Camelyon16数据集踩坑记录

Camelyon16与Camelyon17的数据页面已经整合在一起（https://camelyon17.grand-challenge.org/Data/）。

首先，下载Camelyon16数据集，经过md5sum确认文件无损伤。

安装主办方提供的tiff图像查看软件ASAP，该软件提供了必要的python接口。ASAP软件可由源码编译，也有.deb或.exe文件可直接使用（https://github.com/computationalpathologygroup/ASAP/releases）。先后在Windows和Linux下安装该软件。

Linux版本的.deb软件的1.9、1.8、1.7版本都无法正常打开Camelyon16的train和test的tif文件，软件左下角显示‘Invalid Image type’；配置好的Python接口也无法读取图像文件。而Camelyon17的图像却可以正常打开，Python接口也可以正常访问（另外测试了bigtiff的官方测试图像，也是可以正常打开的）。猜测可能是16年和17年的数据集格式略有不同，而Linux版本的软件维护不周。

Windows版本的.exe 1.9可以解决上述问题，软件及Python接口可以正常访问16年数据集的图像。这也证实了应该是linux软件的问题，而不是图像的问题。Windows下的python需要注意路径字符串使用r表明是原始字符串，不然路径中的\train或\test造成歧义，无法正常读取文件，表现与上述linux相同。

结论：Camelyon16数据集的处理，若需要使用ASAP的Python接口访问，需在Windows下进行。