解:
话不多说,上代码,自己写的,通用版,看到网上有多个不同版本的答案,还都是手算的,很佩服这些大佬的耐心,那么多的小数,一点点的算。第一个函数Bw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation)为后向算法,名字里面的Bw表示BackWards
# -*- coding: utf-8 -*-
import numpy as np
def Bw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation):
'''
Parameters
----------
A : np.float32 matrix
是隐马模型的状态转移矩阵.
B : np.float32 matrix
观测概率矩阵.
start_p : np.float32 matrix
初始状态概率分布.
list_observation:list
用于计算特定序列的概率
Returns
-------
float32 .
是P(O|lamda)
'''
#后向的递归计算需要初始化一个全一的大小为N*1的矩阵
N=np.shape(A)[0]
p=np.ones((N,1),dtype=np.float32)
T=len(list_observation)#观测序列的长度
for i in range(T-1):
#将观测矩阵里面的第list_observation[T-i-1]列取出来
v=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[T-i-1]]],dtype=np.float32))
p=np.matmul(A,v*p)#这行代码既有矩阵乘法,也有矩阵点乘
o1=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[0]]],dtype=np.float32))
return np.sum(start_p*o1*p)#注意里面的矩阵乘法是点乘操作,也就是将对应位置的元素相乘
def Fw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation):
"""
Parameters
----------
A : np.float32 matrix
是隐马模型的状态转移矩阵.
B : np.float32 matrix
观测概率矩阵.
start_p : np.float32 matrix
初始状态概率分布.
list_observation:list
用于计算特定序列的概率
Returns
-------
float32 .
是P(O|lamda)
"""
o1=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[0]]],dtype=np.float32))
p=start_p*o1
T=len(list_observation)#观测序列的长度
for i in range(T-1):
p=np.matmul(np.transpose(A),p)*np.transpose(np.array([B[:,list_observation[i+1]]],dtype=np.float32))
#要注意上面这行代码里面的矩阵乘法和矩阵点乘
print(p,'\n')
return np.sum(p)
if __name__=='__main__':
A=np.array([[0.5,0.2,0.3],
[0.3,0.5,0.2],
[0.2,0.3,0.5]],dtype=np.float32)
B=np.array([[0.5,0.5],
[0.4,0.6],
[0.7,0.3]],dtype=np.float32)
start_p=np.array([[0.2],[0.4],[0.4]],dtype=np.float32)
list_observation=[0,1,0,1]
s_fw=Fw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation)
s_bw=Bw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation)
print('前向算法的结果是: ',s_fw)
print('后向算法的结果是: ',s_bw)
运行结果是:
前向算法的结果是: 0.060090814
后向算法的结果是: 0.060090803
由上图可以看到,这里输出的结果有十分微小的差距,这是因为计算机的截断误差导致的
解:
如果想要计算这个题的答案的话,还需要修改下上题的程序。李航老师书上有计算公式
P ( i t = q i ∣ O , λ ) = P ( i t = q i , O ∣ λ ) P ( O ∣ λ ) = α t ( i ) ∗ β t ( i ) P ( O ∣ λ ) P(i_{t}=q_{i}|O,\lambda )=\frac{P(i_{t}=q_{i},O|\lambda )}{P(O|\lambda )}=\frac{\alpha _{t}(i)*\beta _{t}(i)}{P(O|\lambda )} P(it=qi∣O,λ)=P(O∣λ)P(it=qi,O∣λ)=P(O∣λ)αt(i)∗βt(i)
公式分析:上面公式的第一个等号成立使用了条件概率和联合概率之间的计算关系----贝叶斯公式
关键在于如何获取计算过程中的迭代向量,然后个别得到上面公式要求的,再按照公式计算就行了。
import numpy as np
def Bw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation):
'''
Parameters
----------
A : np.float32 matrix
是隐马模型的状态转移矩阵.
B : np.float32 matrix
观测概率矩阵.
start_p : np.float32 matrix
初始状态概率分布.
list_observation:list
用于计算特定序列的概率
Returns
-------
float32 .
是P(O|lamda)
'''
P=[]
#后向的递归计算需要初始化一个全一的大小为N*1的矩阵
N=np.shape(A)[0]
p=np.ones((N,1),dtype=np.float32)
P.append(p)
T=len(list_observation)#观测序列的长度
for i in range(T-1):
#将观测矩阵里面的第list_observation[T-i-1]列取出来
v=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[T-i-1]]],dtype=np.float32))
p=np.matmul(A,v*p)#这行代码既有矩阵乘法,也有矩阵点乘
P.append(p)
o1=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[0]]],dtype=np.float32))
return np.sum(start_p*o1*p),P#注意里面的矩阵乘法是点乘操作,也就是将对应位置的元素相乘
def Fw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation):
"""
Parameters
----------
A : np.float32 matrix
是隐马模型的状态转移矩阵.
B : np.float32 matrix
观测概率矩阵.
start_p : np.float32 matrix
初始状态概率分布.
list_observation:list
用于计算特定序列的概率
Returns
-------
float32 .
