运行FastQC报错

近期使用RNA-seq，在NCBI上获取原始数据后，想使用fastqc检查二代测序数据是否存在问题。
于官网下载fastqc的软件包，并解压至Biosofts文件夹。
运行

fastqc -h 

报错，显示无此命令。
起初认为没有配置环境变量，但配置完成后依旧报错。
通过网络查其原因是解压后的FastQC文件夹里虽然存在fastqc文件，但是使用ls -lh 代码发现该文件并无执行权限。
解决办法如下：
在fastqc文件所在目录下运行下列代码

sudo chmod 777 fastqc

再次运行依旧报错
报错信息如下：

Approx 95% complete for output.fastq
Analysis complete for output.fastq
Failed to process file output.fastq
java.lang.IllegalArgumentException: No key called gc_sequence:ignore in the config data
    at uk.ac.babraham.FastQC.Modules.ModuleConfig.getParam(ModuleConfig.java:148)
    at uk.ac.babraham.FastQC.Modules.PerSequenceGCContent.ignoreInReport(PerSequenceGCContent.java:57)
    at uk.ac.babraham.FastQC.Report.HTMLReportArchive.startDocument(HTMLReportArchive.java:331)
    at uk.ac.babraham.FastQC.Report.HTMLReportArchive.(HTMLReportArchive.java:84)
    at uk.ac.babraham.FastQC.Analysis.OfflineRunner.analysisComplete(OfflineRunner.java:155)
    at uk.ac.babraham.FastQC.Analysis.AnalysisRunner.run(AnalysisRunner.java:110)
    at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

询问得知虽然我从官网上下载了fastqc软件包解压后，并且修改文件可执行权限，但是由于我曾经用过apt安装系统自带的fastqc，但是系统自带的fastqc是存在bug的，上述情况就是运行系统自带的fastqc是出现的bug
解决这样的问题，我们要先把系统自带的fastqc卸载掉

sudo apt remove fastqc

再将下载的fastqc配置环境变量

echo 'export PATH=~/Biosofts/FastQC:/$PATH'>>~/.bashrc
source ~/.bashrc

再次运行没有报错
问题解决了！