合并 counts

使用 :jupyter notebook

用python 合并文件:

cd /mnt/g/

ls

import pandas as pd

df1 = pd.read_csv('AACC1.hairpin.bna.sam.sam.counts.csv', sep=',')#把文件改为csv格式

df2 = pd.read_csv('AACC2.hairpin.bna.sam.unique.sam.counts.csv', sep=',', names=['gene_name','AACC2'])

AACC12=pd.merge(df1,df2,how='outer')

df3=pd.read_csv('AACC3.hairpin.bna.sam.unique.sam.counts', sep=',', names=['gene_name','AACC3'])

AACC123 = pd.merge(AACC12,df3,how="outer")

。。。。。

以此类推,用最笨的方法,合并。

导出 

df.to_csv('D:\data\out1.csv')

导出失败。

不知道哪里除了问题。

另:pandas 处理数据参看链接:https://www.jianshu.com/p/e1b41bbd8c65

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