缺失数据可以使用 isna
或 isnull
(两个函数没有区别)来查看每个单元格是否缺失,结合 mean
可以计算出每列缺失值的比例:
In [3]: df = pd.read_csv('data/learn_pandas.csv',
...: usecols = ['Grade', 'Name', 'Gender', 'Height',
...: 'Weight', 'Transfer'])
...:
In [4]: df.isna().head()
Out[4]:
Grade Name Gender Height Weight Transfer
0 False False False False False False
1 False False False False False False
2 False False False False False False
3 False False False True False False
4 False False False False False False
In [5]: df.isna().mean() # 查看缺失的比例
Out[5]:
Grade 0.000
Name 0.000
Gender 0.000
Height 0.085
Weight 0.055
Transfer 0.060
dtype: float64
如果想要查看某一列缺失或者非缺失的行,可以利用 Series
上的 isna
或者 notna
进行布尔索引。例如,查看身高缺失的行:
In [6]: df[df.Height.isna()].head()
Out[6]:
Grade Name Gender Height Weight Transfer
3 Sophomore Xiaojuan Sun Female NaN 41.0 N
12 Senior Peng You Female NaN 48.0 NaN
26 Junior Yanli You Female NaN 48.0 N
36 Freshman Xiaojuan Qin Male NaN 79.0 Y
60 Freshman Yanpeng Lv Male NaN 65.0 N
如果想要同时对几个列,检索出全部为缺失或者至少有一个缺失或者没有缺失的行,可以使用 isna, notna
和 any, all
的组合。例如,对身高、体重和转系情况这3列分别进行这三种情况的检索:
In [7]: sub_set = df[['Height', 'Weight', 'Transfer']]
In [8]: df[sub_set.isna().all(1)] # 全部缺失
Out[8]:
Grade Name Gender Height Weight Transfer
102 Junior Chengli Zhao Male NaN NaN NaN
In [9]: df[sub_set.isna().any(1)].head() # 至少有一个缺失
Out[9]:
Grade Name Gender Height Weight Transfer
3 Sophomore Xiaojuan Sun Female NaN 41.0 N
9 Junior Juan Xu Female 164.8 NaN N
12 Senior Peng You Female NaN 48.0 NaN
21 Senior Xiaopeng Shen Male 166.0 62.0 NaN
26 Junior Yanli You Female NaN 48.0 N
In [10]: df[sub_set.notna().all(1)].head() # 没有缺失
Out[10]:
Grade Name Gender Height Weight Transfer
0 Freshman Gaopeng Yang Female 158.9 46.0 N
1 Freshman Changqiang You Male 166.5 70.0 N
2 Senior Mei Sun Male 188.9 89.0 N
4 Sophomore Gaojuan You Male 174.0 74.0 N
5 Freshman Xiaoli Qian Female 158.0 51.0 N
数据处理中经常需要根据缺失值的大小、比例或其他特征来进行行样本或列特征的删除, pandas
中提供了 dropna
函数来进行操作。
dropna
的主要参数为轴方向 axis
(默认为0,即删除行)、删除方式 how
、删除的非缺失值个数阈值 thresh
( 非缺失值 没有达到这个数量的相应维度会被删除)、备选的删除子集 subset
,其中 how
主要有 any
和 all
两种参数可以选择。
例如,删除身高体重至少有一个缺失的行:
In [11]: res = df.dropna(how = 'any', subset = ['Height', 'Weight'])
In [12]: res.shape
Out[12]: (174, 6)
例如,删除超过15个缺失值的列:
In [13]: res = df.dropna(1, thresh=df.shape[0]-15) # 身高被删除
In [14]: res.head()
Out[14]:
Grade Name Gender Weight Transfer
