Bioconductor的镜像修改

今天突然发现一直能用的BiocManager::install很慢，好像一直加载不出来。刚开始还以为是实验室的网不行了，但 install.package()的包却很快。所以我怀疑可能是Biocondutcor的镜像问题，问了师兄之后才知道如何设置Bioconductor的镜像。

# 输入下面这个命令，然后就会跳出来选项让你选。选6即可
> chooseBioCmirror()
Secure BioC mirrors 

1: 0-Bioconductor (World-wide) [https]
2: Japan (Tachikawa) [https]
3: Japan (Wako) [https]
4: Australia (Sydney) [https]
5: CRAN ASIA (Korea, Japan and Singapore) (Seoul) [https]
6: China (Peking) [https]
7: (other mirrors)

Selection: 6

在改完镜像之后，果然体会到了飞一般的速度╮（╯＿╰）╭。

当然我们也可以在 ~/.Rprofile 里直接修改。

# 打开.Rprofile
file.edit('~/.Rprofile')

# 这是清华源的镜像
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")

另外附上Bioconductor的其他镜像：镜像地址

参考

• 不用biocLite安装Bioconductor包
• R包精讲第三篇：如何切换镜像？
• R安装升级后的若干规定动作
• 师兄