概述
这是使用机器学习预测平均气温系列文章的最后一篇文章了,作为最后一篇文章,我将使用google的开源机器学习框架tensorflow来构建一个神经网络回归器。关于tensorflow的介绍、安装、入门,请自己google,这里就不做讲述。
这篇文章我主要讲解一下几点:
- 了解人工神经网络理论
- tensorflow高级API:Estimators
- 构建DNN模型预测天气
人工神经网络基础理论
上一篇文章主要讲解了如何构建线性回归模型(这是最基础的机器学习算法)来预测内布拉斯加州林肯市每天的平均气温。线性回归模型非常有效,并且可以被用于数值化(比如分类)、预测(比如预测天气)。线性回归算法也比较与局限性,它要求数据之间具有线性关系。
针对于非线性关系的场景,数据挖掘和机器学习有数不清的算法来处理。近些年最火的要数神经网络算法了,它可以处理机器学习领域的好多问题。神经网络算法具备线性和非线性学习算法的能力。
神经网络受到大脑中的生物神经元的启发,它们在复杂的交互网络中工作,根据已经收集的信息的历史来传输,收集和学习信息。我们感兴趣的计算神经网络类似于大脑的神经元,因为它们是接收输入信号(数字量)的神经元(节点)的集合,处理输入并将处理后的信号发送给其他下游代理 网络。 信号作为通过神经网络的数字量的处理是一个非常强大的特征,不限于线性关系。
在这个系列中,我一直关注一种称为监督学习的特定类型的机器学习,也就说说训练的数据结果是已知的,根据历史已知的输入和输出,预测未来的输入对应的输出。 此外,预测的类型是数值的真实值,这意味着我们使用的是回归预测算法。
从图形上看,类似于本文中描述的神经网络如图:
在每个节点上进行求和之后,将一个特殊的非线性函数应用到总和上,这在上面的图像中被描述为Fn(...)。 这种将非线性特征引入神经网络的特殊功能称为激活功能。 激活函数所带来的这种非线性特性赋予了多层神经网络以其功能。 如果不是将非线性加入到过程中,则所有层都将有效地代数地组合成一个常数运算,其中包括将输入乘以某个平坦系数值(即线性模型)。
好吧,这一切都很好,但是这怎么转化为学习算法呢? 那么最直接的答案就是评估正在进行的预测,即模型“y”的输出,到实际预期值(目标),并对权重进行一系列调整,以改善整体 预测准确性。
在回归机器学习算法的世界中,通过使用成本(又名“损失”或“客观”)函数(即平方误差之和(SSE))评估准确性。 请注意,我把这个声明推广到整个机器学习的连续体,而不仅仅是神经网络。 在前面的文章中,普通最小二乘算法完成了这一工作,它发现了使误差平方和(即最小二乘)最小化的系数组合。
我们的神经网络回归器会做同样的事情。 它将迭代训练数据提取特征值,计算成本函数(使用SSE),并以最小化成本函数的方式调整权重。 通过算法迭代推送特征的过程和评估如何根据成本函数来调整权重。
模型优化算法在构建鲁棒神经网络中非常重要。 例如通过网络体系结构(即宽度和深度)馈送,然后根据成本函数进行评估,调整权重。 当优化器函数确定权重调整不会导致成本函数计算代价的变化,该模型被认为是“学习”。
TensorFlow Estimator API
tensorflow由好几个部分组成,其中最常用的是Core API,它为用户提供了一套低级别的API来定义和训练使用符号操作的任何机器学习算法。这也是TensorFlow的核心功能,虽然Core API能应对大多数的应用场景,但我更关注Estimator API。
TensorFlow团队开发了Estimator API,使日常开发人员可以更方便地使用该库。这个API提供了训练模型、评估模型、以及和Sci-Kit库相似的对未知数据的预测接口,这是通过实现各种算法的通用接口来实现的。另外,构建在高级API中的是机器学习最佳实践,抽象和可伸缩性的负载。
所有这些机器学习的优点使得基础Estimator类中实现的一套工具以及多个预先封装的模型类型,降低了使用TensorFlow的入门门槛,因此可以应用于日常问题。通过抽象出诸如编写训练循环或处理会话之类的问题,开发人员能够专注于更重要的事情,如快速尝试多个模型和模型架构,以找到最适合他们需要的模型。
在这篇文章中,我将介绍如何使用非常强大的深度神经网络估计器之一DNN Regressor。
建立一个DNNRegressor来预测天气
我们先导入一些我们需要用到的库。
import pandas as pd
import numpy as np
import tensorflow as tf
from sklearn.metrics import
explained_variance_score, \
mean_absolute_error, \
median_absolute_error
from sklearn.model_selection import train_test_split
我们来处理一下数据,所有的数据我都放在了Github上,大家可以去查阅clone。
# read in the csv data into a pandas data frame and set the date as the index
df = pd.read_csv('end-part2_df.csv').set_index('date')
# execute the describe() function and transpose the output so that it doesn't overflow the width of the screen
df.describe().T
# execute the info() function
df.info()
Index: 997 entries, 2015-01-04 to 2017-09-27
Data columns (total 39 columns):