0 Freshman Gaopeng Yang Female 46.0 N
1 Freshman Changqiang You Male 70.0 N
2 Senior Mei Sun Male 89.0 N
3 Sophomore Xiaojuan Sun Female 41.0 N
4 Sophomore Gaojuan You Male 74.0 N
当然,不用 dropna
同样是可行的,例如上述的两个操作,也可以使用布尔索引来完成:
In [15]: res = df.loc[df[['Height', 'Weight']].notna().all(1)]
In [16]: res.shape
Out[16]: (174, 6)
In [17]: res = df.loc[:, ~(df.isna().sum()>15)]
In [18]: res.head()
Out[18]:
Grade Name Gender Weight Transfer
0 Freshman Gaopeng Yang Female 46.0 N
1 Freshman Changqiang You Male 70.0 N
2 Senior Mei Sun Male 89.0 N
3 Sophomore Xiaojuan Sun Female 41.0 N
4 Sophomore Gaojuan You Male 74.0 N
在 fillna
中有三个参数是常用的: value, method, limit
。其中, value
为填充值,可以是标量,也可以是索引到元素的字典映射; method
为填充方法,有用前面的元素填充 ffill
和用后面的元素填充 bfill
两种类型, limit
参数表示连续缺失值的最大填充次数。
下面构造一个简单的 Series
来说明用法:
In [19]: s = pd.Series([np.nan, 1, np.nan, np.nan, 2, np.nan],
....: list('aaabcd'))
....:
In [20]: s
Out[20]:
a NaN
a 1.0
a NaN
b NaN
c 2.0
d NaN
dtype: float64
In [21]: s.fillna(method='ffill') # 用前面的值向后填充
Out[21]:
a NaN
a 1.0
a 1.0
b 1.0
c 2.0
d 2.0
dtype: float64
In [22]: s.fillna(method='ffill', limit=1) # 连续出现的缺失,最多填充一次
Out[22]:
a NaN
a 1.0
a 1.0
b NaN
c 2.0
d 2.0
dtype: float64
In [23]: s.fillna(s.mean()) # value为标量
Out[23]:
a 1.5
a 1.0
a 1.5
b 1.5
c 2.0
d 1.5
dtype: float64
In [24]: s.fillna({'a': 100, 'd': 200}) # 通过索引映射填充的值
Out[24]:
a 100.0
a 1.0
a 100.0
b NaN
c 2.0
d 200.0
dtype: float64
有时为了更加合理地填充,需要先进行分组后再操作。例如,根据年级进行身高的均值填充:
In [25]: df.groupby('Grade')['Height'].transform(
....: lambda x: x.fillna(x.mean())).head()
....:
Out[25]:
0 158.900000
1 166.500000
2 188.900000
3 163.075862
4 174.000000
Name: Height, dtype: float64
练一练
对一个序列以如下规则填充缺失值:如果单独出现的缺失值,就用前后均值填充,如果连续出现的缺失值就不填充,即序列[1, NaN, 3, NaN, NaN]填充后为[1, 2, 3, NaN, NaN],请利用
fillna
函数实现。(提示:利用limit
参数)
在关于 interpolate
函数的 文档 描述中,列举了许多插值法,包括了大量 Scipy
中的方法。由于很多插值方法涉及到比较复杂的数学知识,因此这里只讨论比较常用且简单的三类情况,即线性插值、最近邻插值和索引插值。
对于 interpolate
而言,除了插值方法(默认为 linear
线性插值)之外,有与 fillna
类似的两个常用参数,一个是控制方向的 limit_direction
,另一个是控制最大连续缺失值插值个数的 limit
。其中,限制插值的方向默认为 forward
,这与 fillna
的 method
中的 ffill
是类似的,若想要后向限制插值或者双向限制插值可以指定为 backward
或 both
。
In [26]: s = pd.Series([np.nan, np.nan, 1,
....: np.nan, np.nan, np.nan,
....: 2, np.nan, np.nan])
....:
In [27]: s.values
Out[27]: array([nan, nan, 1., nan, nan, nan, 2., nan, nan])
