生信脚本代写

主营业务:
1,python相关的流程搭建或指导。
批处理数据,文本文件,
fastq格式介绍,文件提取处理等。
生信入门指导

2,脚本处理
拆分fastq,数据质控,过滤,比对结果分析等。

3,R语言
R的安装(有/无root权限),R包的安装,死磕各种疑难杂症
--ggplot2画图等
--bioconductor包等
--生物统计类分析(ANOV等)

4,linux系统相关的
生物信息学软件安装,数据库下载等。
常用linux命令使用方法及快捷
系统重装(windows,ubuntu,centos),善于解决各种疑难杂症
搭建VPS等(远程访问公司服务器)
系统的维护(等)

5,常用生信软件介绍,
bwa,dropEst,indrops,Mixcr,Bowtie2,samtools,cellranger 。。。

6,单细胞数据分析
单细胞 RNA-Seq:10x Genomics 数据分析, 包括聚类cluster,PCA降维,doublets检测,UMAP图,heatmap图
单细胞 TCR-Seq:vdj cdr3重构。TCR pair ,clonotype

免费的哦
生物信息数据处理
主要目的是熟悉业务,强化个人能力,促进行业交流。

更新于20180920,后续完善。

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