来源:http://blog.csdn.net/lilib/archive/2010/04/15/5487165.aspx
第一篇 cut
常用参数:
-c 根据字符,用法:cut -cnum1-num2 filename 截取num1~num2之间的字符,字符从1开始记。
-f 根据域,默认为tab分隔
-d 定义域分隔符
范例:
shell> cat example
test2
this is test1
shell> cut -c1-6 example ## print 开头算起前 6 个字元
test2
this i
-c m-n 表示显示每一行的第m个字元到第n个字元。例如:
---------file-----------
liubi 23 14000
---------file-----------
# cut -c 1-5,10-14 file
liubi 14000
-f m-n 表示显示第m栏到第n栏(使用tab分隔)。例如:
---------file-----------
liubi 23 14000
---------file-----------
# cut -f 1,3 file
liubi 14000
-c 和 -f 参数可以跟以下子参数:
m 第m个字符或字段
m- 从第m个字符或字段到文件结束
m-n 从第m个到第n个字符或字段
-n 从第1个到第n个字符或字段
我们经常会遇到需要取出分字段的文件的某些特定字段,例如 /etc/password就是通过":"分隔各个字段的。可以通过cut命令来实现。例如,我们希望将系统账号名保存到
特定的文件,就可以:
cut -d: -f 1 /etc/passwd > /tmp/users
-d用来定义分隔符,默认为tab键,-f表示需要取得哪个字段
如:
使用|分隔
cut -d'|' -f2 1.test>2.test
使用:分隔
cut -d':' -f2 1.test>2.test
这里使用单引号或双引号皆可。
对于特殊字符用/来转义(以“-”为分隔符切割后,要第一个字段):
BGIOSGA005099-TA
BGIOSGA005310-TA
cut -d/- -f 1 file >out
或者:cut "/-" -f 1 file >out
cut的死对头:paste
paste file1 file2 >file3
把文件1与文件2按列合并(有没有发现跟cut正好相反呢?)
$ less 111
abc ddd eee
$ less 222
123 444 555
$ paste 111 222 >333
$ less 333
abc ddd eee 123 444 555
用-d参数可以自定义分隔符
$ paste -d: 111 222 >444
$ less 444
abc ddd eee:123 444 555
paste命令还有一个很有用的选项"-"。意即对每一个"-",从标准输入中读一次数据。-d参数来定义分隔符。以一个3列格式显示目录列表。方法如下:
$ ls |paste -d: - - - #注意,"-"和"-"之间有空格
block_info_down_1000:block_info_down_3000:sv_test
block_info_up1000:block_info_up3000:module_indel_sv
module_testld:regulation_region_down.pl
sample.Q20.down1000:sample.Q20.down3000:sample.Q20.up1000
sample.Q20.up3000:sample_to_9311.snp.Q20.filter.sort:sample_to_test
第二篇 awk
awk 用法:awk ' pattern {action} '
变量名 含义
ARGC 命令行变元个数
ARGV 命令行变元数组
FILENAME 当前输入文件名
FNR 当前文件中的记录号
FS 输入域分隔符,默认为一个空格
RS 输入记录分隔符
NF 当前记录里域个数
NR 到目前为止记录数
OFS 输出域分隔符
ORS 输出记录分隔符
用法介绍:
1,模式匹配
awk '/zqy/' fileA #寻找出fileA中含有zqy的行 等同于awk '$0~/zqy/' fileA
awk '$1~/88/' fileA #找出第一个域里面包含88的行
awk '$1~/88/{print $2}' fileA #找出第一个域里面包含88的行后,只打印该行的第二个域
2,对不同的域进行操作
awk '$2 >25 && $2<=55' fileA #找出第二个域里面满足条件的行,可以加上{print $n}来打印任意域
############### fileB #################
884 46 1 8 5 944
734 41 0 10 2 787
647 29 1 8 1 686
536 26 1 9 0 572
############### fileB #################
$ less fileB
884 46 1 8 5 944
734 41 0 10 2 787
647 29 1 8 1 686
536 26 1 9 0 572
$awk '{print NR,NF,$NF}' fileB # NR:文件当前记录号(在这里可以理解为行数); NF:总的域的个数(可以理解为列数); $NF:想一想是什么东西吧?再不知道就撞墙去吧。
1 6 944
2 6 787
3 6 686
4 6 572
3,通过-F参数来改变域分隔符,FS设置输入分隔符,OFS设置输出分隔符,awk所有操作都支持管道。如:
df | awk '$4>1000000 ' 通过管道符获得输入,如:显示第4个域满足条件的行。
awk -F "|" '{print $1}' file 按照新的分隔符“|”进行操作。
awk 'BEGIN { FS="[: /t|]"}{print $1,$2,$3}' file 通过设置输入分隔符(FS="[: /t|]")修改输入分隔符。BEGIN 表示在处理任意行之前进行的操作。
awk 'BEGIN { OFS="%"} {print $1,$2,$3}' file 通过设置输出分隔符(OFS="%")修改输出格式。
Sep="|"
awk -F $Sep '{print $1}' file 按照环境变量Sep的值做为分隔符。
awk -F '[ :/t|]' '{print $1}' file 按照正则表达式的值做为分隔符,这里代表空格、:、TAB、|同时做为分隔符。
awk -F '[][]' '{print $1}' file 按照正则表达式的值做为分隔符,这里代表[、]
4、
awk -f awkfile file 通过文件awkfile的内容依次进行控制。
cat awkfile