例如,在默认线性插值法下分别进行 backward
和双向限制插值,同时限制最大连续条数为1:
In [28]: res = s.interpolate(limit_direction='backward', limit=1)
In [29]: res.values
Out[29]: array([ nan, 1. , 1. , nan, nan, 1.75, 2. , nan, nan])
In [30]: res = s.interpolate(limit_direction='both', limit=1)
In [31]: res.values
Out[31]: array([ nan, 1. , 1. , 1.25, nan, 1.75, 2. , 2. , nan])
第二种常见的插值是最近邻插补,即缺失值的元素和离它最近的非缺失值元素一样:
In [32]: s.interpolate('nearest').values
Out[32]: array([nan, nan, 1., 1., 1., 2., 2., nan, nan])
最后来介绍索引插值,即根据索引大小进行线性插值。例如,构造不等间距的索引进行演示:
In [33]: s = pd.Series([0,np.nan,10],index=[0,1,10])
In [34]: s
Out[34]:
0 0.0
1 NaN
10 10.0
dtype: float64
In [35]: s.interpolate() # 默认的线性插值,等价于计算中点的值
Out[35]:
0 0.0
1 5.0
10 10.0
dtype: float64
In [36]: s.interpolate(method='index') # 和索引有关的线性插值,计算相应索引大小对应的值
Out[36]:
0 0.0
1 1.0
10 10.0
dtype: float64
同时,这种方法对于时间戳索引也是可以使用的,有关时间序列的其他话题会在第十章进行讨论,这里举一个简单的例子:
In [37]: s = pd.Series([0,np.nan,10],
....: index=pd.to_datetime(['20200101',
....: '20200102',
....: '20200111']))
....:
In [38]: s
Out[38]:
2020-01-01 0.0
2020-01-02 NaN
2020-01-11 10.0
dtype: float64
In [39]: s.interpolate()
Out[39]:
2020-01-01 0.0
2020-01-02 5.0
2020-01-11 10.0
dtype: float64
In [40]: s.interpolate(method='index')
Out[40]:
2020-01-01 0.0
2020-01-02 1.0
2020-01-11 10.0
dtype: float64
关于polynomial和spline插值的注意事项
在
interpolate
中如果选用polynomial
的插值方法,它内部调用的是scipy.interpolate.interp1d(*,*,kind=order)
,这个函数内部调用的是make_interp_spline
方法,因此其实是样条插值而不是类似于numpy
中的polyfit
多项式拟合插值;而当选用spline
方法时,pandas
调用的是scipy.interpolate.UnivariateSpline
而不是普通的样条插值。这一部分的文档描述比较混乱,而且这种参数的设计也是不合理的,当使用这两类插值方法时,用户一定要小心谨慎地根据自己的实际需求选取恰当的插值方法。
在 python
中的缺失值用 None
表示,该元素除了等于自己本身之外,与其他任何元素不相等:
In [41]: None == None
Out[41]: True
In [42]: None == False
Out[42]: False
In [43]: None == []
Out[43]: False
In [44]: None == ''
Out[44]: False
在 numpy
中利用 np.nan
来表示缺失值,该元素除了不和其他任何元素相等之外,和自身的比较结果也返回 False
:
In [45]: np.nan == np.nan
Out[45]: False
In [46]: np.nan == None
Out[46]: False
In [47]: np.nan == False
Out[47]: False
值得注意的是,虽然在对缺失序列或表格的元素进行比较操作的时候, np.nan
的对应位置会返回 False
,但是在使用 equals
函数进行两张表或两个序列的相同性检验时,会自动跳过两侧表都是缺失值的位置,直接返回 True
:
In [48]: s1 = pd.Series([1, np.nan])
In [49]: s2 = pd.Series([1, 2])
In [50]: s3 = pd.Series([1, np.nan])
In [51]: s1 == 1
Out[51]:
0 True
1 False
dtype: bool
In [52]: s1.equals(s2)
