wolai | 用wolai+Zotero搭建文献管理

来源:我的文献管理截图


最近一直在分享wolai,陆续分享了我用wolai做的读书管理、晨间日记、动漫屋、人脉管理的模板。

没看过的可以去回顾一下~

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作为一个科研狗,这次终于轮到分享科研中的文献管理了。

先说说我在文献管理中遇到的问题:

我之前折腾过的文献管理软件有endnote,Zotero,mendeley,citavi,noteexpress。

endnote是老牌文献管理软件了,基本上用的人偏多,很多学校购买的也都是endnote的版权,但是endnote使用起来有诸多不便,没有好用的文献抓取插件,导入就很麻烦,笔记功能比较弱,有些臃肿;优点是有自带的阅读器,界面还好吧。

Zotero今年出了自带阅读器,虽然还是beta版,但是已经不错了,在浏览器中搜索时,有插件可以直接抓取文献到客户端,轻便,反应速度快。Zotero因为是开源软件,所以有各路大神做了很多附加功能,可以搭建的空间比较大。

mendeley当初没有深度使用过,不过它也有内置阅读器,也有抓取文献的插件(其实不太能称之为插件,和其它浏览器插件性质不太一样)。

citavi堪称瑞士军刀,讲真,至今都觉得citavi基本完成了文献管理的全流程,但是也有很多槽点,响应慢,肉眼可见的慢,臃肿笨重,本来是想好好捣鼓一下citavi,作为长期使用的一款文献管理软件,结果后来莫名其妙出了一个bug,我没解决掉,加上一直使用endnote比较多,后来干脆卸载了citavi。。。

noteexpress因为是国产文献管理软件,对中文文献比较友好,优点是可以显示影响因子,这个功能是其他软件没有的。不过我实在是个颜狗,endnote和noteexpress对比,我还是喜欢endnote的界面,所以最终也没有深度使用noteexpress。

因为有些我没有深度使用,所以以上各个软件优缺点仅供参考。

总结一下,以上软件的笔记功能都很弱,没办法在软件内随意进行引用和双链。

所以,考虑利用wolai的双向链接+数据表格搭建一个文献管理。

需要说明一下,因为wolai是知识管理软件,并没有文献抓取和管理功能,所以需要和其他软件搭配使用,这里介绍的是wolai和Zotero的搭配使用,因为Zotero抓取确实很爽!加上今年出的阅读器,目前算是比较喜欢的一款了。

先来分享一下我的文献管理模板。

依旧采用了数据表格形式,字段包含year,author,title,journal,IF(影响因子),state(阅读状态),note(备注),link,corresponding author,field(相当于领域或者关键词),rating,doi,type(document/review)

如果文献管理软件里的文献量不是超级大的话,基本上用year+author就能快速定位到文献,我每次在软件里找文献也是利用这两个字段。

所以和文献管理软件中一样,我把year和author放在了开头,title是第三列。

用模板中的文献举例:

2021年sadler发表的Transient receptor potential canonical 5 mediates inflammatory mechanical and spontaneous pain in mice

journal:science translantional medicine

IF:17.956  所以我直接设置了15-20的区间

state:表示阅读状态,done读完,reading在读,to read待读

corresponding author:一般文献都比较注重通讯作者是谁,所以加了这个字段

field:所属领域或者关键词,比如这篇文献属于pain

rating:这个是自己对于这篇文献重要程度的评价,一星到五星

type:分document和review。我基本只读这两类文献,所以只区分了这个,如果是读RCT和Meta-Analysis之类的比较多,可以直接采用pubmed里的分类:

我目前想到的是这些,可以根据自己的习惯增删或者拖动调整位置,比如:如果比较关注通讯作者,就把corresponding author往左边再拖一拖

点击title后,可以看到该篇文献的笔记。

思考里面包含了三个问题:

主要讲了什么?对我有什么用?创新之处?

这个仅供参考,可以自己修改。

further reading:辐射阅读/延伸阅读,就是看完这篇文献,需要看哪些相关文献,可以列到这里,或者和已有笔记进行双链

其余就是文献的部分了,顺序分别是abstract,introduction,results,discussion,methods,academic phrasebank,references

因为我读文献基本是这个顺序,先大概看摘要和introduction,然后就是results,其实比较关注的就是这些,其余都是补充信息了。

academic phrasebank是语料库,可以积累该篇文献的金句/范句。

考虑到results可能有小标题,所以以上几个我都全部采用了大标题,嫌字号太大的可以改成中标题。

以上就是我的文献管理模板了,一篇笔记做完之后,可以复制链接,在Zotero中选中该篇文献,点击右键,添加附件,附加url的链接,然后就把wolai 的文献笔记和Zotero里的文献进行了关联。

点击Zotero里的笔记链接,会在浏览器中打开wolai的笔记,如果习惯使用的是wolai网页版,那么这个关联也相当不错了。(不过我习惯用wolai客户端,哈哈哈)

因为数据表格也刚出一个月,各项模板都还在优化中,所以我目前文献管理还没有用wolai做,不过之前写关于睡眠的文章时,都是在wolai里整理的。

wolai没有类似于Wikipedia的尾注功能,如果有的话,简直都可以直接在wolai里写论文了。

wolai+Zotero搭建文献管理的好处:

有双链,从上面那个截图可以看出,一旦积累出多篇文献笔记,好处就会显现出来,这使得同主题多篇文献的关联相当方便,比如我可以很方便的看出哪些笔记里包含了“社交时差”;同时,还可以在wolai中搭建科研管理系统,如果文献管理也在wolai中做,那么就可以和实验的笔记结合起来,这是比较爽的!

有数据表格,对于文献状态,评价等管理起来都比较方便,可以建立起读文献的工作流

缺点:以上这套文献管理采用了两款软件,还是比较割裂,很多笔记需要旁边有图,有可能笔记工作量会比较大。

各有优缺点,不可能有完美的软件,所以还是需要根据需求搭建出适合自己的,以上仅供参考啦。

wolai模板中心里也有两个文献笔记模板,可以参考一下~

点击下方链接,可以直接把我的文献管理模板复制到自己的wolai里,喜欢的可以拿去试试~

https://www.wolai.com/kGZ7JoEjfU9sS8yJwyhG1J

真的好希望有一款双向链接+数据表格的文献管理软件横空出世!

哎,我也就只能做梦想想。。。

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