R语言Mfuzz包：分析时间序列的组学数据

Mfuzz包使用情景

如果你有一组时间序列的数据，就可以使用这个R包来分析

比如这篇文章

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看下文章的实验色设计，跨多个时间点的时间序列的转录组学分析

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通过使用Mfuzz包将基因按照表达模式进行聚类，可以直观的看到相同表达模式的基因在不同时间下的变化趋势，下面来介绍下如何使用Mfuzz包

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1.安装Mfuzz包

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

# 安装
BiocManager::install("Mfuzz")
# 加载
library(Mfuzz)
# 调出帮助文档
#browseVignettes("Mfuzz")

2.载入测试数据并清洗数据

输入数据必须是标准化后的数据可以使FPKM或者T