Out[52]: False
In [53]: s1.equals(s3)
Out[53]: True
在时间序列的对象中, pandas
利用 pd.NaT
来指代缺失值,它的作用和 np.nan
是一致的(时间序列的对象和构造将在第十章讨论):
In [54]: pd.to_timedelta(['30s', np.nan]) # Timedelta中的NaT
Out[54]: TimedeltaIndex(['0 days 00:00:30', NaT], dtype='timedelta64[ns]', freq=None)
In [55]: pd.to_datetime(['20200101', np.nan]) # Datetime中的NaT
Out[55]: DatetimeIndex(['2020-01-01', 'NaT'], dtype='datetime64[ns]', freq=None)
那么为什么要引入 pd.NaT
来表示时间对象中的缺失呢?仍然以 np.nan
的形式存放会有什么问题?在 pandas
中可以看到 object
类型的对象,而 object
是一种混杂对象类型,如果出现了多个类型的元素同时存储在 Series
中,它的类型就会变成 object
。例如,同时存放整数和字符串的列表:
In [56]: pd.Series([1, 'two'])
Out[56]:
0 1
1 two
dtype: object
NaT
问题的根源来自于 np.nan
的本身是一种浮点类型,而如果浮点和时间类型混合存储,如果不设计新的内置缺失类型来处理,就会变成含糊不清的 object
类型,这显然是不希望看到的。
In [57]: type(np.nan)
Out[57]: float
同时,由于 np.nan
的浮点性质,如果在一个整数的 Series
中出现缺失,那么其类型会转变为 float64
;而如果在一个布尔类型的序列中出现缺失,那么其类型就会转为 object
而不是 bool
:
In [58]: pd.Series([1, np.nan]).dtype
Out[58]: dtype('float64')
In [59]: pd.Series([True, False, np.nan]).dtype
Out[59]: dtype('O')
因此,在进入 1.0.0
版本后, pandas
尝试设计了一种新的缺失类型 pd.NA
以及三种 Nullable
序列类型来应对这些缺陷,它们分别是 Int, boolean
和 string
。
从字面意义上看 Nullable
就是可空的,言下之意就是序列类型不受缺失值的影响。例如,在上述三个 Nullable
类型中存储缺失值,都会转为 pandas
内置的 pd.NA
:
In [60]: pd.Series([np.nan, 1], dtype = 'Int64') # "i"是大写的
Out[60]:
0
1 1
dtype: Int64
In [61]: pd.Series([np.nan, True], dtype = 'boolean')
Out[61]:
0
1 True
dtype: boolean
In [62]: pd.Series([np.nan, 'my_str'], dtype = 'string')
Out[62]:
0
1 my_str
dtype: string
在 Int
的序列中,返回的结果会尽可能地成为 Nullable
的类型:
In [63]: pd.Series([np.nan, 0], dtype = 'Int64') + 1
Out[63]:
0
1 1
dtype: Int64
In [64]: pd.Series([np.nan, 0], dtype = 'Int64') == 0
Out[64]:
0
1 True
dtype: boolean
In [65]: pd.Series([np.nan, 0], dtype = 'Int64') * 0.5 # 只能是浮点
Out[65]:
0
1 0.0
dtype: Float64
对于 boolean
类型的序列而言,其和 bool
序列的行为主要有两点区别:
第一点是带有缺失的布尔列表无法进行索引器中的选择,而 boolean
会把缺失值看作 False
:
In [66]: s = pd.Series(['a', 'b'])
In [67]: s_bool = pd.Series([True, np.nan])
In [68]: s_boolean = pd.Series([True, np.nan]).astype('boolean')
# s[s_bool] # 报错
In [69]: s[s_boolean]
Out[69]:
0 a
dtype: object
第二点是在进行逻辑运算时, bool
类型在缺失处返回的永远是 False
,而 boolean
会根据逻辑运算是否能确定唯一结果来返回相应的值。那什么叫能否确定唯一结果呢?举个简单例子: True | pd.NA
中无论缺失值为什么值,必然返回 True
; False | pd.NA
中的结果会根据缺失值取值的不同而变化,此时返回 pd.NA
; False & pd.NA
中无论缺失值为什么值,必然返回 False
。
In [70]: s_boolean & True
