易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。

近些年以来,DNA甲基化研究一直是顶级期刊、基金资助、临床研究、药物研发上市的多重热点,其研究方向涵盖疾病发生发展、疾病标志物研究、环境因素暴露与响应、发育和分化等多维度。

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第1张图片

研究人员为DNA甲基化课题申请作准备以及为降低DNA甲基化实验风险,通常会进行DNA甲基化研究的前期探索性实验,主要包括:

检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达

检测整体DNA甲基化水平变化

其他前期实验

一、检测DNA甲基化酶和去甲基化酶的表达

方法包括:

RT-qPCR检测mRNA表达

Western blot检测蛋白质翻译

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第2张图片

e.g. 高脂饮食组和肥胖人群中均观察到DNMT的RNA和蛋白质表达上调

二、检测整体DNA甲基化水平变化

方法包括:

5mC甲基化免疫荧光染色(定性)

DNA斑点杂交(定性)

比色法(定量)

质谱法(定量)

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第3张图片

斑点杂交(Dot blot)

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第4张图片

免疫荧光显微观察

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第5张图片

比色法/质谱法

三、其他前期实验

在没有条件开展甲基化相关前期实验的情况下,也可以开展其他预实验。包括:

关键表型指标测定

转录组(成本低廉)

在进行前期探索性实验后,DNA甲基化的研究思路与项目设计还包括:技术选择、数据挖掘、下游验证。

技术选择:

DNA甲基化检测技术有哪些?

如何根据现有的实验条件选择最合适的技术开始课题研究?

>>> 推荐阅读:8种常用DNA甲基化测序技术,你知道几个?

数据挖掘:

理解每一步分析目的和依据

筛选目标基因

>>> 推荐阅读:干货分享:DNA甲基化研究的测序数据挖掘思路

下游验证:

如何开展测序数据的验证实验

高分突破:打通机制研究思路

>>> 推荐阅读:高通量测序后的下游实验验证方法--DNA甲基化篇

以上就是关于DNA甲基化研究的前期探索性实验及研究思路分享,易基因科技提供全面的DNA甲基化研究整体解决方案,技术详情了解请致电易基因。

易基因:DNA甲基化研究的3大前期探索性实验思路|干货系列_第6张图片

相关阅读:

易基因2022年度DNA甲基化研究高分项目文章精选

一文读懂:十大DNA甲基化研究核心问题

经验分享:DNA甲基化与多组学研究思路及科研论文写作

DNA甲基化方法全解析:方法发展、技术应用、优缺点

你可能感兴趣的:(生物信息学,数据挖掘,生物学,人工智能)