/101/{print "/047 Hello! /047"} --遇到匹配行以后打印 ' Hello! './047代表单引号。
{print $1,$2} --因为没有模式控制,打印每一行的前两个域。
5、
awk 'BEGIN { max=100 ;print "max=" max} {max=($1 >max ?$1:max); print $1,"Now max is "max}' file 取得文件第一个域的最大值。
awk '{print ($1>4 ? "high "$1: "low "$1)}' file
6、
awk '{$1 == 'Chi' {$3 = 'China'; print}' file 找到匹配行后先将第3个域替换后再显示该行(记录)。
awk '{$7 %= 3; print $7}' file 将第7域被3除,并将余数赋给第7域再打印。
7、
awk '/tom/ {wage=$2+$3; printf wage}' file 找到匹配行后为变量wage赋值并打印该变量。
8、
awk '/tom/ {count++;} END {print "tom was found "count" times"}' file #END表示在所有输入行处理完后进行处理。
9、awk 'gsub(//$/,"");gsub(/,/,""); cost+=$4;END {print "The total is $" cost>"filename"}' file gsub函数用空串替换$和,再将结果输出到filename中。
1 2 3 $1,200.00
1 2 3 $2,300.00
1 2 3 $4,000.00
awk '{gsub(//$/,"");gsub(/,/,"");
if ($4>1000&&$4<2000) c1+=$4;
else if ($4>2000&&$4<3000) c2+=$4;
else if ($4>3000&&$4<4000) c3+=$4;
else c4+=$4; }
END {printf "c1=[%d];c2=[%d];c3=[%d];c4=[%d]/n",c1,c2,c3,c4}"' file
通过if和else if完成条件语句
awk '{gsub(//$/,"");gsub(/,/,"");
if ($4>3000&&$4<4000) exit;
else c4+=$4; }
END {printf "c1=[%d];c2=[%d];c3=[%d];c4=[%d]/n",c1,c2,c3,c4}"' file
通过exit在某条件时退出,但是仍执行END操作。
awk '{gsub(//$/,"");gsub(/,/,"");
if ($4>3000) next;
else c4+=$4; }
END {printf "c4=[%d]/n",c4}"' file
通过next在某条件时跳过该行,对下一行执行操作。
10、awk '{ print FILENAME,$0 }' file1 file2 file3>fileall 把file1、file2、file3的文件内容全部写到fileall中,并前置文件名。
11、awk ' $1!=previous { close(previous); previous=$1 } {print substr($0,index($0," ") +1)>$1}' fileall 把合并后的文件重新分拆为3个文件。并与原文件一致。
12、awk 'BEGIN {"date"|getline d; print d}' 通过管道把date的执行结果送给getline,并赋给变量d,然后打印。
13、awk 'BEGIN {system("echo /"Input your name://c/""); getline d;print "/nYour name is",d,"/b!/n"}'
通过getline命令交互输入name,并显示出来。
awk 'BEGIN {FS=":"; while(getline< "/etc/passwd" >0) { if($1~"050[0-9]_") print $1}}'
打印/etc/passwd文件中用户名包含050x_的用户名。
14、awk '{ i=1;while(i
{ for(i=1;i
else { printf "%s/",$i } }}' 显示一个文件的全路径。
用for和if显示日期
awk 'BEGIN {
for(j=1;j<=12;j++)
{ flag=0;
printf "/n%d月份/n",j;
for(i=1;i<=31;i++)
{
if (j==2&&i>28) flag=1;
if ((j==4||j==6||j==9||j==11)&&i>30) flag=1;
if (flag==0) {printf "%02d%02d ",j,i}
}
}
}'
15、在awk中调用系统变量必须用单引号,如果是双引号,则表示字符串
Flag=abcd
awk '{print '$Flag'}' 结果为abcd
awk '{print "$Flag"}' 结果为$Flag
16、Linux下多线程查看工具pstree、ps、pstack
>pstree
pstree以树结构显示进程
$ pstree -p work | grep ad
sshd(22669)---bash(22670)---ad_preprocess(4551)-+-{ad_preprocess}(4552)
|-{ad_preprocess}(4553)
|-{ad_preprocess}(4554)
|-{ad_preprocess}(4555)
|-{ad_preprocess}(4556)
`-{ad_preprocess}(4557)
work为工作用户,-p为显示进程识别码,ad_preprocess共启动了6个子线程,加上主线程共7个线程
>ps -Lf
$ ps -Lf 4551
UID PID PPID LWP C NLWP STIME TTY STAT TIME CMD
work 4551 22670 4551 2 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:02 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4552 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4553 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4554 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4555 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4556 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