Out[70]:
0 True
1
dtype: boolean
In [71]: s_boolean | True
Out[71]:
0 True
1 True
dtype: boolean
In [72]: ~s_boolean # 取反操作同样是无法唯一地判断缺失结果
Out[72]:
0 False
1
dtype: boolean
关于 string
类型的具体性质将在下一章文本数据中进行讨论。
一般在实际数据处理时,可以在数据集读入后,先通过 convert_dtypes
转为 Nullable
类型:
In [73]: df = pd.read_csv('data/learn_pandas.csv')
In [74]: df = df.convert_dtypes()
In [75]: df.dtypes
Out[75]:
School string
Grade string
Name string
Gender string
Height Float64
Weight Int64
Transfer string
Test_Number Int64
Test_Date string
Time_Record string
dtype: object
当调用函数 sum, prob
使用加法和乘法的时候,缺失数据等价于被分别视作0和1,即不改变原来的计算结果:
In [76]: s = pd.Series([2,3,np.nan,4,5])
In [77]: s.sum()
Out[77]: 14.0
In [78]: s.prod()
Out[78]: 120.0
当使用累计函数时,会自动跳过缺失值所处的位置:
In [79]: s.cumsum()
Out[79]:
0 2.0
1 5.0
2 NaN
3 9.0
4 14.0
dtype: float64
当进行单个标量运算的时候,除了 np.nan ** 0
和 1 ** np.nan
这两种情况为确定的值之外,所有运算结果全为缺失( pd.NA
的行为与此一致 ),并且 np.nan
在比较操作时一定返回 False
,而 pd.NA
返回 pd.NA
:
In [80]: np.nan == 0
Out[80]: False
In [81]: pd.NA == 0
Out[81]:
In [82]: np.nan > 0
Out[82]: False
In [83]: pd.NA > 0
Out[83]:
In [84]: np.nan + 1
Out[84]: nan
In [85]: np.log(np.nan)
Out[85]: nan
In [86]: np.add(np.nan, 1)
Out[86]: nan
In [87]: np.nan ** 0
Out[87]: 1.0
In [88]: pd.NA ** 0
Out[88]: 1
In [89]: 1 ** np.nan
Out[89]: 1.0
In [90]: 1 ** pd.NA
Out[90]: 1
另外需要注意的是, diff, pct_change
这两个函数虽然功能相似,但是对于缺失的处理不同,前者凡是参与缺失计算的部分全部设为了缺失值,而后者缺失值位置会被设为 0% 的变化率:
In [91]: s.diff()
Out[91]:
0 NaN
1 1.0
2 NaN
3 NaN
4 1.0
dtype: float64
In [92]: s.pct_change()
Out[92]:
0 NaN
1 0.500000
2 0.000000
3 0.333333
4 0.250000
dtype: float64
对于一些函数而言,缺失可以作为一个类别处理,例如在 groupby, get_dummies
中可以设置相应的参数来进行增加缺失类别:
In [93]: df_nan = pd.DataFrame({'category':['a','a','b',np.nan,np.nan],
....: 'value':[1,3,5,7,9]})
....:
In [94]: df_nan
Out[94]:
category value
0 a 1
1 a 3
2 b 5
3 NaN 7
4 NaN 9
In [95]: df_nan.groupby('category',
....: dropna=False)['value'].mean() # pandas版本大于1.1.0
....:
Out[95]:
category
a 2
b 5
NaN 8
Name: value, dtype: int64
In [96]: pd.get_dummies(df_nan.category, dummy_na=True)
Out[96]:
a b NaN
0 1 0 0
1 1 0 0
2 0 1 0
3 0 0 1
4 0 0 1
在数据处理中,含有过多缺失值的列往往会被删除,除非缺失情况与标签强相关。下面有一份关于二分类问题的数据集,其中 X_1, X_2
为特征变量, y
为二分类标签。
In [97]: df = pd.read_csv('data/missing_chi.csv')
In [98]: df.head()
Out[98]:
X_1 X_2 y
0 NaN NaN 0
1 NaN NaN 0
2 NaN NaN 0
3 43.0 NaN 0