meantempm 997 non-null int64
maxtempm 997 non-null int64
mintempm 997 non-null int64
meantempm_1 997 non-null float64
meantempm_2 997 non-null float64
meantempm_3 997 non-null float64
meandewptm_1 997 non-null float64
meandewptm_2 997 non-null float64
meandewptm_3 997 non-null float64
meanpressurem_1 997 non-null float64
meanpressurem_2 997 non-null float64
meanpressurem_3 997 non-null float64
maxhumidity_1 997 non-null float64
maxhumidity_2 997 non-null float64
maxhumidity_3 997 non-null float64
minhumidity_1 997 non-null float64
minhumidity_2 997 non-null float64
minhumidity_3 997 non-null float64
maxtempm_1 997 non-null float64
maxtempm_2 997 non-null float64
maxtempm_3 997 non-null float64
mintempm_1 997 non-null float64
mintempm_2 997 non-null float64
mintempm_3 997 non-null float64
maxdewptm_1 997 non-null float64
maxdewptm_2 997 non-null float64
maxdewptm_3 997 non-null float64
mindewptm_1 997 non-null float64
mindewptm_2 997 non-null float64
mindewptm_3 997 non-null float64
maxpressurem_1 997 non-null float64
maxpressurem_2 997 non-null float64
maxpressurem_3 997 non-null float64
minpressurem_1 997 non-null float64
minpressurem_2 997 non-null float64
minpressurem_3 997 non-null float64
precipm_1 997 non-null float64
precipm_2 997 non-null float64
precipm_3 997 non-null float64
dtypes: float64(36), int64(3)
memory usage: 311.6+ KB
请注意,我们刚刚记录下了1000个气象数据记录,并且所有的特征都是数字性质的。 另外,由于我们在第一篇文章中的努力工作,所有记录都是完整的,因为它们不缺少任何值(没有非空值)。
现在我将删除“mintempm”和“maxtempm”这两列,因为它们对帮助我们预测平均温度毫无意义。 我们正在试图预测未来,所以我们显然不能掌握有关未来的数据。 我还将从目标(y)中分离出特征(X)。
# First drop the maxtempm and mintempm from the dataframe
df = df.drop(['mintempm', 'maxtempm'], axis=1)
# X will be a pandas dataframe of all columns except meantempm
X = df[[col for col in df.columns if col != 'meantempm']]
# y will be a pandas series of the meantempm
y = df['meantempm']
和所有监督机器学习应用程序一样,我将把我的数据集分成训练集和测试集。 但是,为了更好地解释训练这个神经网络的迭代过程,我将使用一个额外的数据集,我将其称为“验证集合”。 对于训练集,我将利用80%的数据,对于测试和验证集,它们将分别为剩余数据的10%。为了分解这些数据,我将再次使用Scikit Learn 库的train_test_split()函数。
# split data into training set and a temporary set using sklearn.model_selection.traing_test_split
X_train, X_tmp, y_train, y_tmp = train_test_split(X, y, test_size=0.2, random_state=23)
# take the remaining 20% of data in X_tmp, y_tmp and split them evenly
X_test, X_val, y_test, y_val = train_test_split(X_tmp, y_tmp, test_size=0.5, random_state=23)
X_train.shape, X_test.shape, X_val.shape
print("Training instances {}, Training features {}".format(X_train.shape[0], X_train.shape[1]))
