关于时间序列问题

按照 AAL 模板将大脑划分为 116 脑区后,再将每个被试的 175 个功能磁共振成像时间序列进行脑区内体素平均,如此,每个脑区对应一个平均时间序列,从而每个被试得到 116 个脑区的平均时间序列,对应 116×175 的矩阵。通过计算每个被试脑区间的皮尔逊相关系数,得到 116×116 功能连接矩阵,该矩阵中的每个元素都表示相应两个脑区之间的功能连接情况,其中正数表示两个脑区之间的功能连接正相关,负数表示两个脑区的功能连接负相关。详细的处理流程见图 3.4。不难得知,最终得到的功能连接矩阵是对称矩阵,如果取整个矩阵中的数据作为模式分析特征,则必然存在数据冗余,所以取矩阵的下三角数据作为模式分析的初始特征,共 6670 个。
答疑
图像预处理之后提取AAL模版的时间序列(dpabi可以做到) 会得到volume*116的矩阵 直接对这个矩阵做pearson相关就好了。
每个被试划分为116个脑区,每个脑区的时间序列有175的时间点,一个脑区对应多条时间序列,对这多条时间序列取平均后,每个脑区对应一个平均时间序列,即116条时间序列。对这116条时间序列两两相关做功能连接,得到的皮尔逊相关系数矩阵。矩阵只取上三角或下三角。
如何将AAL的116个脑区转为90个?
1 确定小脑内parcellation unit的编号
2 将那些值为上面那些编号的vocel找出来,将其置为0.

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