Java调用R并打包成可执行的jar

  rJava是一个R语言和Java语言的通信接口,通过底层JNI实现调用,允许在R中直接调用Java的对象和方法。
  rJava还提供了Java调用R的功能,是通过JRI(Java/R Interface)实现的。JRI现在已经被嵌入到rJava的包中,我们也可以单独试用这个功能。现在rJava包,已经成为很多基于Java开发R包的基础功能组件。
  正式由于rJava是底层接口,并使用JNI作为接口调用,所以效率非常高。在JRI的方案中,JVM直接通过内存直接加载RVM,调用过程性能几乎无损耗,因此是非常高效连接通道,是R和Java通信的首选开发包。
  软件环境:win7 64位 + R3.2.3(32位) + Jdk1.6(32位) +Eclipse4.4
  1.安装rJava 
  方法一:点击R工具栏上的【程序包】—》“设定CRAN数据源”—》China(Beijing 4) —》确定;点击【程序包】—》安装程序包—》选择 rJava —>OK
  方法二:直接在R的命令行窗口,输入以下命令:

install.packages("rJava")
library(rJava)

  2.配置环境变量  
  右击“我的电脑”—》属性 —》高级系统设置 —》环境变量 —》系统环境变量: JAVA_HOME、Classpath、Path。
  对于32位的jdk + 32位的R,请使用:

Path = G:\Program Files\R\R-3.2.3\bin\i386;%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;
JAVA_HOME = G:\Program Files (x86)\Java\jdk1.6.0_45;
ClassPath = .;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri;

  对于64位的jdk+64位的R,请使用:  

PATH = G:\Program Files\R\R-3.2.3\bin\x64;%JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;
JAVA_HOME =  G:\Program Files\Java\jdk1.6.0_45;
CLASSPATH = .;%JAVA_HOME%\lib\dt.jar;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar;G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri;

  3.在Eclipse中,编写Java通过JRI调用R的程序
  右击Eclipse的Package Explorer空白区,创建Java Projects,命名为:Rchart2,创建一个package:com.call,一个class文件:FirstRjava.java,一个Folder: Lib

Java调用R并打包成可执行的jar_第1张图片
图(1) Rchart2的Java工程目录图

  //FirstRjava.java  

package com.call;

import org.rosuda.JRI.Rengine;

public class FirstRjava {

    public static void main(String[] args) {
        FirstRjava demo = new FirstRjava();
        demo.callRJava();
    }

    public void callRJava(){
        //启动R引擎
        Rengine re = new Rengine(new String[]{"--vanilla"},false,null);
        if (!re.waitForR()) {
            System.out.println("Cannot load R");
            return;         
        }

        //打印变量
        String version = re.eval("R.version.string").asString();
        System.out.println(version);

        //生成10个随机数,保存至arr[]数组里,并输出
        double[] arr = re.eval("rnorm(10)").asDoubleArray();
        for(double a:arr){
            System.out.println(a+",");
        }

        //关闭R引擎
        re.end();       

    }

}

  4. 加载JRI.jar和配置VM参数
  4.1 在R中安装完rJava后,会在: X: ~R\R-x.x.x\bin\library\rJava\jri发现JRI.jar包,对于本例,目录为:G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri,将JRI.jar放到Rchar2/Lib里;右击Rchar2 —》Build Path —》Add External Archives —》选择JRI.jar —>OK
  4.2 配置工程Rchar2/FirstRjava的VM参数
  首先运行一下FirstRjava,将.java文件编译成.class文件,然后,右击FirstRjava—》Run as —》Run Configurations —》在Arguments界面,填写VM arguments:  

-Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\i386"

Java调用R并打包成可执行的jar_第2张图片
图(2) 在32的Eclipse上,配置32位的jri其vm参数

  如果是64位的R,只需要将路径的末尾字段: \i386 改成 \x64,即配置如下:  

-Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\x64"

  效果如下:

Java调用R并打包成可执行的jar_第3张图片
图(3) 用Java通过JRI,调用R

  5.将该工程打包成一个Runable jar
  右击Rchart2 —>Export —> Runable JAR file —> Next —> 选择FirstRjava -Rcahrt2 ,路径: G:\Workspaces\ExportJar(按Browse按钮,自己设置),命名为: FirstRjava.jar,如图(4)、图(5)、图(6)所示:

Java调用R并打包成可执行的jar_第4张图片
图(4) 右击工程Rchart2–》Export

Java调用R并打包成可执行的jar_第5张图片
图(5) 点击Runable JAR file

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图(6) 选择要导出的工程.jar名称和地址,这里设置为FirstRjava.jar,地址:G:\Workspaces\ExportJar

  6. 点击桌面左下角的【开始】—》cmd —>进入到.jar包所在的目录: G:\Workspaces\ExportJar,输入命令:    

java -Djava.library.path="G:\Program Files\R\R-3.2.3\library\rJava\jri\i386" -jar FirstRjava.jar

  如图(7)所示:

Java调用R并打包成可执行的jar_第7张图片
图(7) 在Dos黑框框里,执行.jar的效果

  R和Java可以相互调用,R通过rJava调用Java,Java通过JRI调用R。
  Java通过JRI调用R的工程代码:http://download.csdn.net/detail/sanqima/9380778

参考文献:http://blog.fens.me/r-rjava-java/

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