matlab制作h5数据集,python - ValueError：HDF5文件中没有来自MatLab h5文件的pandas.read_hdf的数据集 - 堆栈内存溢出...
我得到一个ValueError: No dataset in HDF5 file. 使用时：
In [1]: import pandas as pda
In [2]: store = pda.read_hdf('X.h5')
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
in ()
----> 1 store = pda.read_hdf('X.h5')
/usr/local/miniconda3/envs/tensorFlow-GPU/lib/python3.6/site-packages/pandas/io/pytables.py in read_hdf(path_or_buf, key, mode, **kwargs)
356 groups = store.groups()
357 if len(groups) == 0:
--> 358 raise ValueError('No dataset in HDF5 file.')
359 candidate_only_group = groups[0]
360
ValueError: No dataset in HDF5 file.
h5dump显示：
$ h5dump -n X.h5
HDF5 "X.h5" {
FILE_CONTENTS {
group /
dataset /DS
}
}
如果我使用h5py我可以看到数据：
In [3]: import h5py
/usr/local/miniconda3/envs/tensorFlow-GPU/lib/python3.6/site-packages/h5py/__init__.py:36: FutureWarning: Conversion of the second argument of issubdtype from `float` to `np.floating` is deprecated. In future, it will be treated as `np.float64 == np.dtype(float).type`.
from ._conv import register_converters as _register_converters
In [4]: f = h5py.File('X.h5','r')
In [5]: f.keys()
Out[5]: KeysView()
In [6]: list( f.keys() )
Out[6]: ['DS']
In [7]: f['DS']
Out[7]:
In [8]: f['DS'][:]
Out[8]:
array([[1., 0., 1., 1., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 0., 1., 0., 0., 0., 1.,
0., 1., 0., 0.],
[0., 0., 0., 1., 0., 1., 1., 0., 1., 0., 1., 1., 1., 1., 0., 0.,
1., 1., 0., 0.],
[0., 1., 1., 1., 1., 0., 1., 1., 1., 0., 1., 0., 1., 1., 0., 0.,
1., 1., 0., 0.],
[0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1.,
1., 0., 1., 0.],
[0., 1., 1., 1., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 1., 1., 0., 1.,
0., 1., 0., 0.],
[0., 0., 1., 1., 1., 1., 0., 1., 1., 1., 0., 1., 1., 0., 1., 1.,
1., 1., 0., 0.],
[0., 0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 1., 1., 0., 1.,
1., 1., 0., 1.],
[0., 0., 1., 1., 1., 0., 1., 0., 0., 0., 0., 0., 0., 1., 0., 0.,
0., 1., 0., 1.],
[0., 0., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 0., 0., 1., 1., 1., 0.,
1., 0., 0., 0.],
[0., 1., 0., 1., 1., 1., 1., 1., 1., 0., 0., 1., 1., 1., 0., 1.,
1., 0., 0., 0.]])