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目录
1.研究背景
2.研究问题
3.分析思路
4.研究过程
4.1单变量分析
4.2关联强度探索
4.3对数转换分析
4.4 激素水平的方差分析
4.5 秩变换分析
4.6Cox回归分析
5.总结
文末福利
在某个消化内科的科研项目中,研究者认为某种激素水平可能 会对胃癌的发生有一定的作用,因此设计了此项研究,将病人按照临床病理诊断结果分为对照组和试验组(出现病变组)两组,并采集了如下指标:
此外,对于试验组,还进行了如下实验室检查:
在控制了其他因素的作用之后,激素水平是否的确在两组间存在差异
本例是一个比较典型的要求控制其余影响因素下的两组数据比较。 因此从基本思路上应当属于影响因素发现与确认的范畴,绝大多数 情况下,此类问题的分析流程如下:
1.在数据理解的基础上,先进行单个因素对因变量的影响大小分析,对可能需要控制的其他影响因素进行筛选。
2.根据单因素分析的结果,尝试构建多因素模型,从而在控制其余影响因素的同时,得到分组变量是否对因变量有影响的结论。
分类变量:做频数分析
操作步骤:
①【分析】-->【描述统计】-->【频率】
② 选择变量,点击确定
③ 结果如下:
连续变量:做描述统计
操作步骤:
①【分析】-->【描述统计】-->【描述】
②选择变量,点击确定
③结果如下:
绘制激素水平的直方图
操作步骤:
①【图形】-->【旧对话框】-->【直方图】
②选择变量,点击确定
③结果如下:
可以看到激素水平确实是偏态的。大多数值低于4.0, 4.0~10之间到底有没有值。可以查看数据,对数据进行排序。
右键jisu列,选择【降序排序】
可以发现激素数据最大值为10.10,次大数3.2。有一个远远偏离数据的极大值。这个极大值能不能删掉?取决于该数据是否为测量错误,如果发现是测量错误就删掉,如果测量数据所得正确,就不能删除。因为它就代表了整个群体中的一部分情况,本例中不删除。
关联强度探索指:对每个自变量和因变量做相关性分析。因变量是激素水平,通过前 面的分析发现激素水平数据不是正态分布的,假如我们做试验组和对照组两个分组变量与激素水平的分析,我们应该选择两样本T检验,但T检验分析中比较的是均值,对于偏态分布数据,均值没有代表性,应该比较中位数,稳妥起见我们选择非参数检验方法进行分析。
操作步骤:
①【分析】-->【非参数检验】-->【独立样本】
②选择【在各个组之间比较中位数】
③ 点击字段,选择检验字段、组别
④点击设置,选择曼-惠特尼U,点击运行
⑤结果如下:
拒绝了原假设,说明试验组和对照组的激素水平的中位数和分布都不相同。
很多时候变量的分布并不是人们期望的正态分布(或者接近正态分布),因此,一些数据分布的变换技术被引入。对数转换是常用的一种变换方式,例如本项目的激素水平数据是偏态分布。不能直接做分析,先将数据做对数转换。
操作步骤:
①【转换】-->【计算变量】
②选择目标变量, 编写数学表达式
可以发现,源数据中多了一个名为“对数激素水平”的变量
③【图形】-->【图表构建器】
④ 拖拽元素
⑤结果如下:
⑥选择堆积直方图
⑦结果如下:
查看年龄与对数转换激素水平变量的相关性
操作步骤:
①【分析】-->【相关】-->【双变量】
②选择变量
③ 结果如下:
相关性中可以看到sig的值0.997,说明分析中年龄和激素水平没有关系,可以不考虑年龄变量。
操作步骤:
①【分析】-->【一般线性模型】-->【单变量】
②选择因变量和固定因子
③结果如下:
从显著性可以看到分组是有统计学意义的;性别是没有统计学意义的;分组和性别的交互作用有统计学意义。这说明男性和女性患者,他们的激素水平在试验组和对照组是不一样的。
秩变换分析介绍
秩变换分析是一种非参数检验,把不符合正态分布的变量取它的秩次代替原来变量,再计算检验统计量进行分析。
“秩”的概念:
秩,简单说就是变量值排序的名次。可以将数据按升序排列,每个变量值都会有一个在整个变量值序列中的名次,这个名次就是变量值的秩。变量值有几个,对应的秩便有几个。
操作步骤:
①【转换】-->【个案排秩】
② 选择变量
③点击【确定】,在数据视图中可以看到秩次变量
④【分析】-->【一般线性模型】-->【单变量】
⑤选择因变量和固定因子
⑥ 点击【确定】,查看分析结果
在主体间效应检验中可以看到,修正模型显著性小于0.05,说明总体而言模型中有一些影响因素确实存在的,组别显著性小于0.05有统计学意义。年龄分组、组别和年龄分组的交互作用没有 统计学意义,所以,年龄变量可以剔除,不必参加分析。
从主体间效应检验中可以看到,组别有统计学意义;性别没有统计学意义,但是组别和性别的交互作用有统计学意义。
Cox回归介绍
从分析的因素上看,有单因素分析和多因素分析。生存分析对应的多因素模型则常用Cox回归模型。
Cox回归又称为比例风险模型,能够同时考虑多个自变量对生存时间分布的影响。探讨到底哪类群体的“死亡”速度更快、到底什么因素影响了“死亡”速度。
Cox模型是针对生存时间和生存状态来建模,生存时间数据一般都是一个偏长尾的正偏态的分布。而我们的因变量激素水平数据分布正好是偏长尾的正偏态分布。将因变量取值看作“生存时间”。 定所有观测均在该时点出现结局事件,然后对其影响因素做生存数据的建模。 因为Cox模型是针对生存时间和生存状态来建模的,现在将因变 量激素水平变量看作“生存时间”,每个观测均在该点要出现结局事件。因此要创建一个生存状态变量。
操作步骤:
①【转换】-->【计算变量】
②选择目标变量
③【分析】-->【生存分析】-->【Cox回归】
④选择时间、状态
⑤定义分类协变量
⑥点击【确定】,在输出窗口查看输出结果
从分类变量编码可以看到,试验组参照编码为1,对照组参照编码为0。以"最后一个"分类为参照变量。也就是拿试验组和对照组相比;男性和女性进行相比。
在模型系数检验中显著性小于0.05,说明变量具有统计学意义。
在方程中的变量可以看到。组别显著性小于0.05是有统计学意义的。性别和年龄显著性大于0.05没有统计学意义。在变量编码中知道组别是试验组和对照组进行相比。系数B值0.82,表明试验组和对照组相比,死亡系数偏高的。Exp(B)等于2.274表明试验组相比对 照组在任何时间点,死亡风险都是对照组的2.274倍。这时候我们就很难对应起来,究竟是说试验组的激素水平高还是对照组高,Cox 模型应用到这个领域很不直观。那Cox模型的价值在哪?它主要可以快速的筛选变量,筛选出哪些变量有统计学意义,哪些变量没有统计学意义。Cox模型主要应用是分析灯泡寿命、轮胎使用寿命。 在经济领域的使用,比如财务收入,税后的收入。
在本项目中,由于统计描述时发现因变量呈现偏态分布,因此分 别采用变量变换、秩变换和Cox模型进行了建模分析。结论一致如下:
- 性别、年龄对激素水平未发现有影响,其中后者无论是原始年龄,还是年龄分组均无统计学意义。
- 试验组和对照组之间的激素水平存在差异。
- 性别虽然对激素水平没有影响,但是发现组别和性别的交互性对激素水平有影响。可以做进一步分析。
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