AutoDock Vina批量分子对接|Linux系统+Windows系统|R语言+Bash+Python|22.6.17更新

本文是关于一个受体与多个配体的分子对接批处理。
由于作者本人也是赶鸭子上架，写出来的脚本比较简单，请见谅。
此外，由于对某个语言某个包的喜爱与使用，作者用到的编程工具比较杂，但是可以作为思路参考。当然，如果您具备条件，也可以选择复刻，本文章的代码都被跑过，请根据自己需要修改参数（内含中文不能直接跑）与编程。

作者：Squirrelity（CSDN)

一、获取受体

WIndows 系统

从 https://www.rcsb.org/ 获取需要用到的蛋白，从Chimera/Pymol经处理后保存到文件夹receptor，命名为receptor.pdbqt

具体可见我之前的文章中第四步对接蛋白准备：https://blog.csdn.net/Squirrelity/article/details/124839353?spm=1001.2014.3001.5502

二、获取配体

WIndows 系统

此处需要批量获取分子信息，选用的网站上pubchem。所用到的编程语言是python。
首先是获取一份药物分子名称（