基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建

感谢【windy】同学分享的“基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建”

写的特别详细,有平台的学员可以跟着动手实际操作一遍,要是遇到问题了可以在论坛中【windy】同学的帖子下方留言!

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本次用的数据是BraTs的数据,平台为影像组学实验平台;

1、BraTs数据是四维数据,首先我们需将四维数据转换为三维:

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第1张图片

2、特征提取基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第2张图片

提取出来的特征:

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第3张图片

3、文件整理保存;本部分数据没有诊断信息,我们随机生成诊断信息,并将结果保存成csv文件

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第4张图片

整理后文件格式如下:基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第5张图片

4、开始进入正题,构建。先读取文件并整理。基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第6张图片

5、划分训练集和测试集基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第7张图片

6、模型适配

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第8张图片

7、模型预测和评价

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第9张图片

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第10张图片

 基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第11张图片

9、模型优化

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第12张图片

10、计算ROC曲线

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11、交叉验证

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第14张图片

12、计算特征贡献度

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第15张图片

到此结束。整个流程运行无误,不需要更改代码。

基于影像组学实验平台传统组学特征提取及模型构建_第16张图片

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