初识 PyRadiomics

PyRadiomics是一个开源的Python软件包，用于从医学成像中提取放射组学特征。

使用SimeLITK进行图像加载和处理，SimeLITK支持的所有图像类型可以用作PyRadiomics的输入，如果是DICOM格式的图像必须使用SimeLITK功能加载DICOM图像，然后传递生成的图像对象。

不支持Python  2.6以下的python版本。

 

安装

• git clone git://github.com/Radiomics/pyradiomics
• cd pyradiomics
• python -m pip install -r requirements.txt
• python setup.py install

 

可用的图像类型

• Original
• Wavelet
• LoG
• Square
• SquareRoot
• Logarithm
• Exponential
• Gradient
• LocalBinaryPattern2D
• LocalBinaryPattern3D

 

可提取的特征类

• firstorder
• shape
• glcm    （Gray Level Cooccurence Matrix）
• glrlm     (Gray Level Run Length Matrix)
• glszm    (Gray Level Size Zone Matrix)
• gldm      (Gray Level Dependence Matrix)
• ngtdm    (Neigbouring Gray Tone Difference Matrix)

特征类是动态确定的，来自每个可用的图像类型。