如何将多个小分子文件合并为单个

开年第一篇:


(1)linux系统下直接输入使用cat命令

具体用法:

cat 小分子文件名 > 单个小分子的文件名

例:文件夹下小分子名称为

1.sdf 

2.sdf 

 3.sdf

指令为:

cat *.sdf > three-to-one.sdf

cat 1.sdf 2.sdf 3.sdf >  three-to-one.sdf


(2)使用openbabel,开源化学信息学软件,win下,linux皆可

网址为:http://openbabel.org/wiki/Main_Page

具体用法:obabel 输入文件名 -osdf -O 输出文件名

例:

1.mol

2.mol

3.mol

指令:obabel *.mol -osdf -O new.sdf

注:-osdf 此处sdf为输出文件的格式,如果你想要mol2,即转化为-omol2


元宵节快乐。

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