关于canu的使用测试

由于我有自己的三代subreads需要组装，我先看一下canu组装的效果，再此之前，先用官方提供的测试数据Escherichia coli K12（来自Pacific Biosciences）进行操作
首先进入canu的官方站

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然后找到下载的界面

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下载安装canu的方式有两种source code和binary distribution
安装步骤一步步下载安装即可
下载安装好之后，就下载官方提供的Escherichia coli K12的fastq文件

curl -L -o pacbio.fastq http://gembox.cbcb.umd.edu/mhap/raw/ecoli_p6_25x.filtered.fastq

因为我自己的数据是PacBio的，所以我也就下载了Escherichia coli K12的PacBio的测序数据。