TBtools使用笔记

TBtools 是一个集合了超多生信处理的小工具，非常方便，而且是无命令行的操作，入门门槛极低。开发者是华南农业大学陈程杰博士，TBtools文章地址：https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/27/289660。最近正好处理基因家族的数据，需要批量处理，但是编程能力又不行，找到了这个工具。下面是我的学习笔记：

1. 从fasta文件提取Gene_ID

TBtools中的fasta stater和fasta table converter工具可以提取ID，但要借助Excel工具。

矩形框中的工具

2. 从fasta文件提取Gene_seq

因为我的基因是不包含转录本的，因为在提取的时候没有匹配到ID号，所以要勾选第二个选项，只要包含就可以。此外，可能最开始需要初始化，建立索引，才能点击start。

Amazing fasta stater

3. 选取最长转录本

在我提取完序列后，我发现存在多个转录本，因此一般我们选择最长的转录本。

fasta longest representative

4. 查看fasta文件的概要信息

可以看到左下角的总的信息概要，序列数等

fasta stater