4 NaN NaN 0
In [99]: df.isna().mean()
Out[99]:
X_1 0.855
X_2 0.894
y 0.000
dtype: float64
In [100]: df.y.value_counts(normalize=True)
Out[100]:
0 0.918
1 0.082
Name: y, dtype: float64
事实上,有时缺失值出现或者不出现本身就是一种特征,并且在一些场合下可能与标签的正负是相关的。关于缺失出现与否和标签的正负性,在统计学中可以利用卡方检验来断言它们是否存在相关性。按照特征缺失的正例、特征缺失的负例、特征不缺失的正例、特征不缺失的负例,可以分为四种情况,设它们分别对应的样例数为 n11,n10,n01,n00 。假若它们是不相关的,那么特征缺失中正例的理论值,就应该接近于特征缺失总数 × 总体正例的比例,即:
其他的三种情况同理。现将实际值和理论值分别记作 Eij,Fij ,那么希望下面的统计量越小越好,即代表实际值接近不相关情况的理论值:
可以证明上面的统计量近似服从自由度为 1 的卡方分布,即 S∼⋅χ2(1) 。因此,可通过计算 P(χ2(1)>S) 的概率来进行相关性的判别,一般认为当此概率小于 0.05
时缺失情况与标签正负存在相关关系,即不相关条件下的理论值与实际值相差较大。
上面所说的概率即为统计学上关于 2×2列联表检验问题的 p 值, 它可以通过 scipy.stats.chi2(S, 1)
得到。请根据上面的材料,分别对 X_1, X_2
列进行检验。
#一脸懵逼,先放个参考答案,迟点补上自己的想法,参考答案真简洁,汗颜
In [123]: df = pd.read_csv('data/missing_chi.csv')
In [124]: cat_1 = df.X_1.fillna('NaN').mask(df.X_1.notna()).fillna("NotNaN")
In [125]: cat_2 = df.X_2.fillna('NaN').mask(df.X_2.notna()).fillna("NotNaN")
In [126]: df_1 = pd.crosstab(cat_1, df.y, margins=True)
In [127]: df_2 = pd.crosstab(cat_2, df.y, margins=True)
In [128]: def compute_S(my_df):
.....: S = []
.....: for i in range(2):
.....: for j in range(2):
.....: E = my_df.iat[i, j]
.....: F = my_df.iat[i, 2]*my_df.iat[2, j]/my_df.iat[2,2]
.....: S.append((E-F)**2/F)
.....: return sum(S)
.....:
In [129]: res1 = compute_S(df_1)
In [130]: res2 = compute_S(df_2)
In [131]: from scipy.stats import chi2
In [132]: chi2.sf(res1, 1) # X_1检验的p值 # 不能认为相关,剔除
Out[132]: 0.9712760884395901
In [133]: chi2.sf(res2, 1) # X_2检验的p值 # 认为相关,保留
Out[133]: 7.459641265637543e-166
结果与 scipy.stats.chi2_contingency
在不使用 Yates 修正的情况下完全一致:
In [134]: from scipy.stats import chi2_contingency
In [135]: chi2_contingency(pd.crosstab(cat_1, df.y), correction=False)[1]
Out[135]: 0.9712760884395901
In [136]: chi2_contingency(pd.crosstab(cat_2, df.y), correction=False)[1]
Out[136]: 7.459641265637543e-166
KNN
是一种监督式学习模型,既可以解决回归问题,又可以解决分类问题。对于分类变量,利用 KNN
分类模型可以实现其缺失值的插补,思路是度量缺失样本的特征与所有其他样本特征的距离,当给定了模型参数 n_neighbors=n
时,计算离该样本距离最近的 n
个样本点中最多的那个类别,并把这个类别作为该样本的缺失预测类别,具体如下图所示,未知的类别被预测为黄色:
上面有色点的特征数据提供如下:
In [101]: df = pd.read_excel('data/color.xlsx')
In [102]: df.head(3)
Out[102]:
X1 X2 Color
0 -2.5 2.8 Blue
1 -1.5 1.8 Blue
2 -0.8 2.8 Blue
已知待预测的样本点为 X1=0.8,X2=−0.2 ,那么预测类别可以如下写出:
In [103]: from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier
In [104]: clf = KNeighborsClassifier(n_neighbors=6)
In [105]: clf.fit(df.iloc[:,:2], df.Color)
Out[105]: KNeighborsClassifier(n_neighbors=6)
In [106]: clf.predict([[0.8, -0.2]])
Out[106]: array(['Yellow'], dtype=object)
对于回归问题而言,需要得到的是一个具体的数值,因此预测值由最近的 n
个样本对应的平均值获得。请把上面的这个分类问题转化为回归问题,仅使用 KNeighborsRegressor
来完成上述的 KNeighborsClassifier
功能。
请根据第1问中的方法,对 audit
数据集中的 Employment
变量进行缺失值插补。
In [107]: df = pd.read_csv('data/audit.csv')
In [108]: df.head(3)
Out[108]:
ID Age Employment Marital Income Gender Hours
0 1004641 38 Private Unmarried 81838.00 Female 72
1 1010229 35 Private Absent 72099.00 Male 30
2 1024587 32 Private Divorced 154676.74 Male 40
参考答案:
In [137]: from sklearn.neighbors import KNeighborsRegressor
In [138]: df = pd.read_excel('data/color.xlsx')
In [139]: df_dummies = pd.get_dummies(df.Color)
In [140]: stack_list = []
In [141]: for col in df_dummies.columns:
.....: clf = KNeighborsRegressor(n_neighbors=6)
.....: clf.fit(df.iloc[:,:2], df_dummies[col])
.....: res = clf.predict([[0.8, -0.2]]).reshape(-1,1)
.....: stack_list.append(res)
.....:
In [142]: code_res = pd.Series(np.hstack(stack_list).argmax(1))
In [143]: df_dummies.columns[code_res[0]]
Out[143]: 'Yellow'
In [144]: from sklearn.neighbors import KNeighborsRegressor
In [145]: df = pd.read_csv('data/audit.csv')
In [146]: res_df = df.copy()
In [147]: df = pd.concat([pd.get_dummies(df[['Marital', 'Gender']]),
.....: df[['Age','Income','Hours']].apply(
.....: lambda x:(x-x.min())/(x.max()-x.min())), df.Employment],1)
.....:
In [148]: X_train = df.query('Employment.notna()')
In [149]: X_test = df.query('Employment.isna()')
In [150]: df_dummies = pd.get_dummies(X_train.Employment)
In [151]: stack_list = []
In [152]: for col in df_dummies.columns:
.....: clf = KNeighborsRegressor(n_neighbors=6)
.....: clf.fit(X_train.iloc[:,:-1], df_dummies[col])
.....: res = clf.predict(X_test.iloc[:,:-1]).reshape(-1,1)
.....: stack_list.append(res)
.....:
In [153]: code_res = pd.Series(np.hstack(stack_list).argmax(1))
In [154]: cat_res = code_res.replace(dict(zip(list(
.....: range(df_dummies.shape[0])),df_dummies.columns)))
.....:
In [155]: res_df.loc[res_df.Employment.isna(), 'Employment'] = cat_res.values
In [156]: res_df.isna().sum()
Out[156]:
ID 0
Age 0
Employment 0
Marital 0
Income 0
Gender 0
Hours 0
dtype: int64