Python机器学习算法实现
Author:louwill
Machine Learning Lab
HMM(Hidden Markov Model)也就是隐马尔可夫模型,是一种由隐藏的马尔可夫链随机生成观测序列的过程,是另一种经典的概率图模型。本文在阐述HMM的基本定义和相关概念的基础上,引申出HMM的三个重要问题:估计算法、学习算法和预测算法问题,并给出相应的代码实现方式。
HMM是关于时序的概率模型,描述一个隐藏的马尔可夫链随机生成不可观测的状态随机序列,再由各个状态生成一个观测而产生随机序列的过程。其中隐藏的马尔可夫链随机生成的状态的序列称之为状态序列,每个状态产生的状态构成的序列,称之为观测序列。
HMM由初始状态概率向量 ,状态转移概率矩阵 和观测概率矩阵 决定,其中 和 决定状态序列, 决定观测序列。所以,HMM可以用一个三元符号来表示:
设 为所有可能的状态的集合, 是所有可能的观测的集合:
,
其中 是可能的状态数, 是可能的观测数。
是长度为 的状态序列, 是对应的观测序列。
,
作为状态转移矩阵,可表达为:
其中: , 是在时刻 处于状态 的条件下在时刻 转移到状态 的概率。
作为观测概率矩阵,可表达为:
其中: , 是在时刻 处于状态 条件下生成的观测 的概率。
文字和公式表述可能过于抽象,我们以一个具体的例子来看一下HMM。假设有4个盒子,每个盒子里面都要红白两种颜色的球,各个盒子里面的红白球颜色数量分布如下表所示。
摸球规则如下:首先从4个盒子里等概率的选择一个1个盒子,从这个盒子里随机摸一个球,记录颜色后放回。然后从当前盒子随机地转移到下一个盒子,转移规则如下:如果当前盒子为1,那么下一个盒子一定是2,如果当前盒子是2或者3,则分别以概率0.4和0.6转移到左边或者右边的盒子,如果当前的盒子是4,那么各以0.5的概率停留在4或者转移到3,确定了转移的盒子后,就从该盒子中随机摸取一个球记录其颜色并放回。将上述摸球试验独立重复进行5次,得到一个球的观测序列为:
红,红,白,白,红
我们按照HMM的三要素对该例子进行分析。在上述摸球过程中,我们只能观测到摸到的球的颜色,即可以观测到球的颜色序列;而观察不到球是从哪个盒子摸到的,即观测不到盒子的序列。所以,该例中状态序列即为盒子的序列,观测序列即为摸取到的球的颜色序列。具体如下所示。
状态序列: 盒子 ,盒子 ,盒子 ,盒子 ,
观测序列: 红,白 , ,状态序列和观测序列长度 ,初始概率分布 ,状态转移概率分布矩阵为:
观测概率矩阵为:
综上,我们可以归纳一个长度为 的观测序列 的生成过程如下:
按照初始状态分布 产生状态
令
按照状态 的观测概率分布 生成
按照状态 的状态转移概率分布 产生状态 ,
令 ;如果 ,跳转到第三步否则过程终止。
根据该例我们可编写一个HMM观测序列生成过程的代码如下。
跟CRF一样,HMM也有三个基本问题,分别是概率估计、学习问题和预测问题。
HMM的概率估计问题,即在给定模型 和观测序列 ,计算在模型 下观测序列 出现的概率 。
跟CRF一样,HMM的概率估计方法依然是前向-后向算法。先来看前向算法。HMM定义前向概率如下:给定HMM模型 ,定义到时刻 部分观测序列 且状态为 的概率为前向概率,记为:
可以看到前向概率是一个联合概率。通过该定义可以递推的计算前向概率 及观测序列概率 。在输入为HMM模型 ,观测序列 和输出为观测序列概率 的情形下,观测序列概率的前向算法表述如下:
初值: ,
递推:对 ,有,
终止:
下面给出前向概率算法的具体推导过程。根据前向概率的定义,可以推导初值为:
其中 表示有状态 生成的观测概率,假设在 时刻观测数据 ,则有:
且由前向概率定义可得:
根据上式,遍历 的取值求和,可得 的边际概率:
令 ,有:
上式推导中根据观测独立假设第一项可化简为:
第二项可根据齐次马尔可夫假设化简为:
假设已知 ,在前向概率的定义的基础上,有:
将前述化简结果带上上式,可得:
后向概率算法同理可推导。基于前向-后向概率我们可计算HMM的一些延申概率和期望,这里略过。
HMM的第二个关键问题就是学习问题。即已知观测序列 ,估计HMM模型 的参数,使得在该模型下观测序列概率$P(O|\lambda)最大。
当训练数据集同时包含观测序列和对应的状态序列时,我们可以直接使用极大似然估计来估计HMM的模型参数。但大多数情况下,训练数据仅有观测序列而未给出对应的状态序列,这时我们将观测序列看作观测数据 ,状态序列看作不可观测的隐数据 ,此时的HMM模型实际上一个含有隐变量的概率模型:
由第22讲我们知道含有隐变量的概率模型可以通过EM算法来进行迭代求解。应用EM算法求解HMM模型参数也叫Baum-Welch算法。基于Baum-Welch算法求解HMM模型参数过程如下:
