在Mac 和windows上用 Aspera Connect下载NCBI Sra数据

做生信分析在NCBI上下数据是第一步，不一定非要用linux下，装好sratools和Aspera Connect和都没问题。
在这里NCBI SRA Toolkit找属于你版本的sratools吧。
在这里Aspera Connect找属于你版本的的ascp客户端
如果下载太慢，可以私信我，我给你网盘链接。

用sratools的prefetch 命令是最快的。
基本用法都是

需要告诉prefetch，ascp的程序在哪里，私钥在哪里，要下的清单是什么，下好的文件放那里
prefetch -t ascp -a "path/to/ascp|path/to/asperaweb_id_dsa.openssh"  --option-file /path/to/SRR_Acc_List.txt -O /path/to/opt

例如，我的Windows系统，我的sratools，放在I盘 ，我直接用CMD，转到 prefetch所在的目录下

#程序路径
C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp 
#私钥路径
C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\etc\asperaweb_id_dsa.openssh
#文件清单
I:\sratoolkit.2.9.4-2-win64\sra\SRR_Acc_List.txt
#储存位置
I:\sratoolkit.2.9.4-2-win64\opt
这样命令就如下：
prefetch.exe -t ascp -a "C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\bin\ascp|C:\Users\Administrator\AppData\Local\Programs\Aspera\Aspera Connect\etc\asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file I:\sratoolkit.2.9.4-2-win64\sra\SRR_Acc_List.txt -O I:\sratoolkit.2.9.4-2-win64\opt

Mac下面也一样，安装的位置有一些差异。首先安装好sratools，和 Aspera Connect。

#程序与私钥路径
~/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/ascp/Contents/Resources/
#文件清单
/path/to/SraAccList.txt 
#储存位置
 /path/to/opt
prefetch -t ascp -a "~/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/ascp/Contents/Resources/ascp|~/Applications/Aspera Connect.app/Contents/Resources/asperaweb_id_dsa.openssh" --option-file /path/to/SraAccList.txt -O  /path/to/opt

另外，sratools近期升级，会导致以上命令失效，装 2.9.6吧。