print("Validation instances {}, Validation features {}".format(X_val.shape[0], X_val.shape[1]))
print("Testing instances {}, Testing features {}".format(X_test.shape[0], X_test.shape[1]))
Training instances 797, Training features 36
Validation instances 100, Validation features 36
Testing instances 100, Testing features 36
构建神经网络模型时要采取的第一步是实例化tf.estimator.DNNRegressor()类。类的构造函数有多个参数,但我将重点关注以下参数:
- feature_columns:一种类似列表的结构,包含要输入到模型中的要素的名称和数据类型的定义
- hidden_units:一个类似列表的结构,包含神经网络数量宽度和深度的定义
- optimizer:tf.Optimizer子类的一个实例,在训练期间优化模型的权重;它的默认值是AdaGrad优化器。
- activation_fn:激活功能,用于在每一层向网络引入非线性;默认是ReLU
- model_dir:要创建的目录,其中包含模型的元数据和其他检查点保存
我将首先定义一个数字特征列的列表。要做到这一点,我使用tf.feature_column.numeric_column()函数返回一个FeatureColumn实例。
feature_cols = [tf.feature_column.numeric_column(col) for col in X.columns]
使用定义的特性列,我现在可以实例化DNNRegressor类并将其存储在回归变量中。 我指定我想要一个有两层深度的神经网络,其中两层的宽度都是50个节点。 我还指出,我希望我的模型数据存储在一个名为tf_wx_model的目录中。
regressor = tf.estimator.DNNRegressor(feature_columns=feature_cols,
hidden_units=[50, 50],
model_dir='tf_wx_model')
INFO:tensorflow:Using default config.
INFO:tensorflow:Using config: {'_tf_random_seed': 1, '_save_checkpoints_steps': None, '_save_checkpoints_secs': 600, '_model_dir': 'tf_wx_model', '_log_step_count_steps': 100, '_keep_checkpoint_every_n_hours': 10000, '_save_summary_steps': 100, '_keep_checkpoint_max': 5, '_session_config': None}
接下来我想要做的是定义一个可重用的函数,这个函数通常被称为“输入函数”,我将调用wx_input_fn()。 这个函数将被用来在训练和测试阶段将数据输入到我的神经网络中。有许多不同的方法来建立输入函数,但我将描述如何定义和使用一个基于tf.estimator.inputs.pandas_input_fn(),因为我的数据是在一个pandas数据结构。
def wx_input_fn(X, y=None, num_epochs=None, shuffle=True, batch_size=400):
return tf.estimator.inputs.pandas_input_fn(x=X,
y=y,
num_epochs=num_epochs,
shuffle=shuffle,
batch_size=batch_size)
请注意,这个wx_input_fn()函数接受一个必选参数和四个可选参数,然后将这些参数交给TensorFlow输入函数,专门用于返回的pandas数据。 这是TensorFlow API一个非常强大的功能。函数的参数定义如下:
- X:输入要输入到三种DNNRegressor接口方法中的一种(训练,评估和预测)
- y:X的目标值,这是可选的,不会被提供给预测调用
- num_epochs:可选参数。 当算法在整个数据集上执行一次时,就会出现一个新纪元。
- shuffle:可选参数,指定每次执行算法时是否随机选择数据集的批处理(子集)
- batch_size:每次执行算法时要包含的样本数
通过定义我们的输入函数,我们现在可以训练我们基于训练数据集上的神经网络。 对于熟悉TensorFlow高级API的读者,您可能会注意到我对自己的模型的培训方式有点不合常规。至少从TensorFlow网站上的当前教程和网络上的其他教程的角度来看。通常情况下,您将看到如下所示的内容。
regressor.train(input_fn=input_fn(training_data, num_epochs=None, shuffle=True), steps=some_large_number)
.....
lots of log info
....
然后,作者将直接展示evaluate()函数,并且几乎没有提示它在做什么或为什么存在这一行代码。
regressor.evaluate(input_fn=input_fn(eval_data, num_epochs=1, shuffle=False), steps=1)
.....
less log info
....
