【生物信息笔记...】Linux awk命令

什么是awk？

AWK是一种处理文本文件的语言，是一个强大的文本分析工具。相对于grep的查找，sed的编辑，awk命令显得尤为强大。

awk命令是把文件逐行读出，以空格为默认分隔符将每行切片，切开后的部分进行分析处理。

AWK的版本：awk，nawk和gawk。再没说明的情况下是gawk（是AWK的GNU版本）

使用方法／语法：

awk '{pattern+action}’ {filenames}

pattern: 表示AWK在数据中查找的内容 如 $1==2 找出第一列是2的，这里美元符号代表被分隔符分开的域，默认是空格。那么$2就是第二列里，$0代表全部。

action: 找到后需要执行的命令 如：print

例如：

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grep 更适合单纯的查找或匹配文本

sed 更适合编辑匹配到的文本

awk 更适合格式化文本，对文本进行较复杂格式处理

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参考：http://www.runoob.com/linux/linux-comm-awk.html