应用CNN识别脑部MRI图像梗塞病变之开发环境搭建

基于应用卷积神经网络进行MRI脑部梗塞的识别这一问题,我会将自己的开发思路分篇记录下来,包括从开发环境的搭建,所应用的相关Python库的安装,到数据处理,再到模型搭建和测试。事实上到目前为止,迫于有限的数据量,我还没有取得突破性的进展,但是要将近期的开发过程记录下来,以备查看。以下直接切入主题。

1 开发环境配置

硬件环境: Intel(R) Core(TM) i7-6700 3.4G 主频,4G内存 无独显。这是目前的一个调试代码的机器,所以配置不高。

软件环境:OS是Ubuntu 16.04.03 LTS 64位

开发语言:Python2.7.12/Python3.5.2

2 操作系统安装

不建议使用Windows + Vmware虚拟机的架构,机器学习的code跑起来非常耗内存和CPU,安装虚拟机,在调试代码阶段就慢的像蜗牛。我直接将Win10的OS换作的Ubuntu16.04的OS,我更习惯在Ubuntu系统下安装各种Python库。以下给出在Win10环境下制作Ubuntu的USB启动卡及系统安装的简要步骤,事实上Ubuntu官网上有详细的指导说明,我在这里略加提炼,以便使操作更简洁快速点:

Ubuntu官网:https://www.ubuntu.com/download/desktop

进入官网后,点击Download button可以下载最新版本的Ubuntu,如果不选择最新版本,则点击see our alternative downloads。


应用CNN识别脑部MRI图像梗塞病变之开发环境搭建_第1张图片

点击see our alternative downloads 进入下载页面:https://www.ubuntu.com/download/alternative-downloads

向下滑动滚动条,找到如下图需要的相应的版本进行下载,我安装的是Desktop,Desktop与Server版本最明显的区别就是,Desktop版带GUI,两者在性能上的区别没有亲测过,喜欢纯命令行的guys可以试试Server。


应用CNN识别脑部MRI图像梗塞病变之开发环境搭建_第2张图片

操作系统下载好之后就可以进入重要的制作USB启动卡环节了,容我慢慢道来:

制卡步骤链接:

https://tutorials.ubuntu.com/tutorial/tutorial-create-a-usb-stick-on-windows?_ga=2.169769057.1110157821.1534466551-174346377.1534466551#0

参照如下步骤,并严格执行,最后一定会成功的Yeah。


应用CNN识别脑部MRI图像梗塞病变之开发环境搭建_第3张图片

步骤3中涉及Rufus ,其官网地址:https://rufus.akeo.ie

3 安装Python及必要的Python库

我安装了Python2.7.12和Python3.5.2;安装的Python库如下图导图所示。安装好Python后,安装pip,有了pip后如下库的安装就轻松多了,写个脚本一口气安装完,你就可以去喝杯咖啡了,前提是你的网络速度还可以。


应用CNN识别脑部MRI图像梗塞病变之开发环境搭建_第4张图片

至此我们的基本开发环境就配置ok了,下一篇我就来点干货了。

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