Barata 2006 ssr分组与测交系田间数据分组的比较 玉米

1. Barata C, Carena MJ. Classification of North Dakota maize inbred lines into heterotic groups based on molecular and testcross data. Euphytica. 2006;151:339–49.

建立杂种优势组，杂种优势模式之间的最佳组合，对于成功的玉米（Zea Mays L.）杂种的开发至关重要。在玉米育种程序中使用分子标记可能或可能不会通过将多种近交系分类成杂种优势群来提高杂种优势预测的效率。本研究的目的是将精英北达科他（ND）玉米近交系分类为杂种优势组，并评估简单序列重复（SSR）分组和测交数据之间的一致性。代表不同遗传背景的十三个ND近交系在2000年的双列交配设计中杂交。在2001和2002年在四个ND环境中评估杂交和12个测交。此外，这些品系与表示已知杂种优势组的商业近交测试者杂交在2003年的三个ND环境中评估了公共系和私有系之间的杂交。用49 SSR标记筛选了代表Lancaster Sure Crop，Iowa Stiff Stalk Synthetic (BSSS)，明尼苏达＃13，西北Dent，Golden Glow pedigrees和ND近交系。近交系ND246，ND278，ND280，ND281，ND282和ND284聚在BSSS杂种优势组内。近交ND277，ND285，ND286，ND290和ND291组更接近兰Lancaster Sure Crop杂种优势组。近交系ND257和ND288分组在明尼苏达州＃13。来自ND278和ND290测交的数据显示了与代表多于一个杂种优势组的测试者有良好配合能力。我们的研究表明，即使当可利用的种质与所建议的有相反的多样性时，遗传上相似的种质组也不能用分子标记准确和可靠地鉴定。因此，推荐广泛的田间评估来分类无关的近交系玉米。

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成功的玉米（Zea Mays L.）杂种的开发需要建立杂种优势模式，优势模式定义为表达高水平杂种优势的已知基因型之间的交配（cross）（Carena＆Hallauer，2001）。最受开发的杂种优势模式是Iowa Stiff Stalk Synthetic（BSSS）和Lancaster Sure Crop杂种优势组之间的交配。已知来自不相关杂种优势群的近交系之间的杂交具有比属于同一组的品系之间的杂交有更好的谷粒产量表现（Moll等人，1965; Hallauer等人，1988; Melchinger，1999）。
分子标记已被证明可用于将无关的近交系分类为杂种群（Smith等人，1997; Pejic等人，1998; Senior等人1998; Lu和Bernardo，2001; Li等人，2002） 。基于这些信息，玉米育种程序中分子标记的整合可以提高它们的效率。然而，由于在多特征和多阶段选择中遇到的复杂性以及经济上重要性状的遗传学的复杂性，分子标记在育种程序中仍然没有显着的作用（Hallauer，1999）。因此，近交系到杂种优势群的分子分类可能不可靠，特别是对于不相关的群体。
简单序列重复（SSR）已被广泛用作真核基因组中的遗传标记（Tautz，1989）。这种比较比扩增片段长度多态性（AFLP），随机扩增多态性DNA（RAPD）和限制性片段长度多态性（RFLP）标记（Pejic等人，1998; Senior等人，1998; Gethi等人，2002）有一些优点。
在北达科他州立大学，多种自交系的杂交形成了基础种群。对于每个群体，基于其对谷物产量性能，茎和根倒伏抗性和早熟的良好配合力选择近交系（表1）。在本研究中使用的近交系从ND基本种群中获得，并且没有归入杂种优势群（表2）。本研究的目的是将ND系分类到杂种优势群，并评价SSR分组与测交田间数据的一致性。