前言
遗传算法,顾名思义和遗传相关,是模拟自然界物竞天择,适者生存的搜索算法。
由于此算法与遗传紧密联系,包含种群(population),个体,基因,交叉(crossover),遗传(mutation),适应度(fitness)等概念。初学者刚学遗传算法,可能会混淆概念。本文尽量以初学者的角度出发,希望写一篇通俗易懂,快速入门遗传算法,并能上手python代码的文章。
原理
1.什么是遗传算法?
遗传算法是用于解决最优化问题的搜索算法。
通俗来说是解决最大值,最小值的问题。同时可以结合其他方法,解决一些线性,非线性的问题。
举个例子:(我们以求最大值为例)
已知:\(m=f(x)+f(y)+f(z)...\)和 x,y,z...的定义域, 求\(m_{max}\)以及此时的x,y,z...?
遗传算法解决问题的思路?
(继续上面的例子)在x,y,z的定义域内随机取几组值,每一组带入方程就有一个m的解。m越大的越靠近最大值,符合我们的要求,就比较好。然后对这几组值,不好的我们就摒弃它,较好的我们就留下它(并且复制一份较好的,代替摒弃了的),这样我们就得到新的几组值更靠近我们的最大值。
这样第一轮就已经结束,我们不断一轮一轮地进行摒弃、留下的选择,代代更替,我们最终将得到最好的,也就是最大值的最优解。
但是,以上忽略了一个问题,我们只从最开始的几组值中选出最好的,就算摒弃了所有不好的,它也只是这几组中得到的最大值的解,很可能不是是全局的最优解。所以我们的解决方法是每轮将其中的某组数据,或者某几组数据进行随机改变,让他产生新的解,这就突破了只有最初几组数据的局部最大值的壁垒。随机产生的可能更大或者更小,更小的被丢弃,更大的留下。逐步逼近全局最大值。
而实际上,我们的初始数据不只几组,可能比较多,每一轮进行迭代,迭代的次数也会非常多。这样,通过大量的迭代轮回最终就会逐渐达到我们的最优解。
引入遗传背景知识
有了上面的大致思路,就可以引入我们的遗传学概念。
- 基因(DNA):对于单个自变量x或y,z...,是一个基因。同时,我们这里基因就是DNA。
- 1个体=1染色体=1种表现型=1组解:虽然人体有23对染色体,但是这里始终是1对1的关系。染色体的提出只是因为染色体上有n组基因(这个我们熟知),而通过1对1的关系可知,个体上就有n组染色体。
- 种群(population):一个种群包含m个个体,即m组解。
- 交叉(crossover):交叉和变异的目的都是为了突破局部,向全局最优解奔去。
交叉就是父母之间的交配,对于父亲\(x_1,y_1,z_1...和母亲x_2,y_2,z_2...\)两组解,将每个基因转换为二进制(转换为二进制对编程操作比较方便,同时对突破局域更有帮助,这里不过多阐述)如:
01001|0011001|0001
+11010|1110110|1101
--------------------------> (哭了,sf不支持的下划线)此句可忽略。
01001|1110110|0001 (中间的交叉互换)
然后通过设置一个交叉率,控制交叉的频率。取值范围一般0.4~0.99
- 变异(mutation):同样使用每个基因的二进制,变异是随机突变。
如:
01001|00110010001
01001|11001101110
从|后面的每一位,0变为1,1变为0.
