python医学图像读取_对python读取CT医学图像的实例详解

需要安装opencv和simpleitk。

simpleitk比较简单,直接pip install simpleitk即可。

代码如下:

#coding:utf-8

import simpleitk as sitk

import cv2

#lkds-00058,-102.655469971,108.188810974,438.759994507,12.2279986879

if __name__ == '__main__':

filename = "f:/cancer_solution/data/train_subset00/lkds-00058.mhd"

ds = sitk.readimage(filename)

img_array = sitk.getarrayfromimage(ds)

frame_num, width, height = img_array.shape

outpath = "f:/cancer_solution/out/train/lkds-00058"

index = -1

for img_item in img_array:

index = index + 1

cv2.imwrite("%s/%d.png"%(outpath,index),img_item)

print "done!"

如上所示,就将ct影像解析成了多个单幅图片。

python医学图像读取_对python读取CT医学图像的实例详解_第1张图片

python医学图像读取_对python读取CT医学图像的实例详解_第2张图片

目前还不太理解(x,y,z)坐标是如何对应的。

但祈世间人无病,何愁架上药生尘。癌症,终有一天可以被战胜。

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