是P(O|lamda)
"""
P=[]
o1=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[0]]],dtype=np.float32))
p=start_p*o1
P.append(p)
T=len(list_observation)#观测序列的长度
for i in range(T-1):
p=np.matmul(np.transpose(A),p)*np.transpose(np.array([B[:,list_observation[i+1]]],dtype=np.float32))
#要注意上面这行代码里面的矩阵乘法和矩阵点乘
P.append(p)
return np.sum(p),P
if __name__=='__main__':
A=np.array([[0.5,0.1,0.4],
[0.3,0.5,0.2],
[0.2,0.2,0.6]],dtype=np.float32)
B=np.array([[0.5,0.5],
[0.4,0.6],
[0.7,0.3]],dtype=np.float32)
start_p=np.array([[0.2],[0.3],[0.5]],dtype=np.float32)
list_observation=[0,1,0,0,1,0,1,1]
s_fw,P_fw=Fw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation)
s_bw,P_bw=Bw_Recurrent(A,B,start_p,list_observation)
print('前向算法的结果是: ',s_fw)
print('后向算法的结果是: ',s_bw)
print('result is :',P_fw[3][2]*P_bw[4][2]/s_bw)
计算结果是:
前向算法的结果是: 0.00347671
后向算法的结果是: 0.0034767103
result is : [0.5369518]
解:
看到维特比算法在很多地方都有应用,但是在不同的地方应用的方式是不同的,如果给了栅栏网图,并且再给每一条边都附上权值,我相信很多都会计算,但是,不同的应用场景中,如何计算这个权值是个关键,根据书上列好的算法无论是写程序还是计算起来都很简单,但是,我觉得关键是如何做到活学活用。在不同的场景里面应用自如。好蓝呀!!!
一个算法学了差不多一个下午,但是感觉还是差点感性认识。就这样吧,上代码
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Created on Mon Oct 12 15:52:10 2020
@author: DELL
"""
import numpy as np
def viterbi_decode(A,B,start_p,list_observation):
'''
Parameters
----------
A : 2D matrix float
状态转移矩阵.
B : 2D matrix float
观测概率矩阵.
start_p : float matrix
初始状态概率分布.
observation_list : list
观测序列.
Returns
-------
最优路径.
'''
best_path=[]
T=len(list_observation)
#初始化
N=A.shape[0]#状态个数
O1=np.transpose(np.array([B[:,list_observation[0]]],dtype=np.float32))
delta=start_p*O1
print(delta,'\n')
all_psi=[]
psi=np.zeros([N,1],dtype=np.float32)
for i in range(T-1):
psi=np.argmax(delta*A,axis=0)
delta=np.transpose(np.array([np.max(delta*A,axis=0)]))*np.transpose(np.array([B[:,list_observation[i+1]]],dtype=np.float32))
all_psi.append(psi)
final_score=np.max(delta)
best_path.append(np.argmax(delta))
for i in range(T-1):
best_path.insert(0,all_psi[T-2-i][best_path[0]])
return final_score,best_path
if __name__=='__main__':
A=np.array([[0.5,0.2,0.3],
[0.3,0.5,0.2],
[0.2,0.3,0.5]],dtype=np.float32)
B=np.array([[0.5,0.5],
[0.4,0.6],
[0.7,0.3]],dtype=np.float32)
start_p=np.array([[0.2],[0.4],[0.4]],dtype=np.float32)
list_observation=[0,1,0,1]
final_score,best_path=viterbi_decode(A,B,start_p,list_observation)
print('最优路径的概率是:',final_score)
print('最优路径为:',best_path)
运行结果是:
最优路径的概率是: 0.0030240004
最优路径为: [2, 1, 1, 1]
分析:因为我的状态代码是从0开始的,因此对应起来的正确路径就是[3,2,2,2]
书上的例子运行结果是:
最优路径的概率是: 0.014700001
最优路径为: [2, 2, 2]
对应起来就是[3,3,3]
t = 1 , 2 , . . . , T − 1 t=1,2,...,T-1 t=1,2,...,T−1
Proof:
根据后向算法的递推公式计算可得: β t ( i ) = ∑ j = 1 N a i j b j ( o t + 1 ) β t + 1 ( j ) i = 1 , 2 , . . . , N (1) \beta _{t}(i)=\sum_{j=1}^{N}a_{ij}b_{j}(o_{t+1})\beta _{t+1}(j)\quad i=1,2,...,N\tag{1} βt(i)=j=1∑Naijbj(ot+1)βt+1(j)i=1,2,...,N(1)
又根据李航老师书上的公式可得:
P ( O ∣ λ ) = ∑ j = 1 N α t ( j ) β t ( j ) (2) P(O|\lambda )=\sum_{j=1}^{N}\alpha _{t}(j)\beta _{t}(j) \tag{2} P(O∣λ)=j=1∑Nαt(j)βt(j)(2)
就算不使用李航老师书上的公式,也可以很简单的推出公式(2)
下面推导一下:
P ( O ∣ λ ) = ∑ i = 1 N ∑ j = 1 N α t ( i ) a i j b j ( o t + 1 ) β t + 1 ( j ) = ∑ i = 1 N α t ( i ) ∑ j = 1 N a i j b j ( o t + 1 ) β t + 1 ( j ) P(O|\lambda )=\sum_{i=1}^{N}\sum_{j=1}^{N}\alpha _{t}(i)a_{ij}b_{j}(o_{t+1})\beta _{t+1}(j)=\sum_{i=1}^{N}\alpha _{t}(i)\sum_{j=1}^{N}a_{ij}b_{j}(o_{t+1})\beta _{t+1}(j) P(O∣λ)=i=1∑Nj=1∑Nαt(i)aijbj(ot+1)βt+1(j)=i=1∑Nαt(i)j=1∑Naijbj(ot+1)βt+1(j)
= ∑ i = 1 N α t ( i ) β t ( i ) =\sum_{i=1}^{N}\alpha _{t}(i)\beta _{t}(i) =i=1∑Nαt(i)βt(i)
下面给出详细的证明。(2)式的推导需要用到联合分布与边际分布之间的关系。还有最重要的就是一个假设:观测独立性假设,也就是任意时刻的观测值只依赖于该时刻马尔可夫链的状态值,与其他状态和观测值无关。下面的公式(3)成立。
P ( o t ∣ i T , o T , i T − 1 , o T − 1 , . . . , i 1 , o 1 ) = p ( o t ∣ i t ) (3) P(o_{t}|i_{T},o_{T},i_{T-1},o_{T-1},...,i_{1},o_{1})=p(o_{t}|i_{t})\tag{3} P(ot∣iT,oT,iT−1,oT−1,...,i1,o1)=p(ot∣it)(3)
根据联合分布于边际分布之间的关系。那么就有:
P ( O ∣ λ ) = ∑ i = 1 N P ( O , i t = q i ∣ λ ) (4) P(O|\lambda )=\sum_{i=1}^{N}P(O,i_{t}=q_{i}|\lambda )\tag{4} P(O∣λ)=i=1∑NP(O,it=qi∣λ)(4)
上式的意义也就是对所有的在 i t i_{t} it时刻的状态求和得到边际分布 P ( O ∣ λ ) P(O|\lambda ) P(O∣λ)
再根据前向算法后向算法的定义,所以有:
P ( O ∣ λ ) = ∑ i = 1 N P ( O , i t = q i ∣ λ ) = ∑ i = 1 N P ( o 1 , o 2 , . . . , o t , . . . , o T , i t = q t ∣ λ ) P(O|\lambda)=\sum_{i=1}^{N}P(O,i_{t}=q_{i}|\lambda )=\sum_{i=1}^{N}P(o_{1},o_{2},...,o_{t},...,o_{T},i_{t}=q_{t}|\lambda ) P(O∣λ)=i=1∑NP(O,it=qi∣λ)=i=1∑NP(o1,o2,...,ot,...,oT,it=qt∣λ)
= ∑ i = 1 N P ( o 1 , o 2 , . . . , o t , i t = q t ∣ λ ) ∗ P ( o t + 1 , . . . , o T ∣ o 1 , o 2 , . . . , o t , i t = q t , λ ) =\sum_{i=1}^{N}P(o_{1},o_{2},...,o_{t},i_{t}=q_{t}|\lambda )*P(o_{t+1},...,o_{T}|o_{1},o_{2},...,o_{t},i_{t}=q_{t},\lambda) =i=1∑NP(o1,o2,...,ot,it=qt∣λ)∗P(ot+1,...,oT∣o1,o2,...,ot,it=qt,λ)
= ∑ i = 1 N P ( o 1 , o 2 , . . . , o t , i t = q t ∣ λ ) ∗ P ( o t + 1 , . . . , o T ∣ i t = q t , λ ) =\sum_{i=1}^{N}P(o_{1},o_{2},...,o_{t},i_{t}=q_{t}|\lambda )*P(o_{t+1},...,o_{T}|i_{t}=q_{t},\lambda) =i=1∑NP(o1,o2,...,ot,it=qt∣λ)∗P(ot+1,...,oT∣it=qt,λ)
= ∑ j = 1 N α t ( j ) β t ( j ) t = 1 , 2 , . . . , T − 1 =\sum_{j=1}^{N}\alpha _{t}(j)\beta _{t}(j) \quad t=1,2,...,T-1 =j=1∑Nαt(j)βt(j)t=1,2,...,T−1
得证。
独立性的假设是一个比较强的条件,其实现实往往很复杂,这里只是简化了条件,不然估计很多理论难以实现到实际中去。
解:
维特比算法计算的是时刻t是给定观测序列 o 1 , o 2 , . . . , o t o_{1},o_{2},...,o_{t} o1,o2,...,ot计算到目前时刻t的所有状态取值的的概率最大值。
而前向算法的计算却是给定初始状态分布,计算观测序列的概率值。