在此之后,假设所有的训练模型都是完美的,他们会直接跳到执行predict()函数。
predictions = regressor.predict(input_fn=input_fn(pred_data, num_epochs=1, shuffle=False), steps=1)
我希望能够提供一个合理的解释,说明如何训练和评估这个神经网络,以便将这个模型拟合或过度拟合到训练数据上的风险降到最低。因此,我们不再拖延,让我定义一个简单的训练循环,对训练数据进行训练,定期对评估数据进行评估。
evaluations = []
STEPS = 400
for i in range(100):
regressor.train(input_fn=wx_input_fn(X_train, y=y_train), steps=STEPS)
evaluations.append(regressor.evaluate(input_fn=wx_input_fn(X_val,
y_val,
num_epochs=1,
shuffle=False)))
INFO:tensorflow:Create CheckpointSaverHook.
INFO:tensorflow:Saving checkpoints for 1 into tf_wx_model/model.ckpt.
INFO:tensorflow:step = 1, loss = 1.11335e+07
INFO:tensorflow:global_step/sec: 75.7886
INFO:tensorflow:step = 101, loss = 36981.3 (1.321 sec)
INFO:tensorflow:global_step/sec: 85.0322
... A WHOLE LOT OF LOG OUTPUT ...
INFO:tensorflow:step = 39901, loss = 5205.02 (1.233 sec)
INFO:tensorflow:Saving checkpoints for 40000 into tf_wx_model/model.ckpt.
INFO:tensorflow:Loss for final step: 4557.79.
INFO:tensorflow:Starting evaluation at 2017-12-05-13:48:43
INFO:tensorflow:Restoring parameters from tf_wx_model/model.ckpt-40000
INFO:tensorflow:Evaluation [1/1]
INFO:tensorflow:Finished evaluation at 2017-12-05-13:48:43
INFO:tensorflow:Saving dict for global step 40000: average_loss = 10.2416, global_step = 40000, loss = 1024.16
INFO:tensorflow:Starting evaluation at 2017-12-05-13:48:43
INFO:tensorflow:Restoring parameters from tf_wx_model/model.ckpt-40000
INFO:tensorflow:Finished evaluation at 2017-12-05-13:48:43
INFO:tensorflow:Saving dict for global step 40000: average_loss = 10.2416, global_step = 40000, loss = 1024.16
上面的循环迭代了100次。 在循环体中,我调用了回归器对象的train()方法,并将其传递给了我的可重用的wx_input_fn(),后者又通过了我的训练功能集和目标。 我有意地将默认参数num_epochs等于None,基本上这样说:“我不在乎你通过训练集多少次,只是继续训练算法对每个默认batch_size 400”(大约一半的训练 组)。 我还将shuffle参数设置为默认值True,以便在训练时随机选择数据以避免数据中的任何顺序关系。 train()方法的最后一个参数是我设置为400的步骤,这意味着训练集每个循环将被批处理400次。
这给了我一个很好的时间以更具体的数字来解释一个epoch的意义。 回想一下,当一个训练集的所有记录都通过神经网络训练一次时,就会出现一个epoch。 所以,如果我们的训练集中有大约800(准确的说是797)个记录,并且每个批次选择400个,那么每两个批次我们就完成了一个时间。 因此,如果我们遍历整个训练集100个迭代400个步骤,每个批次大小为400(每个批次的一个半个时间),我们得到:
(100 x 400 / 2) = 20,000 epochs
现在你可能想知道为什么我为循环的每次迭代执行和evaluate()方法,并在列表中捕获它的输出。 首先让我解释一下每次train()方法被触发时会发生什么。它随机选择一批训练记录,并通过网络推送,直到做出预测,并为每条记录计算损失函数。 然后根据计算出的损失根据优化器的逻辑调整权重,这对于减少下一次迭代的整体损失的方向做了很好的调整。 一般而言,只要学习速率足够小,这些损失值随着时间的推移而逐渐下降。
然而,经过一定数量的这些学习迭代之后,权重开始不仅受到数据整体趋势的影响,而且还受到非实际的噪声在所有实际数据中的继承。 在这一点上,网络受到训练数据特性的过度影响,并且变得无法推广关于总体数据的预测。这与我之前提到的高级TensorFlow API许多其他教程不足之处有关。 在训练期间周期性地打破这一点非常重要,并评估模型如何推广到评估或验证数据集。 通过查看第一个循环迭代的评估输出,让我们花些时间看看evaluate()函数返回的结果。
