到,但接下来的上述其他图形要使用1024*768,256色的图形模式,在DOSBOX下无法产生:

分子图形软件MOL4D(6)Ribbons_第2张图片

说明:在win7下利用DOSBOX可直接运行DOS的RIBBONS软件。RIBBONS先利用Load命令在640*480标准VGA图形模式打开一幅分子图形,调整图像大小和角度,这些工作完全正常。然后在选择一种Model 进入VESA标准的1024*768高分辨率造型时产生错误。这就是说,DOSBOX仅支持标准VGA,不支持VESA标准的1024*768模式,否则就可以利用它在win7下来产生前面所有图形。


 


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