确定完全数据的对数似然函数
将观测数据写为 ,隐数据写为 ,完全数据可以写为。完全数据的对数似然函数为 。
EM算法的E步:求 函数
其中 为HMM参数的当前估计值, 是要极大化的HMM参数。
EM算法的M步:极大化 函数 求模型参数 。
HMM的预测问题也就是解码问题。即再已知模型 和观测序列 的情况下,求对给定观测序列条件概率P(I|O)最大的状态序列 。即给定观测序列,求最有可能的对应的状态序列。
跟CRF预测算法一样,HMM的预测算法同样是一个求解最优路径问题,所以解码算法仍然是上一篇文章说到的维特比算法。关于维特比算法的通俗解释,参考上一篇CRF的讲解。基于维特比算法的HMM最优路径求解过程如下。
初始化: , ,
递推。对 :
,
终止:
最优路径回溯。对 :
完整的HMM需要实现的内容比较多。这里我们仅给出基于盒子摸球模型的HMM观测序列生成过程和维特比解码过程的参考实现方式。完整的算法笔者后续会在GitHub上给出。
基于4个盒子摸球的HMM模型的观测序列生成过程如下:
import numpy as np
# 根据给定的概率分布随机返回数据
def get_data_with_distribution(dist):
r = np.random.rand()
for i, p in enumerate(dist):
if r < p:
return i
r -= p
def generate(T):
'''
根据给定的参数生成观测序列
T: 指定要生成数据的数量
'''
# 根据初始概率分布生成第一个状态
z = get_data_with_distribution(pi)
# 生成第一个观测数据
x = get_data_with_distribution(B[z])
result = [x]
# 遍历生成余下的状态和观测数据
for _ in range(T-1):
z = get_data_with_distribution(A[z])
x = get_data_with_distribution(B[z])
result.append(x)
return result
### 盒子和球相关的模型参数
# 初始状态概率向量
pi = np.array([0.25, 0.25, 0.25, 0.25])
# 状态转移概率矩阵
A = np.array([
[0, 1, 0, 0],
[.4, 0, .6, 0],
[0, .4, 0, .6],
[0, 0, .5, .5]])
# 观测概率矩阵
B = np.array([
[0.5, 0.5],
[0.3, 0.7],
[0.6, 0.4],
[0.8, 0.2]])
# 生成10个数据
generate(10)
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0]
在已知模型参数和观测序列的情况下,基于维特比算法的解码反推最有可能的隐状态序列:
def viterbi_decode(X):
T, x = len(X), X[0]
# 初始化
delta = pi * B[:,x]
varphi = np.zeros((T, N), dtype=int)
path = [0] * T
# 递推
for i in range(1, T):
delta = delta.reshape(-1,1)
tmp = delta * A
varphi[i,:] = np.argmax(tmp, axis=0)
delta = np.max(tmp, axis=0) * B[:,X[i]]
# 终止
path[-1] = np.argmax(delta)
# 最优路径回溯
for i in range(T-1,0,-1):
path[i-1] = varphi[i,path[i]]
return path
X = [1,0,1,0,0]
N = 4
print(viterbi_decode(X))
[1, 0, 1, 2, 3]
参考资料:
李航 统计学习方法 第二版
https://zhuanlan.zhihu.com/p/85454896
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数学推导+纯Python实现机器学习算法28:CRF条件随机场
数学推导+纯Python实现机器学习算法27:EM算法
数学推导+纯Python实现机器学习算法26:随机森林
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