work 4551 22670 4557 0 7 16:30 pts/2 Sl+ 0:00 ./ad_preprocess
进程共启动了7个线程
>pstack
pstack显示每个进程的栈跟踪
$ pstack 4551
Thread 7 (Thread 1084229984 (LWP 4552)):
#0 0x000000302afc63dc in epoll_wait () from /lib64/tls/libc.so.6
#1 0x00000000006f0730 in ub::EPollEx::poll ()
#2 0x00000000006f172a in ub::NetReactor::callback ()
#3 0x00000000006fbbbb in ub::UBTask::CALLBACK ()
#4 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#5 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#6 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 6 (Thread 1094719840 (LWP 4553)):
#0 0x000000302afc63dc in epoll_wait () from /lib64/tls/libc.so.6
#1 0x00000000006f0730 in ub::EPollEx::poll ()
#2 0x00000000006f172a in ub::NetReactor::callback ()
#3 0x00000000006fbbbb in ub::UBTask::CALLBACK ()
#4 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#5 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#6 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 5 (Thread 1105209696 (LWP 4554)):
#0 0x000000302b80baa5 in __nanosleep_nocancel ()
#1 0x000000000079e758 in comcm::ms_sleep ()
#2 0x00000000006c8581 in ub::UbClientManager::healthyCheck ()
#3 0x00000000006c8471 in ub::UbClientManager::start_healthy_check ()
#4 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#5 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#6 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 4 (Thread 1115699552 (LWP 4555)):
#0 0x000000302b80baa5 in __nanosleep_nocancel ()
#1 0x0000000000482b0e in armor::armor_check_thread ()
#2 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#3 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#4 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 3 (Thread 1126189408 (LWP 4556)):
#0 0x000000302af8f1a5 in __nanosleep_nocancel () from /lib64/tls/libc.so.6
#1 0x000000302af8f010 in sleep () from /lib64/tls/libc.so.6
#2 0x000000000044c972 in Business_config_manager::run ()
#3 0x0000000000457b83 in Thread::run_thread ()
#4 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#5 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#6 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 2 (Thread 1136679264 (LWP 4557)):
#0 0x000000302af8f1a5 in __nanosleep_nocancel () from /lib64/tls/libc.so.6
#1 0x000000302af8f010 in sleep () from /lib64/tls/libc.so.6
#2 0x00000000004524bb in Process_thread::sleep_period ()
#3 0x0000000000452641 in Process_thread::run ()
#4 0x0000000000457b83 in Thread::run_thread ()
#5 0x000000302b80610a in start_thread () from /lib64/tls/libpthread.so.0
#6 0x000000302afc6003 in clone () from /lib64/tls/libc.so.6
#7 0x0000000000000000 in ?? ()
Thread 1 (Thread 182894129792 (LWP 4551)):
#0 0x000000302af8f1a5 in __nanosleep_nocancel () from /lib64/tls/libc.so.6
#1 0x000000302af8f010 in sleep () from /lib64/tls/libc.so.6
#2 0x0000000000420d79 in Ad_preprocess::run ()
#3 0x0000000000450ad0 in main ()