Linux 常用命令总结

code 含义
pwd print working directory,显示当前路径
mkdir make directory, 创建空目录
mkdir -p 后跟路径,一次性创建多级目录
ls list,显示目录&文件
-t 按照时间排序
-h 显示文本大小
-l 显示长的完整信息
-a 隐藏文件
-r 逆向
rm remove, 删除
rmdir 删除空目录
rm -r 删除非空目录
rm -rf 强制删除
cd change directory, 返回目录
cd .. 返回上一级目录
vi 新建脚本或文本文档
cat 查看全文并将内容输出至屏幕
cat -n 查看,输出,加上行号
cp file1 file2 将文件1复制为文件2
mv file /root/路径 移动
mv file1 file2 将file1名称改为file2

conda使用相关

code 含义
conda list 查看已安装的软件
conda search fastqc 搜索软件
conda install fastqc -y 安装
conda install fastqc=0.11.7 -y 指定版本号安装
conda remove fastqc -y 卸载

定制conda环境

code 含义
conda info --envs 查看有哪些conda envs
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y 新建 conda envs
conda activate rna-seq 激活conda envs
conda remove -n rna-seq fastqc -y 卸载conda envs中的软件
conda deactivate 退出当前环境
conda remove -n rna-seq --all 卸载整个环境

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