同时我们会设置较小的变异率,控制变异的发生频率。取值范围一般0.0001~0.1
我们这里再次复述一遍遗传思路:
$$ 随机n组解\longrightarrow(交叉,变异)\longrightarrow儿女n组解\longrightarrow(选择优良)\longrightarrow新一代n组解 $$
变异和交叉我们了解了,那么是如何实现“选择优良”的呢?这里我们引入适应度。
- 适应度(fitness):儿女n组解中每一组解,带入方程都有一个m值,这个m值就是我们的适应度。
适应度百分比:\(儿女每一组解的适应度/儿女所有解的适应度总和\)
适应度百分比就是我们进行选择的概率,越大,我们选择的概率也就越大。不好的选择的概率就越小,从而实现优良选择,得出新的一代。(ps:这种占比越大概率越大的选择方法也叫做轮盘赌选择法)python实现
下面直接上代码,作者写了大量注释,读者从main函数和初始变量开始看,相信非常容易理解。同时运行结果,点击图片可以看到,每轮迭代的模拟过程。
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib import cm
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
CROSSOVER_RATE=0.8
MUTATION_RATE=0.03
POP_SIZE=200#pop是population
DNA_SIZE=24
N_GENERATIONS=50
X_BOUND=[-3,3]
Y_BOUND=[-3,3]
def F(x, y):
return 3*(1-x)**2*np.exp(-(x**2)-(y+1)**2)- 10*(x/5 - x**3 - y**5)*np.exp(-x**2-y**2)- 1/3**np.exp(-(x+1)**2 - y**2)
def plot_3d(ax):
X=np.linspace(*X_BOUND,100)
Y=np.linspace(*Y_BOUND,100)
X,Y=np.meshgrid(X,Y)
Z=F(X,Y)
ax.plot_surface(X,Y,Z,rstride=1,cstride=1,cmap=cm.coolwarm)
ax.set_zlim(-10,10)
ax.set_xlabel('x')
ax.set_ylabel('y')
ax.set_zlabel('z')
plt.pause(3)
plt.show()
def translateDNA(pop):#pop表示种群矩阵,一行表示一个二进制编码的DNA,矩阵的行数表示种群数目
x_pop=pop[:,1::2]#x表示奇数列,即::即从第一列开始,每跳两下,都取一个
y_pop=pop[:,::2]#y表示偶数列
#现在x_pop,y_pop都变成了matrix(popsize,DNAsize)
# pop:(POP_SIZE,DNA_SIZE)*(DNA_SIZE,1) --> (POP_SIZE,1)
x = x_pop.dot(2 ** np.arange(DNA_SIZE)[::-1]) / float(2 ** DNA_SIZE - 1) * (X_BOUND[1] - X_BOUND[0]) + X_BOUND[0]
y = y_pop.dot(2 ** np.arange(DNA_SIZE)[::-1]) / float(2 ** DNA_SIZE - 1) * (Y_BOUND[1] - Y_BOUND[0]) + Y_BOUND[0]
return x, y
def crossover_and_mutation(pop,CROSSOVER_RATE=0.8):
new_pop=[]
for father in pop:#遍历种群中的每一个个体,将该个体作为父亲
child=father#孩子先得到父亲的全部基因
if np.random.rand() Z matrix
fitness=get_fitness(pop)
pop = select(pop, fitness) #选择生成新的种群
print_info(pop)
plt.ioff()
plot_3d(ax)
下面展示,从最开始随机选的200个解,逐渐逼近最优解的过程。
练习
这里放上2022mathcup D题,第一问遗传算法,请读者进行思考,并自行寻找答案。
结语
相信读者已经入门遗传算法,并掌握python代码。
这里补充几点遗传算法的优点:
- 启发式搜索 :逐渐向最优解靠近,不盲目搜索。
- 群体搜索 :多个解并发处理,同时向最优解靠近。
- 适用范围广 :不受连续,可微等条件限制。
以及遗传算法的应用:
遗传算法在人工智能的众多领域便得到了广泛应用。例如,机器学习、聚类、控制(如煤气管道控制)、规划(如生产任务规划)、设计(如通信网络设计、布局设计)、调度(如作业车间调度、机器调度、运输问题)、配置(机器配置、分配问题)、组合优化(如TSP、背包问题)、函数的最大值以及图像处理和信号处理等等。
另一方面,遗传算法与模糊技术,神经网络的结合已经取得了不少成果~
好了,完结撒花~本次分享到此结束,创作不易,你的点赞是我继续创作的动力~