在Colab上安装pytorch-geometric,导入包时出现libcudart.so.10.2

问题背景描述

在google Colab上使用图神经网络的包pyg,执行过程如下:

Step 1: 在Notebook Setting里设定环境为GPU;

Step 2: 查看Colab里torch的版本信息:

import torch

torch.__version__

注:我使用时输出信息是:1.9.0+cu111

Step 3: 复制pyg文档里的安装命令到notebook的cell里:

!pip install torch-scatter torch-sparse torch-cluster torch-spline-conv torch-geometric -f https://data.pyg.org/whl/torch-1.9.0+cu111.html

安装过程顺利。

Step 4: 测试导入相应的包:

from torch_geometric.data import Data

此时,报错:libcudart.so.10.2: cannot open share object file

解决方法:

在上面的执行过程的Step 3之前先在一个cell里运行如下命令:

!export CPATH=/usr/local/cuda/include:$CPATH

然后再安装pyg,问题得到解决。

致谢:

感谢码农家园的文章,在Google Colab上安装PyTorch Geometric | 码农家园

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