MIMIC数据库基本信息分析

一、MIMIC数据库中26张表介绍

       数据库中一共有26张表,记录患者入院的各种信息,每张表的介绍如下所示。

表格名 信息
admission 患者基本信息,比如性别、种族、语言、宗教、婚姻、入院和出院时间、死亡时间等
callout 提供病人准备从ICU转出或者已经从ICU转出时相关信息
caregivers 记录医护人员信息(ID、类型、附加信息)
chartevents 记录所有病人的图表数据,住院期间的所有症状、体征、精神状态、实验室检查等
cptevents 为病人的程序进行计费
d_cpt 当前程序术语(CPT)代码的高级定义
prescriptions 包含药物相关的订单条目,即处方
inputevents_cv 患者输入数据(流入患者体内液体信息)
inputeevents_mv 患者输入数据(流入患者体内液体信息)
outputevent 患者的输出数据
labevents 包含给定患者的所有实验室测量值,包括患者数据(ITEMID、VALUE)
d_icd_diagnoses ICD-9疾病诊断的定义表,对 疾病编码的解释
d_icd_procedures ICD-9治疗程序代码的解释
d_items ICU数据库中所有项目的定义表
d_labitems 所有实验室测量的定义表(对ITEMID的解释,对应数据类型,关联的LOINC代码)
datetimeevents 包含所有日期格式的数据
diagnoses_icd 包含患者住院期间所有ICD-9诊断
drgcodes 包含患者的诊断相关组(DRG)代码
icustays 患者在ICU内的住院概要(入住或者转出ICU的时间等)
microbiologyevents 包含微生物学信息,包括进行的测试和敏感性
noteevents 患者报告,主要是不便于数字化的报告
patients 包含患者的基本信息(性别、出生日期、死亡日期、死亡标志位)
procedureevents_mv 包含患者的(治疗)程序
procedures_icd 包含患者的ICD程序,最值得注意的是ICD-9程序,即诊断程序
services 患者被接纳/转移的服务
transfers 患者整个住院期间的物理位置

二、患者基本信息

       MIMIC数据库一共收录46520个病人(包括新生儿),成年患者38888人(按照最后一次住院统计),而且存在同一个病人多次住院的情况,所以数据库中每张表记录数比病人数量多。 笔者统计工具没有用官网推荐的软件,采用数据库查询软件Navicat和可视化软件Tableau来实现查询和显示。

(1)种族分布

MIMIC数据库基本信息分析_第1张图片

 (2)ICU患者分布(不包括新生儿NICU) 

          进入ICU的患者一共是46476人,成年患者(即去除新生儿)38606人,分布如下所示。

MIMIC数据库基本信息分析_第2张图片

(3)还统计了很多其它数据,比如住院天数、年龄、疾病死亡率、前10位疾病死亡和未死亡患者基本信息对比等等,方法基于以上两条,再次不一一列举了。

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