evaluations[0]
{'average_loss': 31.116383, 'global_step': 400, 'loss': 3111.6382}
正如你所看到的,它输出的是平均损失(均方误差)和训练中的步骤的总损失(平方误差和),这一步是第400步。 在训练有素的网络中,你通常会看到一种趋势,即训练和评估损失或多或少地平行下降。 然而,在某个时间点的过度配置模型中,实际上在过拟合开始出现的地方,验证训练集将不再看到其evaluate()方法的输出降低。 这是你想停止进一步训练模型的地方,最好是在变化发生之前。
现在我们对每个迭代都有一个评估集合,让我们将它们作为训练步骤的函数来绘制,以确保我们没有过度训练我们的模型。 为此,我将使用matplotlib的pyplot模块中的一个简单的散点图。
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
# manually set the parameters of the figure to and appropriate size
plt.rcParams['figure.figsize'] = [14, 10]
loss_values = [ev['loss'] for ev in evaluations]
training_steps = [ev['global_step'] for ev in evaluations]
plt.scatter(x=training_steps, y=loss_values)
plt.xlabel('Training steps (Epochs = steps / 2)')
plt.ylabel('Loss (SSE)')
plt.show()
从上面的图表看来,在所有这些迭代之后,我并没有过度配置模型,因为评估损失从来没有呈现出朝着增加价值的方向的显着变化。现在,我可以安全地继续根据我的剩余测试数据集进行预测,并评估模型如何预测平均天气温度。
与我已经演示的其他两种回归方法类似,predict()方法需要input_fn,我将使用可重用的wx_input_fn()传递input_fn,将测试数据集交给它,将num_epochs指定为None,shuffle为False,因此它将依次送入所有的数据进行测试。
接下来,我做一些从predict()方法返回的dicts迭代的格式,以便我有一个numpy的预测数组。然后,我使用sklearn方法explain_variance_score(),mean_absolute_error()和median_absolute_error()来预测数组,以测量预测与已知目标y_test的关系。
pred = regressor.predict(input_fn=wx_input_fn(X_test,
num_epochs=1,
shuffle=False))
predictions = np.array([p['predictions'][0] for p in pred])
print("The Explained Variance: %.2f" % explained_variance_score(
y_test, predictions))
print("The Mean Absolute Error: %.2f degrees Celcius" % mean_absolute_error(
y_test, predictions))
print("The Median Absolute Error: %.2f degrees Celcius" % median_absolute_error(
y_test, predictions))
INFO:tensorflow:Restoring parameters from tf_wx_model/model.ckpt-40000
The Explained Variance: 0.88
The Mean Absolute Error: 3.11 degrees Celcius
The Median Absolute Error: 2.51 degrees Celcius
我已经使用了与上一篇文章有关的线性回归技术相同的指标,以便我们不仅可以评估这个模型,还可以对它们进行比较。 正如你所看到的,这两个模型的表现相当类似,更简单的线性回归模型略好一些。然而,你可以通过修改学习速率,宽度和深度等参数来优化机器学习模型。
总结
本文演示了如何使用TensorFlow高级API Estimator子类DNNRegressor。并且,我也描述了神经网络理论,他们是如何被训练的,以及在过程中认识到过度拟合模型的危险性的重要性。
为了演示这个建立神经网络的过程,我建立了一个模型,能够根据本系列第一篇文章收集的数字特征预测第二天的平均温度。写这些文章的目的不是为了建立一个非常好的模型预测天气,我的目标是:
- 演示从数据收集,数据处理,探索性数据分析,模型选择,模型构建和模型评估中进行分析(机器学习,数据科学,无论...)项目的一般过程。
- 演示如何使用两个流行的Python库StatsModels和Scikit Learn来选择不违反线性回归技术关键假设的有意义的功能。
- 演示如何使用高级别的TensorFlow API,并直观地了解所有这些抽象层下正在发生的事情。
- 讨论与过度拟合模型相关的问题。
- 解释试验多个模型类型以最好地解决问题。
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